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数据文件列名:选择数据库列名,仅解析前100个列名,支持选择12个列名保存到数据库。 组织共享: 如果关闭,则该数据库只能自己使用。 如果开启组织共享,则其他子用户也可以使用您的数据库进行分子搜索。 默认为关闭。 数据库列表展示数据库的名称、分子数量、创建时间、状态等信息。对于已
使用新生成的Notebook kernel。 在Files页面,选择新建的Notebook kernel。 安装新软件包。 查看pandas是否安装。如下表示 pandas未安装。 返回Terminal,切换到相应的环境“py37”,然后安装pandas。 conda activate
提供了友好、便捷的操作体验,但是当面临大批量的测序数据时,需要重复设置输入、输出、执行等步骤。为进一步提高NGS流程的执行效率,本章节介绍如何通过循环读取输入数据,批量运行NGS。同时,您也可以参考本示例,将批量运行的方法复制到其他的分析任务中。 配置命令行工具 批量执行分析需要
Notebook 如何使用Notebook的Terminal功能 如何将Notebook中的数据下载至本地 如何在Notebook中安装外部库
体水平上的缺失或扩增性突变,因此Copy Number Variation(CNV)可以作为检测是否患癌的指标。本流程使用患者的NGS测序数据,进行CNV变异筛查,进而判断取样者是否有患癌风险。 该流程以CNVkit为核心,基于输入的fastq,以hg38人基因组数据生成的参考基
镜像 如何搭建Docker环境 如何将生物信息学软件封装为镜像并上传
流程、作业 应用的参数和镜像启动命令如何设置 直接挂载OBS目录进行大规模计算,如何解决偶现报错
禁止/允许删除数据 您可以对某个数据设置禁止删除。设置禁止删除后,该目录只能添加数据,不支持删除数据。也可以通过“允许删除”取消禁止删除设置。 图7 开启禁止删除数据 支持设置最多15个数据的禁止删除状态。 如果平台或者父目录设置禁止删除状态,则对应的数据根路径或者子路径均为禁止删除状态,子
账号 如何进行实名认证
数据管理 如何获取AK/SK 几种不同类型的归档,区别是什么
传镜像后,在医疗智能体平台搭建NGS流程,执行分析作业及批量执行NGS分析。 新型冠状病毒(COVID-19)虚拟药物筛选 本最佳实践介绍如何使用EIhealth平台虚拟药物筛选功能,通过获取示例数据,创建药物虚拟筛选任务并查看结果。
检查URL中提供的项目ID是否正确。 401 eihealth.03000003 invalid token 检查请求头中的X-Auth-Token是否正确。 401 eihealth.03001003 unauthorized task 检查任务ID是否正确。 401 eihealth
dev_user_pool Boolean notebook是否使用专属资源池 has_dev Boolean 是否集成开发环境 has_drug Boolean 是否部署药物虚拟筛选 has_encryption_button Boolean 是否显示加密按钮 deploy_mode String
最小长度:0 最大长度:1024 nullable 是 Boolean 列是否允许为空 primary 是 Boolean 是否作为主键 searchable 是 Boolean 是否可查询 unique 是 Boolean 是否唯一 tips 否 String 查询参数格式的提示信息 最小长度:0
最小长度:0 最大长度:1024 nullable Boolean 列是否允许为空 primary Boolean 是否作为主键 searchable Boolean 是否可查询 unique Boolean 是否唯一 tips String 查询参数格式的提示信息 最小长度:0 最大长度:1024
路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 id 是 String 计算资源id 最小长度:1 最大长度:128 表2 Query参数 参数 是否必选 参数类型 描述
路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 id 是 String 计算资源id 最小长度:1 最大长度:128 表2 Query参数 参数 是否必选 参数类型 描述
ct-Token的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 shareable 是 Boolean 是否共享。 响应参数 无 请求示例 设置数据库为共享 https://{endpoint}/v1/{proje
参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 model_id 是 String 模型id。 最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型
最小长度:0 最大长度:1024 nullable Boolean 列是否允许为空 primary Boolean 是否作为主键 searchable Boolean 是否可查询 unique Boolean 是否唯一 tips String 查询参数格式的提示信息 最小长度:0 最大长度:1024