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IB驱动自带的OpenMPI 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上运行IB驱动自带的MPI应用(3.1.0rc2版本)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装IB驱动自带的OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。
操作场景 本节指导用户在BMS上安装和使用社区OpenMPI(以3.1.1版本为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装HPC-X工具套件。 使用社区OpenMPI时,需要同时使用Mellanox的HPC-X 套件,适用于CentOS
个连续字符的部分。 YNbUwp!dUc9MClnv 说明: 样例密码随机生成,请勿复制使用样例。 系统不会定期自动修改弹性云服务器密码。为安全起见,建议您定期修改密码。 设置集群名称。 名称可自定义,但需符合命名规则。集群名称命名规则如表3所示。 表3 集群名称命名规则 参数 规则
社区OpenMPI 操作场景 本节指导用户安装和使用社区OpenMPI(以3.1.1版本的OpenMPI为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装HPC-X工具套件。 下载需要的HPC-X工具套件以及OpenMPI。 使用社区OpenMPI时,需要同时使用Mellanox的HPC-X
在HPC集群上运行IB驱动自带的OpenMPI 操作场景 该任务指导用户在已配置好的弹性云服务器上,运行IB驱动自带的MPI应用(3.0.0rc6版本)。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。 操作步骤 使
0rc6为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 检查是否已安装IB驱动。 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。 执行以下命令,切换为root 用户。 $ sudo su 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令,查询是否已安装IB驱动。
在HPC集群上运行社区OpenMPI 操作场景 该任务指导用户在已配置好的弹性云服务器上,运行社区MPI应用(3.1.1版本)。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。 操作步骤 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。
裸金属服务器场景典型应用 2017-12-15 第三次正式发布。 修改 创建支持IB网卡的弹性云服务器 2017-09-30 第二次正式发布。 增加 IPoIB功能简介 Intel MPI 在HPC集群上运行Intel MPI 配置ECS集群互相免密登录 修改 配置单个ECS免密登录 2017-07-11
它提供了基于RDMA之上的IP网络模拟层,允许应用无修改的运行在InfiniBand网络上。但是,IPoIB性能比RDMA通信方式性能要低,大多数应用都会采用RDMA方式获取高带宽低延时的收益,少数的关键应用会采用IPoIB方式通信。 无修改:指运行在IP协议上的应用不需要作任何修改,即可适配IB网络运行。
Intel MPI 操作场景 本节指导用户在ECS上安装和使用Intel MPI应用(以版本l_mpi_2018.0.128为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装Intel MPI。 下载Intel MPI。 下载地址:https://software.intel
创建HPC私有镜像 前提条件 创建镜像需选择ECS系统盘镜像。 需修改镜像属性才能在ECS创建界面的C6h规格中选择到相应的镜像。 镜像获取 请联系技术支持进行操作。 创建系统盘镜像 请使用镜像文件创建系统盘镜像,需注意镜像用途选择ECS系统盘镜像如图1,选择启动方式为UEFI图2,否则系统无法启动。
本节指导用户在BMS集群上安装和使用Intel MPI应用(以版本l_mpi_2018.0.128为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装Intel MPI。 下载Intel MPI。 下载地址:https://software.intel
本节指导用户在鲲鹏BMS集群上安装和使用MPICH应用(以版本mpich-3.3.2为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装MPICH。 下载MPICH。 下载地址:https://aur.archlinux.org/packages/mpich/
操作场景 本节指导用户在BMS上安装和使用社区OpenMPI(以4.0.2版本为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装OpenMPI。 下载社区OpenMPI,版本号为“openmpi-4.0.2.tar.bz2”。
/usr/mpi/gcc/openmpi-3.1.0rc2/bin/mpirun $ rpm -qa | grep mlnx-ofa 图1 确认已安装IB驱动 查看回显结果。 如果回显如图1所示,表示已安装IB驱动,执行3。 如果未安装IB驱动,执行2。 安装IB驱动。 下载安装包“MLNX_OFED_LINUX-4
本节操作指导用户在BMS上安装和使用IB驱动自带的Open MPI(以版本4.0.2a1为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 查询是否安装了IB驱动 执行以下命令,查询是否已成功安装IB驱动。 $ ls /usr/mpi/gcc/openmpi-4
lammps-2Aug18/src vi MAKE/Makefile.mpi 根据图1、图2,修改红框标识中的内容。其中,版本号需根据实际情况进行填写。 只修改图1、图2中红框标识的内容。 图1 修改Makefile文件01 图2 修改Makefile文件02 执行以下命令,编译lammps,并将当前目录
LDFLAGS="-L/usr/lib64" CPPFLAGS="-I/usr/include" make make install Udapl配置修改 在/etc/dat.conf首行(放在末尾运行STAR-CCM+会有异常)加入如下配置。 ofa-v2-cma-roe-enp177s0
4T-inletsystem-blockqian-case2.sim:算例文件。 运行参数调优下的STAR-CCM+ 端口范围修改 如果不修改,STAR-CCM+可能运行不起来。 执行以下命令修改。 sysctl -w net.ipv4.ip_local_port_range=”20000 65535”
在HPC集群上运行Spectrum MPI 操作场景 该任务指导用户在已配置好的弹性云服务器上,运行Spectrum MPI应用(IBM Spectrum MPI v10.1)。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。