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根据表面离散点坐标集生成可渲染的文件内容 功能介绍 根据表面离散点坐标集生成可渲染的文件内容。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/toolkit/surface-points
表7 BoundingBoxDto 参数 是否必选 参数类型 描述 center 是 Array of floats 口袋中心坐标; x, y, z轴的坐标。 最小值:-9999999 最大值:99999999 数组长度:3 - 3 size 是 Array of floats 口袋尺寸大小;
10 表7 DrugBoundingBoxDto 参数 参数类型 描述 center Array of floats 口袋中心坐标;x, y, z轴的坐标。 最小值:-9999999 最大值:99999999 数组长度:3 - 3 size Array of floats 口袋尺寸大小;x
制作Docker镜像,有以下两种方法。 快照方式制作镜像(偶尔制作的镜像):在基础镜像上,比如Ubuntu,先登录镜像系统并安装Docker软件,然后整体制作快照,即可得到所需软件的Docker镜像。 Dockerfile方式制作镜像(经常更新的镜像):将软件安装的流程写成DockerFile,使用Docker
最大长度:10000000 表8 BoundingBoxDto 参数 参数类型 描述 center Array of floats 口袋中心坐标; x, y, z轴的坐标。 最小值:-9999999 最大值:99999999 数组长度:3 - 3 size Array of floats 口袋尺寸大小;
药筛运行状态可在“专题”页面查看。 图1 查看运行状态 运行完成后可单击任务名称,查看对接结合能的热图。 热图的横坐标为蛋白质名称,以及对接结合能的均值和标准差。纵坐标为配体小分子名称,数值为结合能的大小,结合能越小,颜色越偏紫色。 可以根据结合能的大小进行排序,结合能越小代表配体和受体结合越稳定。
UTF-8 Decode)以得到原始字符串;如未压缩则为原始字符串。 最小长度:0 最大长度:10000000 表8 DrugBoundingBoxDto 参数 参数类型 描述 center Array of floats 口袋中心坐标;x, y, z轴的坐标。 最小值:-9999999
查询配体相似性图计算任务 删除配体相似性图计算任务 根据center、size、padding参数生成可渲染的口袋文件内容 根据表面离散点坐标集生成可渲染的文件内容 将传入的蛋白和小分子拼接成复合物结构 单分子文件格式转换 创建分子或分子复合物批量下载任务 查询分子或分子复合物批量下载任务详情
fastp 对测序得到的fastq数据进行质控。 bwa-mem 将质控之后得到的Clean Reads比对到参考基因组上。 picard-insertsize 针对构建Index后的bam文件,统计测序数据的Insert size的分布。 bamqc 评估比对得到的bam文件的质量。
最大长度:10000000 表6 BoundBoxDto 参数 是否必选 参数类型 描述 center 是 Array of doubles 口袋中心坐标,x、y、z轴的坐标。 最小值:-9999999 最大值:99999999 数组长度:3 - 3 size 是 Array of floats 口袋尺寸大小,x、y、z轴的大小。
最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 center 是 Array of floats 口袋中心坐标。 最小值:-9999999 最大值:99999999 数组长度:3 - 3 size 是 Array of floats 口袋大小。 最小值:2
制作Docker镜像,有以下两种方法。 快照方式制作镜像(偶尔制作的镜像):在基础镜像上,比如Ubuntu,先登录镜像系统并安装Docker软件,然后整体制作快照,即可得到所需软件的Docker镜像。 Dockerfile方式制作镜像(经常更新的镜像):将软件安装的流程写成DockerFile,使用Docker
-bam ${bam-file} -outdir ${out-dir} -nt 8 --java-mem-size=80G 镜像:picard-insertsize:2.23.3 启动命令: java -jar /usr/picard/picard.jar CollectInsertSizeMetrics
表7 BoundingBoxDto 参数 是否必选 参数类型 描述 center 是 Array of floats 口袋中心坐标; x, y, z轴的坐标。 最小值:-9999999 最大值:99999999 数组长度:3 - 3 size 是 Array of floats 口袋尺寸大小;
结合口袋,包含口袋中心位置和尺寸大小 表7 BoundingBox 参数 是否必选 参数类型 描述 center 否 Array of numbers 口袋中心坐标。 x, y, z轴的坐标 size 否 Array of numbers 口袋尺寸大小。x, y, z轴的大小 最小值:1.7 最大值:500 表8 CustomProp
最大长度:24 表6 VertexLocationDto 参数 是否必选 参数类型 描述 x 否 Double 子任务的画布横坐标 y 否 Double 子任务的画布纵坐标 表7 TaskParameterDto 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String 子任务的参数名称,长度为[1
结合口袋,包含口袋中心位置和尺寸大小 表10 BoundingBox 参数 参数类型 描述 center Array of numbers 口袋中心坐标; x, y, z轴的坐标 size Array of numbers 口袋尺寸大小; x, y, z轴的大小 最小值:1.7 最大值:500 表11 CustomProp
最大长度:24 表6 VertexLocationDto 参数 是否必选 参数类型 描述 x 否 Double 子任务的画布横坐标 y 否 Double 子任务的画布纵坐标 表7 TaskParameterDto 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String 子任务的参数名称,长度为[1
结合口袋,包含口袋中心位置和尺寸大小 表7 BoundingBox 参数 是否必选 参数类型 描述 center 否 Array of numbers 口袋中心坐标; x, y, z轴的坐标 size 否 Array of numbers 口袋尺寸大小; x, y, z轴的大小 最小值:1.7 最大值:500 表8
结合口袋,包含口袋中心位置和尺寸大小 表11 BoundingBox 参数 参数类型 描述 center Array of numbers 口袋中心坐标; x, y, z轴的坐标 size Array of numbers 口袋尺寸大小; x, y, z轴的大小 最小值:1.7 最大值:500 表12 CustomProp