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虚拟药物筛选简介 虚拟药物筛选功能 医疗智能体平台支持根据靶点蛋白和小分子药物的3D结构，计算蛋白与药物之间的结合能量，进而预测小分子是否有成为候选药物的可能性。 虚拟药物筛选可实现如下功能。 整合分子对接结果，生成结合能矩阵。 整合受体与分子对接产生的配体构象，用于可视化展示。
靶点文件：支持PDB格式文件，文件大小不能超过10M。若文件中含有多个受体，默认只处理第一个。 靶点预处理： 去配体：提交任务时系统会自动删除配体。 是否平衡电荷：是否加入离子，使体系电荷守恒，默认是平衡电荷。 蛋白力场：蛋白质力场支持amber03, amber94, amber96, amber99
校验token 功能介绍 校验token是否可访问当前环境 URI GET /v1/{project_id}/users/token-verification 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID，您可以从获取项目ID中获取。
为Token。 最小长度：1 最大长度：32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 schedulable 是 Boolean 是否可调度 响应参数 无 请求示例 设置是否可调度，设置为可调度 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud
运行时，会将非最终结果的数据存储在SFS中用以提高任务运行效率，作业执行完成后会清理释放SFS空间。对于涉及频繁读写场景的任务建议开启IO加速，开启前需要先购买性能加速。 本地盘加速：使用计算节点的本地盘进行加速。使用本地盘加速时，需保证购买的计算节点带有“数据盘”。OBS桶中的
路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID，您可以从获取项目ID中获取。 最小长度：1 最大长度：128 id 是 String 策略id 最小长度：1 最大长度：128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型
请检查项目ID是否正确。 404 eihealth.01020004 The image does not exist. 请检查镜像ID是否正确。 404 eihealth.01020005 The image tag does not exist. 请检查镜像tag是否正确。 404
t-policies 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID，您可以从获取项目ID中获取。 最小长度：1 最大长度：128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token
在使用Nextflow时，作业运行失败的可能原因 由于Nextflow支持的特殊字符继承了Nextflow原有特性，因此请排查参数值，或者选择的数据名称，或者路径中带的特殊字符是否符合Nextflow原有特性。 建议启动并发作业数最多为8个。 父主题： Nextflow
参数描述。取值范围：[0-255] 最小长度：0 最大长度：255 required Boolean 参数是否必须 concurrent String 参数是否开启并发。当前支持vars_iter并发类型，不填表示未开启并发。 type String 参数类型。取值：[STRING，FILE，DIRECTORY，ENUM]
运行时，会将非最终结果的数据存储在SFS中用以提高任务运行效率，作业执行完成后会清理释放SFS空间。对于涉及频繁读写场景的任务建议开启IO加速，开启前需要先购买性能加速。 本地盘加速：使用计算节点的本地盘进行加速。使用本地盘加速时，需保证购买的计算节点带有“数据盘”。OBS桶中的
64 表4 DatabaseTriggerDto 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String 触发器的列名，取值范围：[1,63] 最小长度：1 最大长度：63 judge_mode 是 String 触发器的判断模式 枚举值： gte lte gt lt like notlike
选择模型数据。可选择数据中心数据，或者示例数据。 仅支持CSV格式，数据条数支持100-50000条，文件不大于5MB。 组织共享 如果关闭，则该模型只能自己使用。 如果开启组织共享，则其他子用户也可以使用您的模型做分析。 默认为关闭。 单击“确定”。 每人最多可以创建100个模型，每次使用模型时，最多可以使用10个。
的生物学问题。 本示例中NGS流程基于医疗智能体（EIHealth）平台搭建，流程以fastq格式数据作为输入，对碱基的质量信息进行评估，判断可靠程度，通过质控、比对、变异检测等步骤，最终输出包含样本SNP、INDEL的VCF文件。 该案例介绍NGS的搭建步骤，涵盖镜像、应用、流
NGS流程中需使用二代测序得到的原始fastq文件、参考基因组序列、参考Variants数据集。 本示例中以Windows系统命令行工具为例，介绍如何将本地数据上传到EIHealth平台。更多的命令介绍请参见命令行工具。 使用命令行工具，用switch命令进入待操作的项目。 例如，使用health
64 表4 DatabaseTriggerDto 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String 触发器的列名，取值范围：[1,63] 最小长度：1 最大长度：63 judge_mode 是 String 触发器的判断模式 枚举值： gte lte gt lt like notlike
在创建Notebook时，平台为您提供了系统镜像。同时，您也可以使用自定义镜像，创建Notebook，满足个性化的开发需求。 本章节介绍如何使用自定义镜像创建Notebook（在基础镜像中安装化学分子格式转换工具Open Babel），详细步骤如下所示： 步骤1：安装容器引擎 步骤2：获取Notebook基础镜像
计算资源 单击计算资源页面，列表中会显示已购买的计算资源，以及是否可用等信息，若新购买的账号则列表为空。 图1 计算资源 单击“购买计算资源”按钮购买计算资源。可以根据业务需要选择不同的资源类型，其中可用区可以选择任意可用区即可。并支持包年包月购买，或者按需购买。 图2 购买计算资源
页面查看项目的描述、标签、创建时间、更新时间、是否核心项目、数据大小和成员信息。 图3 项目概览 查看项目详细信息 单击项目名称，进入项目“设置”页面。您可以在该页面，查看项目的数据存储量、作业总量、流程数量和应用数量，修改项目是否核心项目。 同时，可以查看项目的基本信息、数据控制信息和成员信息。
暂不支持用户设置部分Nextflow配置项 对于dag， timeline， report,，trace配置，医疗智能体（EIHealth）平台会默认开启并且指定相关路径，会覆盖用户侧配置，可以在作业详情页面查询和下载相关信息。相关信息可参考https://www.nextflow.io/docs/latest/tracing
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