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查看执行结果 - 医疗智能体 EIHealth
如果并发执行了多个作业，则会产生多个子任务。 对于执行失败的作业，鼠标指向作业状态，在弹出的提示框中可以查看“失败信息”和“失败原因”。同时，使用不同颜色提示执行状态，特别是对于由多个应用构成的分析作业，通过颜色方便地区分应用的执行状态。 绿色：运行成功。 红色：运行失败。 蓝色：等待运行。
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作业执行失败排查思路 - 医疗智能体 EIHealth
场景4：参数配置的不合理导致的作业执行失败。 场景5：并发投递多个作业后，部分作业运行失败，日志中显示IO读写相关错误。 场景6：作业投递后运行失败，日志显示File name too long。 场景7：同时复制多个文件，日志中显示cp: will not create hard
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执行分析作业 - 医疗智能体 EIHealth
以HTML文件的格式输出的质控报告。 执行分析作业 单击流程设计器上方“新建作业”，弹出启动作业对话框，单击“确定”，即可运行。 查看分析结果 作业运行后，页面将跳转至“项目管理 > 作业”页面。您可以在该页面，查看作业的执行状态。单击作业名称即可进入作业详情页，查看运行进展和执行结果。 图2 作业详情
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查看执行结果 - 医疗智能体 EIHealth
删除。如果执行失败的作业，可以在该页面查看失败信息。 图4 作业信息页面 作业信息页面也支持标签修改，点击标签进行修改。 作业执行状态如下所示。 等待中：作业创建成功，等待处理中。等待中的作业支持取消。 运行中：作业创建成功，执行中。可单击作业名称，进入详情页查看运行详情。“运行中”的作业不允许取消。
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创建应用 - 医疗智能体 EIHealth
图2 填充应用内容 对于测序得到的大量数据，如果需要批量执行NGS分析，可以选取以下任意一种方式进行批量执行： 方式一：对于输入参数，打开“并发”开关，在启动作业时，每个参数可以设置多个参数值，自动生成多个作业并发执行。并发执行的作业数为设置的参数值个数的乘积。 例如，存在输入参数
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作业执行失败排查思路 - 医疗智能体 EIHealth
作业执行失败排查思路 启动作业后作业一直处于已提交的状态 问题现象 作业投递后一直处于已提交的状态。 问题排查和解决方案 查看execution log， 若execution log为空，请提交工单或联系服务技术支持。 execution log 提示K8S pod can‘t
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批量执行NGS分析 - 医疗智能体 EIHealth
批量执行NGS分析 对于测序得到的大量数据，批量并自动执行NGS分析是提高工作效率的有效方式。 从搭建、执行NGS流程中可以看出，图形化的操作界面提供了友好、便捷的操作体验，但是当面临大批量的测序数据时，需要重复设置输入、输出、执行等步骤。为进一步提高NGS流程的执行效率，本章节
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项目管理常用操作 - 医疗智能体 EIHealth
查看项目的开发环境、流程等历史运行情况，当前正在运行的分析作业会继续执行直到完成。冻结的项目可以通过“解冻”操作重新激活。 解冻：解冻项目。 转移：将项目转移给其他用户。“转移”只能由项目所有者发起，并只能转移给管理员，项目转移后，原用户角色由所有者转变为管理员。 分享：将项目分
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下载数据作业执行日志 - 医疗智能体 EIHealth
下载数据作业执行日志 功能介绍 下载数据作业执行日志 调试 您可以在API Explorer中调试该接口，支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例，并提供SDK代码示例调试功能。 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-pr
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获取数据作业执行日志 - 医疗智能体 EIHealth
CheckpointRsp objects 数据作业执行日志 表4 CheckpointRsp 参数 参数类型 描述 source String 数据名称 timestamp String 日志时间戳 message String 执行信息 请求示例 获取数据作业执行日志 https://eihealth
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步骤4：查看与执行操作命令 - 医疗智能体 EIHealth
查询操作命令列表。 执行health --help查询支持的操作命令。Linux系统下，需添加./指定当前路径。 执行操作命令，获取项目信息。 执行health get project命令查询当前账号下所拥有的项目和项目信息。Linux系统下，需添加./指定当前路径。 使用数据、应用、
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流程配置文件说明 - 医疗智能体 EIHealth
EIHealth中的分析流程包含分析过程中所需应用的执行信息和数据的输入、输出等参数定义。分析流程至少由一个应用组成，在多个应用构成的流程中，一个应用的输出作为另一个应用的输入，流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流。 在EIHealth平台，创建流程通过拖拽应用的方式完成。在命令行工具中，该过程以配置
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管理作业 - 医疗智能体 EIHealth
在“作业中心”页签，您可以查看已创建的作业。在操作列，您可以对已创建的作业执行克隆、删除操作。支持对等待中的作业进行取消操作，取消后作业不计费，运行中的作业不能取消。 删除单个作业 选择需要删除的作业，单击“操作”列“删除”即可。 图1 删除单个作业 批量删除作业 一次选中多个作业，单击“作业中心”页面上方的“删除”。
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引用数据库或者导入数据到指定数据库 - 医疗智能体 EIHealth
数据库实例id，其中引用数据库实例时可以引用多个数据库实例，用分号(;)分隔；导入数据到数据库时不支持多个实例id。 --project -p 否 源项目名称，使用此参数时代表引用数据库实例。 --skip-lines -s 否 跳过的header行数，导入数据到数据库时此参数必填。 --delimiter
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创建分析作业 - 医疗智能体 EIHealth
ID”格式生成输出路径。 优先级：运行优先级，分为0~9级，优先级高的作业会被优先执行。默认值为0。 如果当前投递的IO加速的作业，超过sfs总的作业配额数， 那么超出部分的作业会按照投递时间顺序，从最新投递的向前执行，不会按照优先级进行运行。 计算节点标签：作业会调度到含有相应标签的计算节点上。
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获取数据作业详细信息 - 医疗智能体 EIHealth
complete_data Array of strings 已完成的数据列表 running_data Array of strings 正在执行的数据列表 creator String 数据作业创建者 source_project_id String 非本项目操作场景下源项目名称
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受体信息解析 - 医疗智能体 EIHealth
受体信息解析 功能介绍 受体信息解析，如果有多个受体蛋白则只处理第一个，如果一个受体蛋白里结合了多个配体，则最多只处理前10个。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/receptor/info
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配体格式转换为SMILES - 医疗智能体 EIHealth
配体格式转换为SMILES 功能介绍 配体格式转换为SMILES，若配体文件中存在多个分子，则只取第一个返回。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/smiles
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消息中心 - 医疗智能体 EIHealth
消息清理。消息中心的消息总和超过设置值时，进行消息清理。 表3 执行状态说明 执行状态 说明 SUCCEED 执行成功。 FAILED 执行失败。 PROCESSING 数据删除、导入等操作正在处理中。 START 项目删除操作开始执行。 RUNNING 分析作业运行中。 PENDING 分析作业等待处理中。
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基本概念 - 医疗智能体 EIHealth
基本概念 应用 医疗智能体应用是生物信息软件的镜像封装，应用既可以独立使用，也可以将多个应用编排入流程串联使用。用户可以制作自定义应用，创建分析流程。 流程 医疗智能体流程包含基因组学分析过程所需应用的执行先后信息以及数据输入输出等定义。分析流程由至少一个应用组成，流程中的各个应用由其
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