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分子SMILES表达式 props Array of objects 分子ADMET属性值列表 similarity Number 分子与初始分子的相似度 num_fulfilled_weak_constraints Integer 分子所满足的弱约束数量 score Number 分子的打分
"data" : "xxxxxxx" } } 响应示例 状态码： 200 口袋检测成功响应。 { "result" : 0.9 } 状态码 状态码 描述 200 口袋检测成功响应。 错误码 请参见错误码。 父主题： 药物通用接口
流程以fastq格式数据作为输入，对碱基的质量信息进行评估，判断可靠程度，通过质控、比对、变异检测等步骤，最终输出包含样本SNP、INDEL的VCF文件。 基于二代测序的基因突变检测 NGS流程简介 操作步骤 快速创建一个kubernetes集群 3分钟创建一个游戏类容器应用 3分钟创建一个游戏类容器应用
生成分子SVG图 功能介绍 生成分子SVG图。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/svg 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id
分子对接结果pdbqt文件所在的文件夹。 输出参数 dir-out directory 分子对接结果汇总信息（矩阵.xlsx、3D可视化文件.pdb、配体及受体结构图片.svg等）所在的文件夹。 参数填写无误后，单击界面上方“启动作业”，运行作业。 步骤4：查看执行结果 在“项目管理”页面选择“作业”页签，单击创建的Docking
创建FastQC应用样例 本章节提供了在EIHealth平台创建FastQC应用的样例，帮助您快速熟悉平台的使用方法。 FastQC是一款高通量序列数据的质量检测工具，此样例基于开源的FastQC软件，将软件制作成镜像，上传至平台，并基于此镜像创建应用。应用创建完成后可以直接使用FastQC应用，或将其编排至流程，和其他应用一起使用。
方式1：使用预置的NGS流程 使用EIHealth平台预置的流程进行运行作业。 步骤1：订阅流程 进入资产市场订阅已有的流程，以二代基因测序数据的变异检测流程为例。 图1 订阅流程 可以在“工具 > 流程”列表可以看到刚刚订阅的流程。 图2 查看订阅的流程 步骤2：订阅数据 若您本地有需要分
图解医疗智能体 AI药物研究 AI基因组研究
些转录本的丰度，并且检测样本间的差异表达及可变剪接。 RNA Hisat2-Stringtie analysis process 二代基因组测序即Next Generation Sequencing (NGS)是一种基于边合成边测序的方式。NGS在保持了测序高准确度的同时，大幅的
生成相互作用2D图 功能介绍 生成相互作用2D图，若不提供配体文件，则受体文件中必须包含配体；若提供配体文件，则受体中的配体（若有）则会被忽略。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/d
入门实践 表1 常用最佳实践 实践 描述 基于二代测序的基因组突变检测 本最佳实践提供了通过命令行工具上传数据、上传镜像后，在医疗智能体平台搭建NGS流程，执行分析作业及批量执行NGS分析。 新型冠状病毒（COVID-19）虚拟药物筛选 本最佳实践介绍如何使用EIhealth平台
AI药物研究 父主题： 图解医疗智能体
AI基因组研究 父主题： 图解医疗智能体
的RNA二代测序原始数据，具有对数据全自动质量控制、拼接和病毒组成分析等功能，实现了对样本中可能存在的包括新型冠状病毒在内的各种病毒的快速检测，并在线分析各种病毒的相对载量。 抗病毒药物研发 计算机辅助药物筛选根据病毒靶点和小分子药物的3D结构，计算病毒蛋白与药物之间的结合能量，
STAR流程 二代基因组测序即Next Generation Sequencing (NGS)是一种基于边合成边测序的方式。NGS在保持了测序高准确度的同时，大幅的提高了测序速度。目前NGS已经普遍的应用于全基因组测序、全外显子测序、转录组测序表观遗传学等领域。 该流程以NGS得到的fas
NGS流程 二代基因组测序即Next Generation Sequencing (NGS)是一种基于边合成边测序的方式。NGS在保持了测序高准确度的同时，大幅的提高了测序速度。目前NGS已经普遍的应用于全基因组测序、全外显子测序、转录组测序表观遗传学等领域。 该流程以NGS得到的fas
导入用户 EIHealth平台支持把华为云的IAM子用户导入至平台子用户。通过导入已有子用户，增加用户使用的便捷度，方便用户维护账号。 IAM用户导入只支持使用Domain用户导入。 使用管理员账户登录医疗智能体平台。 在右上角用户名中选择“用户管理”。 图1 用户管理 在用户管
导入用户 盘古辅助制药平台支持把IAM子用户导入至平台子用户。通过导入已有子用户，增加用户使用的便捷度，方便用户维护账号。 使用管理员账户登录盘古辅助制药平台。 在右上角用户名中选择“用户管理”。 在用户管理页面，单击“导入用户”，进入“导入用户”页面。 在导入用户页面，可以选择“用户”或者“用户组”进行导入。
查看执行结果 作业运行完成后，可以在“作业中心”页面，单击作业名称，查看输出结果和作业信息。 输出结果 当作业执行成功后，可以在作业中心页面，单击作业名称，查看输出结果。 在输出结果中可以查看下载某个任务或者全部任务的信息，可以在操作列查看3D、合成路径等信息。 图1 输出结果-列表视图
化学式：小分子的化学式。 XLOGP3：小分子的脂溶性logP。 TPSA：小分子的拓扑极性表面积。 靶点：小分子的靶点。 Csp3比例：小分子的碳饱和度。 分子量（Da）：小分子的分子量。 可旋转键数目：小分子的可选择键数。 父主题： 运行大规模虚拟药筛任务
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