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com -o get-docker.sh sh get-docker.sh 检查安装结果。 执行docker --version命令，如果显示如下类似信息，表示Docker安装成功。 图1 Docker安装成功 步骤2：制作镜像 方法1：直接下载官方的FastQC镜像。 执行如下命令下载FastQC镜像。
出来的流程，命令行工具中通过指定不同应用间的输入输出关系，完成应用的连接。您可以基于获取到的模板使用命令行工具创建流程，创建好的流程将同步显示到EIHealth平台。 获取流程模板 使用health get workflow -s命令获取创建流程的模板，复制模板并保存到本地，您可以保存成
单击界面右侧“订阅”图标，订阅资产。 图1 订阅资产 订阅的资产将显示在您的项目中。对于不使用的资产，您可以通过“删除”操作，取消资产订阅。 订阅的流程、应用类资产，将显示在“项目管理 > 工具”页面的列表中，以“[资产市场]”进行标记。 订阅的镜像类资产，将显示在“项目管理 > 镜像”页面的列表中，以“[资产市场]”进行标记。
com -o get-docker.sh sh get-docker.sh 检查安装结果。 执行docker --version命令，如果显示如下类似信息，表示Docker安装成功。 图1 Docker安装成功 步骤2：制作镜像 方法1：直接下载官方的FastQC镜像。 执行如下命令下载FastQC镜像。
详细的命令介绍请参见“命令行工具 > 镜像管理命令”章节。 单击“镜像”，在镜像列表中查看已上传的镜像。 图1 镜像列表 【可选】单击“镜像类型”，对上传的镜像进行分类。 上传镜像时如果上传命令中未指定镜像类型，新上传的镜像默认显示为“OTHER”，您可以将镜像标记为“APP”或“NOTEBOOK”。
是否集成开发环境 has_drug Boolean 是否部署药物虚拟筛选 has_encryption_button Boolean 是否显示加密按钮 deploy_mode String 医疗智能体部署模式 enable_cold_archive Boolean 是否支持归档类型存储
单击“添加”，添加成员。 图1 添加成员 输入已添加至平台的用户的全称。 图2 输入用户名全称 单击“添加”，设置用户角色。详细成员角色介绍请参见表1。 图3 设置成员角色 单击“确认”，将用户添加至项目中。 方法二 在项目列表中，单击“操作”列“分享”。 图4 分享项目 输入已添加至平台的用户的全称。
和DESC，默认DESC，只有在--data参数使用时才生效。 --columns -c 否 当某个数据库实例列数非常多时，查看数据时会由于机器显示界面限制导致换行难以查看，添加此参数可以只显示想要查看数据的列名，多个列名用分号隔开(;)，只有在--data参数使用时才生效。 --project 无 否 指定
output_dir: # 流程的当前工作目录，默认为根目录，用户可显示指定，必须以/开头，结尾不能有/。 tasks: #
NotebookToolDto objects tool详情列表 表4 NotebookToolDto 参数 参数类型 描述 display_name String 显示名称 profile String 系统镜像名 枚举值： PY3 请求示例 获取notebook工作环境 https://eihealth
最大值：5000 缺省值：0 alerts 否 String 高亮子结构编号。 最小长度：0 最大长度：5000 ncols 否 Integer 显示的列数。 最小值：0 最大值：100000 缺省值：0 bgopacity 否 Float 背景透明度。 最小值：0 最大值：1 缺省值：0
除。 图1 数据保护策略 数据审计 平台通过云审计服务（CTS）提供操作记录的收集、存储和查询，审计操作可以设置导出用户的写操作（默认）和读操作（可选），保存周期可以设置需要保存的审计日志的保存周期，下载按钮可以下载最近7天内最新的1万条数据审计日志，查看按钮可以查看及下载保存的审计日志。
流程ID，指定后获取流程ID对应的流程详情。不指定时，获取的是流程列表。 --param-file -p 否 参数文件保存路径，以yaml格式保存。如果没指定，则不会显示和保存参数信息。 命令示例 health nextflow get workflow 550e8400-e29b-41d4-a716-446655440000
分析流程通过流程设计器创建，创建好的流程将存储于项目中。同时，您也可以通过“导入流程”的方法，将隶属于其他项目的流程导入至自己的项目中。 创建好的流程显示在流程列表中，您可以基于这些流程创建分析作业。 详细的流程创建和运行请参见新建流程。 父主题： 用户指南（基因平台）
在成员管理页面可以添加或者移除访问该项目的成员。 图3 成员管理 数据审计 平台通过云审计服务（CTS）提供操作记录的收集、存储和查询，审计操作可以设置导出用户的读操作和写操作（默认）和仅写操作（可选），保存周期可以设置需要保存的审计日志的保存周期，下载按钮可以下载最近7天内最新的1万条数据审计日志，查看按钮可以查看及下载保存的审计日志。
步骤3：启动作业 在流程页面，单击“启动作业”按钮，根据实际情况填写作业名称等信息。 图5 启动作业 图6 设置作业名称 作业设置完成后，会显示流程中的各个应用信息，再此可以指定实际的运行参数。 图7 NGS流程 单击图标，可设置数据来源，可以指定File或者Directory类型
gatk-mergevcfs、discvrseq-variantqc连线关系 搭建好的流程如下图所示。单击流程设计器上方保存按钮，保存流程。创建好的NGS将显示在“项目管理 > 工具”页签中。 图8 NGS流程 父主题： 基于二代测序的基因组突变检测
配体支持SDF、MOL2、PDB、 SMI格式文件，SMILES最多512字符，不能有中文或者空格，重原子不能超过200，配体分子需合法。 配体列表可显示总条数，但最多展示1000个小分子，对接时使用全量小分子。配体来源包含：数据中心、示例数据、公共库。且公共库预置了分子数据库，包含了陶术数
下载命令行工具 使用win键+R，输入cmd打开windows的cmd窗口。进入工具所在的目录，输入health命令，即可使用。 如果cmd窗口显示目录不是health文件所在目录，请使用cd命令切换路径。例如，切换至D盘： cd /d d: 图2 客户端 本示例中以Linux系统为例，介绍安装命令行工具的方法。
OBSFS:obsfs-buckt-name:/path1/ # 返回结果如下 reference data successfully! 执行上述三个命令成功后，项目根目录层级显示如下： ├─lmx-test-project # 本项目名称 │ ├─path1 │ ├─path2
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