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工具管理简介 EIHealth中的每一个分析作业都依托于应用运行。应用可以组合形成分析流程。 应用是生物信息学软件的镜像封装。您可以将软件制作成镜像，并将镜像上传至EIHealth平台，通过应用引入镜像。制作好的应用可以单独使用，也可以将多个应用编排入流程串联使用。在“项目管理”页面
方式1：使用预置的NGS流程 使用EIHealth平台预置的流程进行运行作业。 步骤1：订阅流程 进入资产市场订阅已有的流程，以二代基因测序数据的变异检测流程为例。 图1 订阅流程 可以在“工具 > 流程”列表可以看到刚刚订阅的流程。 图2 查看订阅的流程 步骤2：订阅数据 若您本地有需要分析的二代基因组数据
性能加速（可选） 当普通的计算资源不满足业务场景时，可以选择购买性能加速资源，加快算法的数据分析速度。 单击“购买性能加速”。选择包年包月或者按需，同时选择购买的性能盘大小。 图1 购买性能加速 父主题： 购买计算资源（主账号操作）
如何使用Notebook的Terminal功能 对于习惯编码的开发者可以使用Terminal功能进行开发、调试和运行分析任务。 在“Files”页签下，单击右上角“Open JupyterLab”，然后选择“Terminal”，进入Terminal界面。 图1 Terminal 例如
Notebook简介 EIHealth平台集成了基于开源的Jupyter Notebook，可为您提供在线的开发和调试工具，用于编写和调测模型训练代码。Notebook使您无需关心分析软件包的安装、升级和维护等工作，只需聚焦于科研工作，从而加快科研进展。 关于Jupyter Notebook
直接挂载OBS目录进行大规模计算，如何解决偶现报错 问题现象 运行作业时，作业直接挂载OBS目录进行大规模计算。偶现“异常应用”，并日志报错input/output error或file xxx not exists。 问题原因 OBS集群到计算集群之间的带宽达到了上限。 OBS集群的
成长地图 | 华为云 医疗智能体 医疗智能体（EIHealth）基于华为云AI和大数据技术优势，为基因组分析、药物研发、临床研究三个领域提供专业AI研发平台。 产品介绍 用户指南 仅两个按钮时选用 立即使用 成长地图 由浅入深，带您玩转EIHealth 01 了解 医疗智能体（EIHealth
新建作业 Nextflow作业依托于流程运行，需要您先新建流程，再基于流程创建作业。 选择“作业>分析作业>Nextflow”，单击“新建作业”。 设置作业参数。 作业名称：设置作业名称。名称长度为1-63，只允许出现中划线、字母和数字。 标签：设置作业标签。最多可以设置5个。 描述
获取镜像 获取创建分析应用的镜像 创建分析应用时，您可以通过Docker Hub等镜像仓库，搜索引擎，自己制作等途径获取所需的镜像。 例如，可在Docker Hub获取bwa软件（用于将基因序列比对到参考基因组上）。 以下类型镜像，建议您通过Docker Hub获取，不建议自己制作
启动作业 通过使用create或 submit命令引用本地的配置文件，启动分析作业。 命令结构 health create job [flags] # create和submit作用相同 health submit job [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明
方式3：自定义镜像运行FastQC流程 应用是运行作业的最小单位，每个应用依托于一个镜像进行创建。 方式2使用直接制作好的应用。用户也可以自己制作镜像，并基于镜像创建应用。 本示例中制作FastQC镜像，并基于镜像创建应用，运行分析作业。 镜像简介 由于生物信息学软件，往往由于不同的操作系统
概述 欢迎使用医疗智能体（EIHealth）平台，该服务基于华为云AI和大数据技术优势，为基因组分析、药物研发和临床研究三个领域提供的专业AI研发平台。平台提供大量相关模型、算法及数据资源，是一站式的医疗研发平台。EIHealth以开放API的方式提供给用户，您可以根据本文档提供的
方式2：使用预置应用搭建NGS流程 将EIHealth平台预置的应用构建成流程，并运行作业。以二代基因组分析流程：fastp，bwa-mem，bamqc，picard-insertsize两个算法为例。 应用是对每个软件的镜像封装，将应用封装好后可以反复利用并也可以让其他人很容易的使用
应用配置文件说明 EIHealth中的每一个分析作业都依托于应用运行。应用是生物信息学软件和运行该软件所依赖的运行环境的镜像封装。 在EIHealth平台，创建应用的过程通过图形化的界面操作完成。在命令行工具中，该过程以配置文件的形式给出。您可以基于获取到的模板使用命令行工具创建应用
查看执行结果 分析作业的执行时间与环境资源类型、环境资源大小、处理数据大小等相关。您可以在“作业”页面查看执行结果或进行操作。提供了作业的执行状态的查看，并可对作业执行取消、删除、重试、克隆、导出操作。勾选多个作业，可以批量取消、批量删除、批量重试、批量导出。 作业执行状态如下所示
项目成员和权限 医疗智能体以项目为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组。以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。 添加项目成员 移除、修改项目成员 成员角色和权限 添加项目成员 前提条件 平台管理员首先通过“用户管理”功能添加平台用户，才能将该用户添加至项目中。 创建用户的详细方法请参见创建平台用户
流程设计器 分析流程至少由一个应用构成，流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流，一个应用的输出作为另一个应用的输入。 流程设计器是一种用于创建、查看、修改流程的图形化工具。借助流程设计器，您可以拖拽工具到画布中，可视化链接各应用，指定应用的先后顺序。 流程设计器界面 流程设计器界面由工具栏
作业执行失败排查思路 作业执行失败，有如下场景： 场景1：作业投递后处于运行中，运行过程正常，但是最后超时失败。 场景2：作业投递后处于运行中，但是无日志打印，也没有任何符合预期的输出文件生成。 场景3：作业投递后显示运行成功，但是根据日志分析作业有报错，也未能正确输出相关信息。
管理用户 删除子用户 管理员用户包含子管理员，均具备删除权限。但子管理员不可将管理员删除。删除用户只能删除来源为本平台的用户，如果来源为IAM，则只支持移除。 项目是存储数据、镜像、分析作业等的工作空间，执行删除用户操作时，只有在该用户名下没有项目时，才可以被删除。在用户的操作列，
项目管理常用操作 对项目执行冻结、解冻、转移、分享和删除操作时，需要项目成员具备相应的权限，不同类型成员所拥有的权限请参见成员角色和权限。 冻结：冻结项目。一个项目可能由于某些原因暂时中止，此时可以将项目暂时冻结，待下次重新启动时再激活。处于“冻结”状态的项目，用户无法进入该项目查看项目的开发环境
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