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RoCE网络问题 - 高性能计算 HPC
RoCE网络问题 dtest或rping打流测试网络双向不通问题 问题现象: dtest/rping打流测试网络双向不通问题:A机器作为Server端,B机器作为Client端,dtest/rping测试RoCE网络异常;调换A、B机器角色,B机器作为Server端,A机器作为C
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HPC简介 - 高性能计算 HPC
HPC简介 什么是HPC 高性能计算(High-performance computing,HPC)是一个计算机集群系统,它通过各种互联技术将多个计算机系统连接在一起,利用所有被连接系统的综合计算能力来处理大型计算问题,所以又通常被称为高性能计算集群。 HPC的业务特点 科学研究
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HPC和公有云 - 高性能计算 HPC
端大数据分析。 优化性能 性能比普通云服务器提高30%。 通过虚拟化优化(SR-IOV、PCI直通)等,各类测试报告显示:大规模云化HPC性能损耗不大。 HPC与云服务的关系 表1 所需云服务 云服务 作用 弹性云服务器(ECS) 用于在公有云平台上创建高性能计算服务器。 虚拟私有云(VPC)
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创建裸金属服务器集群 - 高性能计算 HPC
设置“存储”。 根据磁盘使用的存储资源是否独享,磁盘划分为“云硬盘”、“专属存储”和“专属企业存储”三类,您可以根据实际需求进行选择。当前创建时仅支持携一种类型的磁盘下发裸金属服务器。 云硬盘:为裸金属服务器提供规格丰富、安全可靠、可弹性扩展的硬盘资源,满足不同性能要求的业务场景。 如果未申
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创建支持IB网卡的弹性云服务器 - 高性能计算 HPC
用户基于弹性云服务器创建的个人镜像,仅用户自己可见。包含操作系统、预装的公共应用以及用户的私有应用。选择私有镜像创建弹性云服务器,可以节省您重复配置弹性云服务器的时间。 选择“私有镜像”,并展开下拉框,选择所需的私有镜像。您可以选择使用加密镜像,更多关于加密镜像的信息,请参见《镜像服务用户指南》。 共享镜像
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集群扩容 - 高性能计算 HPC
集群扩容 操作场景 集群使用过程中,如当前的集群规模已经不满足需要,可使用集群扩容功能对集群进行扩容操作以增加节点数。 只有状态为“运行中”的集群可进行扩容操作。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。 在“集群管理”页面选择要扩容的集群,单击后方操作中“扩容”,进入扩容的详情页面。
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Platform MPI - 高性能计算 HPC
MPI。 执行以下命令,安装需要的库文件。 # yum install glibc.i686 libgcc-4.8.5-11.el7.i686 增加执行权限,例如安装包所在路径为/root。 # cd /root && chmod +x platform_mpi- 09.01.04.03r-ce
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安装和使用Platform MPI - 高性能计算 HPC
yum install glibc.i686 libgcc-4.8.5-11.el7.i686 libgcc_s.so.1 执行以下命令,增加执行权限。 #chmod +x platform_mpi-09.01.04.03r-ce.bin 安装Platform MPI。 # ./platform_mpi-09
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修订记录 - 高性能计算 HPC
BMS场景) 在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景) 2018-08-30 第六次正式发布。 增加 HPC断点续算计算方案 2018-07-30 第五次正式发布。 增加 Platform MPI和在HPC集群上运行Platform MPI,弹性云服务器支持使用Platform
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方案概述 - 高性能计算 HPC
可以利用公有云的跨地域能力,共享计算资源,海量数据,并能实现云端大数据分析。 优化性能 性能比普通云服务器大幅提升。 通过虚拟化优化(SR-IOV、PCI直通)等,各类测试报告显示:大规模云化HPC性能损耗不大。 约束与限制 MPI和通讯库的版本需要提前适配RoCE,请联系技术支持
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配置BMS集群互相免密登录 - 高性能计算 HPC
执行以下命令,ssh方式登录本节点,验证是否可以不输入密码登录BMS。 $ ssh localhost 图1 免密登录BMS 系统回显结果如图1所示,可以无密钥登录本节点,表示权限配置成功。 依次登录集群中其他BMS,重复执行步骤1~5。 执行以下命令,验证参加测试的BMS之间是否可以免密码互相登录。
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配置ECS集群互相免密登录 - 高性能计算 HPC
执行以下命令,ssh方式登录本节点,验证是否可以不输入密码登录ECS。其中hostname1为本主机名。 $ ssh localhost $ ssh hostname1 依次登录集群中其他ECS,重复执行步骤1~4。 执行以下命令,验证参加测试的ECS之间是否可以免密码互相登录。 假设集群
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在HPC集群上运行社区OpenMPI - 高性能计算 HPC
TMOUT=0 执行以下命令,验证参加测试的弹性云服务器之间是否可以免密码互相登录。 $ ssh 用户名@SERVER_IP 执行以下命令,关闭弹性云服务器的防火墙。 # iptables -F # service firewalld stop 执行以下命令,给参与测试的弹性云服务器配置主机名。
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在HPC集群上运行Spectrum MPI - 高性能计算 HPC
器。 登录用户为创建弹性云服务器时指定的用户名。 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令,验证参加测试的弹性云服务器之间是否可以免密码互相登录。 $ ssh 用户名@SERVER_IP 执行以下命令,关闭弹性云服务器的防火墙。 # iptables -F
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在HPC集群上运行IB驱动自带的OpenMPI - 高性能计算 HPC
器。 登录用户为创建弹性云服务器时指定的用户名。 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令,验证参加测试的弹性云服务器之间是否可以免密码互相登录。 $ ssh 用户名@SERVER_IP 执行以下命令,关闭弹性云服务器的防火墙。 # iptables -F
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安装和使用IB驱动自带的Open MPI - 高性能计算 HPC
2a1为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 查询是否安装了IB驱动 执行以下命令,查询是否已成功安装IB驱动。 $ ls /usr/mpi/gcc/openmpi-4.0.2a1/bin/mpirun $ rpm
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安装和使用IB驱动自带的Open MPI - 高性能计算 HPC
0rc2为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 查询是否安装了IB驱动。 执行以下命令,查询是否已成功安装IB驱动。 $ ls /usr/mpi/gcc/openmpi-3.1.0rc2/bin/mpirun $ rpm
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IB驱动自带的OpenMPI - 高性能计算 HPC
已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 检查是否已安装IB驱动。 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。 执行以下命令,切换为root 用户。 $ sudo su 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令,查询是否已安装IB驱动。 # rpm -qa
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方法一:购买高性能计算解决方案 - 高性能计算 HPC
方法一:购买高性能计算解决方案 操作场景 购买高性能计算解决方案可以在购买时同时指定管理节点配置与计算节点配置。本节操作介绍购买高性能解决方案的操作步骤。 购买须知 第一次使用公有云服务时,系统将自动为您创建一个虚拟私有云,包括安全组、网卡。同时,用户可根据需要自行创建一个虚拟私
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安装和使用IB驱动自带的Open MPI - 高性能计算 HPC
登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。 # service firewalld stop # iptables -F 执行以下命令,查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1 确认关闭防火墙成功 依次登录集群中所有BMS,重复执行步骤1.2~步骤1