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取消或强制停止作业调度 - 医疗智能体 EIHealth
/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/jobs/{job_id}/terminate 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单
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批量取消作业 - 医疗智能体 EIHealth
/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/jobs/batch-terminate 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1
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自定义数据库 - 医疗智能体 EIHealth
创建失败:数据库创建失败。 创建中:数据库正在创建。 追加中:数据库正在追加,此时数据库可以正常使用,搜索的数据库是正在追加过程的数据库。 异常:数据库异常,可能是由于CSS到期、CSS密码改变、CSS资源解绑等问题导致数据库异常。 图2 删除数据库和追加数据 可以通过“追加数据”到数据库来增加数据条数。每次追加最多追加500万条数据。
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获取数据作业 - 医疗智能体 EIHealth
获取数据作业 使用get命令获取数据作业列表、数据作业详情、数据作业执行日志或者下载数据作业执行日志。 命令结构 health get data-job <data-job-id> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 data-job-id 无 否 数据作
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分子对接 - 医疗智能体 EIHealth
选。 单击“分子对接”功能卡片,进入分子对接受体预处理页面,单击上传受体文件,进行受体蛋白预处理配置。 受体文件仅支持PDB格式,若文件中存在多个受体,默认只处理第一个。受体文件支持上传1个或者多个文件,最多支持输入20个受体文件,文件来源包含数据中心、PDB库、示例数据。 图1
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使用Docking Summary流程 - 医疗智能体 EIHealth
参数填写无误后,单击界面上方“启动作业”,运行作业。 步骤4:查看执行结果 在“项目管理”页面选择“作业”页签,单击创建的Docking Summary作业名称,进入详情页,查看执行结果。 图2 执行结果 作业运行完成后,单击应用进度条中的“输出参数”,可跳转至数据所在路径,获取运行结果数据。 父主题:
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命令行工具概述 - 医疗智能体 EIHealth
clear命令定时清除本地配置文件。 对于执行的历史命令,可通过以下方法清除。 Linux:执行history -c命令清除历史记录,重新登录命令行工具后,记录可恢复。执行rm -f $HOME/.bash_history命令,可删除记录文件,清空历史。 macOS系统:执行ps -p $$命令检查shell类型。
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工具管理简介 - 医疗智能体 EIHealth
查看应用详情、版本、创建者、修改和创建时间,可以对名称、创建者、修改时间、创建时间、源项目进行排序。并可执行查询、修改和删除应用的操作。 图1 应用列表 流程包含分析过程中所需应用的执行信息和数据的输入、输出等参数定义。流程通过流程设计器创建,创建好的流程将存储于“项目管理”页面
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创建项目 - 医疗智能体 EIHealth
和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 执行如下命令,创建项目。 health create project demo-project -d description -t 'tag1;tag2;tag3' -p 0101 # 执行成功返回结果如下 create project
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靶点口袋分子设计 - 医疗智能体 EIHealth
划线“-”和空格;首位只能以数字或字母开头。 标签:设置任务标签。 功能调用消耗:运行成功后功能会消耗一次。 单击“提交”。 提交成功后,可以在“作业中心”查看执行结果。 查看运行结果。 作业执行完毕后,单击作业名称,可进入输出结果页面。序号为0的分子为原始分子,在从头生成设计模式下不存在序号为0的分子。
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制作Docker镜像 - 医疗智能体 EIHealth
境中运行,直到遇到下一个FROM指令。通过添加多个FROM命令,可以在同一个Dockerefile文件中创建多个镜像。 MAINTAINER 声明创建镜像的作者信息:用户名、邮箱,非必须参数。 RUN 用来修改镜像的命令,常用来安装库、程序以及配置程序。一条RUN指令执行完毕后,
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新建流程 - 医疗智能体 EIHealth
将左侧应用列表中的应用,拖拽至画布中。对于由多个应用构成的流程,通过连接线指定输入、输出关系进行链接。 鼠标移动至应用中,会出现一个“空心圆”,拖动“空心圆”,将连接线挪动到目标应用上。 图4 搭建流程 只有当应用的输入、输出参数类型相同时,才可以进行连接。例如,将app1和app2链接
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导入应用 - 医疗智能体 EIHealth
参数类型 描述 destination_app_name 是 String 目标应用名称 取值范围:长度为[1,56],以大小写字母开头,允许出现中划线(-)、下划线(_)、小写字母和数字,且必须以大小写字母或数字结尾。 最小长度:1 最大长度:56 destination_app_version
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更新项目 - 医疗智能体 EIHealth
description --tags 'a;b;c' # 执行成功返回结果如下 edit project successfully! 修改项目级数据权限策略。 health update project demo-project --policy 1111 # 执行成功返回结果如下 edit project
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JupyterLab简介及常用操作 - 医疗智能体 EIHealth
JupyterLab的一大优点是,可以任意排版多个文件。在右侧文件展示区,您可以拖动打开文件,随意调整文件展示位置,可以同时打开多个文件。 图8 多文件任意编排 当在一个Notebook中写代码时,如果需要实时同步编辑文件并查看执行结果,可以新建该文件的多个视图。 打开此文件,然后单击菜单栏“File>New
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从其他项目导入模板 - 医疗智能体 EIHealth
String 源项目id source_template_id String 源模板id destination_template_id String 导入后的模板id destination_template_name String 导入后的模板名称 failed_reason String
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导入流程 - 医疗智能体 EIHealth
最小长度:1 最大长度:128 destination_workflow_name 是 String 目标流程名称 取值范围[1,56],允许大小写字母、数字、以及特殊字符中划线(-)和下划线(_)。 最小长度:1 最大长度:56 destination_workflow_version
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新建应用 - 医疗智能体 EIHealth
对于输入参数,打开“并发”开关,在启动作业时,每个参数可以设置多个参数值,自动生成多个作业并发执行。并发执行的作业数为设置的参数值个数的乘积。 例如,存在输入参数a和输入参数b,在启动作业时,分别给参数a设置了2个参数值,给参数b设置了2个参数值。那么,系统将自动生成4个作业并发执行。 对于输出参数,如果镜像启动
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删除项目 - 医疗智能体 EIHealth
删除项目 使用delete命令删除项目。项目的所有者有权限执行该操作。 为了防止项目误删,执行项目删除命令后工具会提示用户进行二次确认输入要删除的项目,只有二次输入的项目名称和命令中的项目名称一致,命令行工具才会执行删除动作。 命令结构 health delete project
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关键概念 - 医疗智能体 EIHealth
的方法,导入至自己的项目中使用。 流程 EIHealth中的分析流程包含分析过程中所需应用的执行信息和数据的输入、输出等参数定义。 分析流程至少由一个应用组成,在多个应用构成的流程中,一个应用的输出作为另一个应用的输入,流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流。 分析流程