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本章节提供了在EIHealth平台创建FastQC应用的样例，帮助您快速熟悉平台的使用方法。 FastQC是一款高通量序列数据的质量检查工具，此样例基于开源的FastQC软件，将软件制作成镜像，上传至平台，并基于此镜像创建应用。应用创建完成后可以直接使用FastQC应用，或将其编排至流程，和其他应用一起使用。 创
系统跳转到“我的发布”页面，可以查看发布的应用状态。当应用发布成功后，可以在“资产市场>组织共享”中查看发布的应用。 已发布的应用不能直接编辑和删除，需下线后才能编辑和删除。 发布中的应用可以取消，取消后状态为发布失败。 已发布的应用可以订阅和下线。 同一个发布者可以发布同名称，同类型的应用。若版本不同，
├─eihealth-project-name # 引用的项目名 │ ├─path1 # 引用的项目的源路径 ├─OBS:obs-bucket-name # 引用的外部桶名 │ ├─path1 # 引用的外部桶的源路径 ├─OBSFS:obsfs-bucket-name:
行号。执行更新、删除操作时，必须指定该参数。 --values -v 否 修改列名和对应的值，用反单引号引用列名和值，格式为`column-name1:value1`;`column-name2:value2`，更新或插入多个列值时使用分号。 说明： 对于极其特殊的值，例如：qqq'\"`22，qqq'\"`22
X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头，从而通过身份认证，获得操作API的权限，获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度：1 最大长度：32768 表3 请求Body参数
上传数据是最常用的添加数据功能，但由于网页传输大文件时存在一定的限制，所以上传数据的大小不能超过1GB。 图1 上传数据 复制数据 复制数据会从别的项目中复制一份数据到当前项目中，这里可选择的源项目需是当前账号为管理员的对应项目。如需设置项目成员，请参考用户指南中的项目成员和权限。 图2
（默认json格式）。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 获取json格式实例详情 health get
当前项目。 --yaml和--workflow命令不能同时存在。 --description -d 否 作业的详细描述信息。 --input -i 否 输入参数名称，该参数与流程中的输入参数对应，通过修改--input，修改输入数据。 选择时，input和input-file二选一。
、自由能微扰、合成路径规划功能的作业。 在“作业中心”页面，以列表形式展示了项目中作业的运行状态。您可以查看作业的名称、创建时间、运行状态、总时长、运行时长、已运行时间、预计还需时间。对于列表中的作业，支持通过作业名称、状态、类型、标签、创建时间和完成时间进行快速搜索。也可以根据
单击数据中心右上角“引用”。 选择需要引用的项目以及项目中的数据，或者选择待引用的OBS桶路径，先选择OBS桶所在区域，再选择OBS桶名称，支持选择不在同一区域的OBS桶。 图3 引用数据 单击“确定”，引用其他项目中的数据至本项目。 引用的数据和项目将显示在左侧的数据列表中。 图4 引用的数据 引用OBS
Nextflow需要用户自己进行安装，安装的权限只有管理员拥有。 在平台右上角用户名中选择“系统设置”。 在“Nextflow配置”模块，单击“安装”。 图1 安装Nextflow 选择安装方式。目前支持GitHub获取和上传安装包两种方式。 GitHub获取：可以选择版本，目前支持选择的安装包版本v22
gene-assent:/DataSet/ 切换到引用数据的路径，例如引用了gene-assent项目中的DataSet数据，使用health cd命令切换到该路径，并使用health ls名称查看详细数据。 当由引用数据的路径，切换到自己项目数据时，需指明具体的路径。 health cd gene-assent:/DataSet/
--query -q 否 查询条件，格式为{column}::{operator}::{number}。`::`分割一个表达式中的列名、操作符和值。不同类型支持的操作符如下：String支持like（模糊搜索）、equal（精确搜索）、notlike（不包含）、notequal（不等于
在界面显示数据作业执行日志，需要与data-job-id一起使用。 说明： 参数--log和--file不能同时使用。 参数--log的优先级高于--file。如果命令中同时包含参数--log和--file，默认只执行--log。 --file -f 否 本地文件夹路径及自定义文件
在API栏选择需要使用的服务，单击操作列的“开通服务”。 服务开通成功后，开通状态为“已开通”。 “开通服务”按钮置灰，说明您尚未认证，请先实名认证。 开通医学影像API 进入EIHealth控制台，在页面左上角切换区域“华南-广州”。 在API栏选择需要使用的服务，单击操作列的“开通服务”。
执行数据管理类操作需要项目成员具备相应的权限，详细的权限介绍请参见项目成员和权限。 数据文件的名称，不可以含有特殊字符。如果文件名包含特殊字符，将不支持下载，可通过去除文件名中的特殊字符方式解决。 查看数据作业 数据复制、数据删除等操作均为系统的异步任务，您可以在“数据作业”中查看任务的执行状态。同时，平台针对该类任务支持您在“数据中心
选择项目 选择创建好，并带有数据的项目。 研究名称 可自定义研究名称。 流程 选择资产市场中订阅的Docking Summary流程。 配体分子 选择上传的配体小分子文件。 受体蛋白 选择上传的受体蛋白文件夹。这里会默认用文件夹里面所有的蛋白质和配体小分子文件里面的小分子进行一一对接。
单击“立即发布”。 系统跳转到“我的发布”页面，可以查看发布的数据状态。当数据发布成功后，可以在“资产市场>组织共享”中查看发布的数据。 已发布的数据不能直接编辑和删除，需下线后才能编辑和删除。 发布中的数据可以取消，取消后状态为发布失败。 已发布的数据可以订阅和下线。 同一个发布者可以发
必填。 --current-project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 引用单个数据库实例 health import
limit_concurrency Integer 限制的并发量。 请求示例 创建自由能微扰作业，作业名称为demo-job，受体文件为project:/dir/file，配体分别为GLY:A:514和UNK1，路径图的中心配体为GLY:A:514，配体对分别为GLY:A:514和DrugBank:UNK1，
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