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进入“专题”页签，单击“新建研究”。 图1 新建研究 填写任务的基本信息，包括选择任务所属项目，研究的名称和描述。 图2 基本信息 选择配体分子和受体蛋白。 作业名称：自定义名称 。 类型：选择小分子化合物。 流程：选择从资产市场中订阅的“Docking Summary”流程。
图1 用户管理 在用户管理页面，单击“导入用户”，进入“导入用户”页面。 在导入用户页面，可以选择“用户”或者“用户组”进行导入。 图2 导入用户 导入的IAM子用户需要具有管理控制台访问方式。 导入用户时不能超出配额。如果超出配额，进行配额调整后，5分钟后生效。
在用户管理页面，单击“导入用户”，进入“导入用户”页面。 在导入用户页面，可以选择“用户”或者“用户组”进行导入。 图1 导入用户 导入的IAM子用户需要具有管理控制台访问方式。 导入用户时不能超出配额。如果超出配额，进行配额调整后，5分钟后生效。
单击“分子搜索”功能卡片，进入分子搜索页面。 在配置页面，进行分子搜索配置，包括输入小分子、选择搜索算法、选择输出个数。 图1 分子搜索页面 输入小分子：可以通过输入SMILES、上传文件或者直接绘制输入小分子。最终以SMILES为准。
单击“功能模块 > 通用工具 > MOL 3D Viewer”，进入MOL 3D Viewer页面即可操作。 主要功能包括： 本地分子结构的3D可视化，支持多种显示样式，支持本地文件拖拽进画布区域进行渲染。 大分子支持PDB编号自动下载。 相互作用的可视化。
单击“分子生成”功能卡片，进入配置页面。 输入初始数据集，有两种输入方式： 选择文件：支持SDF、MOL2、PDB、SMI格式文件；小分子支持10-10000个。如果没有初始数据集，可以选择官方库，ZINC数据集。
在相似度返回之前，您也可以直接选择配体对进入下一步。 图4 选择计算路径 单击“下一步”，进入FEP设置页面，设置相关参数。 时间步长：默认值：0.002，取值范围：0.001 ≤ dt ≤ 0.005，单位：ps。
在“数据”页面单击“归档”，进入归档数据页面。 图1 选择归档 填写归档的参数信息。 表1 参数说明 参数 说明 名称 设置归档数据的名称。归档名称长度为1-100。 描述 归档数据描述信息。 归档类型 选择归档数据存储类型。默认为标准存储。
单击“新建应用”，进入新建应用页面。 图1 新建应用 填写应用的基本信息，包括“名称”、“版本”、“图标”、“标签”、“短描述”和“描述”。 图2 基本信息 选择镜像和镜像版本。 详细的镜像介绍和制作方法请参见镜像管理。 填写镜像启动命令。
进入聚类结果页。 在聚类结果页面，可以查看每个聚类的分子数量等信息。 图17 查看聚类结果 单击某个聚类的操作列的“查看详情”，即可进入聚类详情页面，聚类详情页支持以卡片、列表以及3D的形式查看。默认展示卡片页面，用户可自行进行切换。 每个结果页面只用进行一次聚类分析操作。
单击“合成路径规划”功能卡片，进入配置页面。 在配置页面，可以在左侧绘制分子，也可以通过上传分子文件方式上传分子或者在白框内输入小分子SMILES表达式。 上传分子文件：支持SDF、MOL2、PDB、SMI格式文件。 最大搜索路径个数：合成路径规划的路径数量。
步骤2：准备应用运行环境 步骤2：准备应用运行环境 步骤2：准备应用运行环境 更多 云服务器卡顿 应用容器化改造介绍 应用容器化改造流程 步骤1：对应用进行分析 步骤2：准备应用运行环境 更多 Ping不通 应用容器化改造介绍 应用容器化改造流程 步骤1：对应用进行分析 更多 访问外网
新建研究 进入“专题”页面，单击“新建研究”。 图1 新建研究 参考表1，设置运行信息。 表1 参数说明 参数 说明 选择项目 选择创建好，并带有数据的项目。 研究名称 可自定义研究名称。 流程 选择资产市场中订阅的Docking Summary流程。
处于“冻结”状态的项目，用户无法进入该项目查看项目的开发环境、流程等历史运行情况，当前正在运行的分析作业会继续执行直到完成。冻结的项目可以通过“解冻”操作重新激活。 解冻：解冻项目。 转移：将项目转移给其他用户。
单击“导入应用”，进入导入应用页面。 图1 导入应用 选择需要引用的项目以及项目中的应用，选择应用的版本。“导入应用名称”是选填项，可以使用原有名称，或自定义。 图2 导入应用 单击“确定”，导入应用，导入过程中可以查看每个应用的导入状态。 父主题： 工具管理
单击项目名称，进入项目管理页面，选择“数据”页签。 选择需要发布的数据或者文件夹，单击“操作”列的“更多>发布”。 图1 发布数据 在发布页面，填写发布数据的相关信息。 表1 发布数据参数说明 参数 说明 名称 发布数据的名称。
购买资源 盘古辅助制药平台购买完成后，单击“进入平台”，在平台右上角单击用户名，选择“资源中心”。 您可以根据实际需求选择购买功能调用套餐包和存储套餐包。在后续使用过程中，也可根据使用情况随时购买资源。 资源中心 在“资源中心>功能调用”中可以查看功能调用套餐包的使用情况。
单击项目名称后面，进入项目设置页。 选择“成员管理”，单击“添加成员”。 图1 添加成员 选择已添加至平台的成员名称及权限。 图2 选择成员 单击“确定”，将用户添加至项目中。 移除、修改项目成员 单击项目名称后面，进入项目设置页。
进入聚类结果页。 图10 查看聚类结果 在聚类结果页面，可以查看每个聚类的分子数量等信息。 单击某个聚类的操作列的“查看详情”，即可进入聚类详情页面，聚类详情页支持以卡片、列表以及3D的形式查看。默认展示卡片页面，用户可自行进行切换。
在平台左上角选择项目名称，单击，进入项目设置页面。 图2 查看项目信息 项目设置 在项目设置页面，可以查看项目名称，该项目的数据存储OBS桶名称。所有者可以修改项目描述，转移项目，删除项目。管理员可以修改项目描述，退出项目。操作员可以退出项目。
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