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该镜像由bwa和samtool合并而成，镜像制作方法请参见制作bwa-mem镜像。 Insert Size Estimation 针对构建Index后的bam文件，统计测序数据的Insert size的分布。 picard-insertsize:2.23.3 docker pull bro
application/json 例如，对于获取用户Token接口，由于不需要认证，所以只添加“Content-Type”即可，添加消息头后的请求如下所示。 POST https://iam.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v3/auth/tokens Content-Type:
-s命令获取创建流程的模板，复制模板并保存到本地，您可以保存成.yaml或txt文件，保存为txt文件时，其内容需为yaml格式。 在本地编写模板，模板填写好后，再使用命令行工具上传模板，创建流程。示例流程由app1和app2两个应用构成，通过指定输入、输出关系链接两个应用。 # 详情说明可参考API文档中流程管理-
nextflow get workflow ID [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 不涉及 否 流程ID，指定后获取流程ID对应的流程详情。不指定时，获取的是流程列表。 --param-file -p 否 参数文件保存路径，以yaml格式保存。如果没指定，则不会显示和保存参数信息。
分子SMILES表达式 databases Array of strings 搜索使用到的数据库集合 top_n Integer 期望最大返回条目数（排序后取Top） 最小值：1 最大值：1000 表5 SearchResult 参数 参数类型 描述 smiles String 分子SMILES表达式
"xxxxxxxx" //替换为实际的project name，如cn-north-4 } } } } 获取Token后，再调用其他接口时，您需要在请求消息头中添加“X-Auth-Token”，其值即为Token。例如Token值为“ABCDEFJ....”，
用户指南（盘古辅助制药） 欢迎使用盘古辅助制药平台 关键概念 准备工作 配额管理 系统设置 项目管理 功能模块 AI模型 自定义数据库 数据管理 作业管理 收藏夹 相关参数
开发环境：预置基因组自动建模工具AutoGenome，提供多种AI引擎切换。 应用、流程支持X86、ARM运行。 消息中心：支持异步任务提示。 商用 项目管理 预置流程 数据管理 工具管理 分析作业管理 开发环境 2020年8月 序号 功能名称 功能描述 阶段 相关文档 1 医疗智能体EIHealth平台上线 基于华
and index 将质控之后得到的Clean Reads比对到参考基因组上。 Insert Size Estimation 针对构建Index后的bam文件，统计测序数据的Insert size的分布。 Bam QC 评估比对得到的bam文件的质量。 GATK MarkDuplicates
threshold 否 Float 打分阈值，分值必须大于该阈值才会返回 num_results 否 Integer 期望最大返回条目数（排序后取Top） custom_props 否 Array of CustomProp objects 用户已开启的自定义属性集合 表4 CustomProp
预计结束时间，毫秒。 表6 SynthesisParamDto 参数 参数类型 描述 top_n Integer 期望最大返回条目数（排序后取TopN）。 最小值：1 最大值：50 max_search_depth Integer 预测路径的最大深度。 最小值：3 最大值：12 time_limit
最大长度：10240 表5 SynthesisParamDto 参数 是否必选 参数类型 描述 top_n 是 Integer 期望最大返回条目数（排序后取TopN）。 最小值：1 最大值：50 max_search_depth 是 Integer 预测路径的最大深度。 最小值：3 最大值：12
单击“下游分析”，将聚类之后的不同构象进行分子对接。 单击每一个Model的按钮，查看构象。 单击每个Model的按钮，可以收藏构象，收藏后可直接在收藏夹页查看。 图3 靶点优化结果页面 图4 靶点优化结果查看轨迹 查看靶点优化作业详情 在“作业中心”单击作业名称，单击“作业信息”页面。可以查看作业的参数和运行信息。
请先参考上传数据，上传原始Fastq文件和依赖数据。 如果在创建应用时打开了“并发”开关，可以设置多个参数值，批量执行作业。 数据上传完成后，在流程设计器页面，分别单击应用参数左侧图标，设置输入和依赖数据。NGS流程中输入输出参数说明如表2所示。 表1 流程输入、输出和依赖 类别
系统设置 用户管理 资源中心 标签管理 个人设置 父主题： 用户指南（盘古辅助制药）
技术，实现算法工具的数倍加速，加速生物医疗大数据的分析。 平台由项目管理、数据管理、作业、工具、开发环境、镜像等核心部件组成，各个部件沉淀了丰富的技术细节和人性化的设计。 初学者能够基于页面可视化的完成数据管理、复现业内的分析流程和算法。资深从业者能够基于镜像打造自己的分析流程。
EIHealth提供了个性化分析流程的搭建和管理操作。您可以将生物信息学软件封装为应用，并将其编排调度，形成自定义分析流程。 准备工作 1. 购买服务 2. 获取认证信息 3. 下载命令行工具 4. 命令行工具初始化 用户管理 1. 创建子用户 2. 添加项目成员和权限 数据管理 数据管理常用操作 命令行工具概述
macOS health-macOS-x86_64.tar、health-macOS-x86_64.tar.sha256 本页面命令行工具下载后，在使用时，需用到您注册华为账号并开通华为云时提供的用户名等信息，用于登录并操作EIHealth平台的项目、数据等资产。这些信息的处理将遵循
流程设计器是一种用于创建、查看、修改流程的图形化工具，详细介绍请参见流程设计器。新建流程时，自动保存默认打开。 图1 新建流程 填写流程参数信息，填写完成后单击“确定”。 填写流程基本参数，包括“流程名称”、“版本”、“标签”、“短描述”和“描述”。 “流程名称”和“版本”为必填项，其他参数可选填。
SynthesisTaskData 参数 参数类型 描述 smiles String 分子SMILES表达式 top_n Integer 期望最大返回条目数（排序后取TopN） 最小值：1 最大值：50 max_search_depth Integer 预测路径的最大深度 最小值：3 最大值：12 ma
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