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success Boolean 相似度计算是否成功。 similarity Float 配体对之间的相似度。 最小值:0 最大值:1 reason String 相似度计算失败的理由。 最小长度:1 最大长度:512 请求示例 无 响应示例 状态码: 200 查询配体相似性图计算任务成功响应。
false } ] } 响应示例 状态码: 201 配体相似度图任务创建成功响应。 { "id" : "c05ebc2029c24699af2354f67391604c" } 状态码 状态码 描述 201 配体相似度图任务创建成功响应。 错误码 请参见错误码。 父主题: 药物通用接口
删除配体相似性图计算任务 功能介绍 删除配体相似性图计算任务。 URI DELETE /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/similarity-graph/{task_id}
输入小分子。最终以SMILES为准。 选择算法:可以选择ECFP4 Tanimoto相似度或者骨架搜索。ECFP4 Tanimoto相似度是通过ECFP4指纹计算Tanimoto相似度来搜索相似度比较高的小分子。骨架搜索是通过设置分子骨架搜索具有相同骨架的分子。 选择数据库:最多可选择10个数据库。
File 文件流对象 name 是 String 供应商名称 最小长度:1 最大长度:30 响应参数 无 请求示例 设置供应商配置,设置名称,上传图片 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/system/vendor-config
的分子数过少,建议可以适当放宽强约束的条件设置,比如相似度可以放宽到0.3~1.0。如果分子较易优化,优化后的分子相似度较高,新颖性较低,建议可以适当收紧强约束的条件设置,比如相似度可以收紧到0.3~0.7等等,正常情况下相似度设置按照默认即可。 弱约束:优化后的小分子不必要满足
获取供应商logo和名称设置 使用get命令获取供应商logo和名称配置,默认将供应商logo图片下载到本地路径。 命令结构 health get vendor-config [flags] # 其中vendor-config可简写为vc 命令示例 本节以Windows为例介绍e
”。一般私密数据不建议用此方法。 目前仅支持访问用户个人OBS下的链接,不支持读取其他用户公共读的链接。 上传待检测的图片 请参见OBS文档上传对象。 获取图片URL 请参见OBS文档获取对象URL。 父主题: 附录
最大长度:1024 scaffold 否 String 分子骨架表达式。 最小长度:1 最大长度:1024 top_n 否 Integer 最相似的top_n个。 最小值:1 最大值:1000 缺省值:100 databases 否 Array of strings 可供搜索分子的公共数据库名称列表。
yter Notebook的下一代产品,可以使用它编写Notebook、操作终端、编辑MarkDown文本、打开交互模式、查看csv文件及图片等功能。 可以说,JupyterLab是开发者们下一阶段更主流的开发环境。JupyterLab支持更加灵活和更加强大的项目操作方式,但具有和Jupyter
生成相互作用2D图 计算配体间的3D结构差异 创建配体文件预览任务 查询配体文件预览任务 删除配体文件预览任务 创建配体相似性图计算任务 查询配体相似性图计算任务 删除配体相似性图计算任务 根据center、size、padding参数生成可渲染的口袋文件内容 根据表面离散点坐标集生成可渲染的文件内容
路径上的,删除该条待计算路径。 图2 添加或者删除待计算路径 图3 选择配体对 返回相似度后默认全勾选,您可以进行勾选或去除勾选要计算的路径,如果未勾选,则后面就不会对其进行FEP计算。在相似度返回之前,您也可以直接选择配体对进入下一步。 图4 选择计算路径 单击“下一步”,进入FEP设置页面,设置相关参数。
结果页面支持对生成分子进行查看详情、查看3D结构、下游分析(分子优化及合成路径分析)、与原始分子属性对比(仅支持片段优化的属性对比)、查看分子与靶点的2D相互作用、下载2D相互作用图片,下载3D分子结构等多项功能。 支持按照相互作用力进行高级筛选,单击进行条件配置。 可以以列表的形
里面进行设置。“最小化”指的是所设置的属性越小越好,与最大化相反,也是只能在弱约束里面进行设置。 相似度分数,是利用ECFP4分子指纹计算生成后分子与原始分子的Tanimoto相似性。我们设置了禁止优化列表,禁止以高毒性为优化目标的属性优化,列表为:hERG Blockers,H-HT,DILI,AMES,Skin
特殊符号(多个特殊符号不能连续),以字母或数字结尾。 类型 流程。 标签 设置发布流程的标签。 最多支持设置5个标签。 短描述 为发布的流程设置的简要描述。 图片 展示在资产市场的图片。要求如下: 格式:svg,png,jpg,jpeg 尺寸:16 * 9 大小:不超过20KB 描述 针对此流程的相关描述。 单击“立即发布”。
划线,下划线和点号。 类型 数据。 标签 设置发布数据的标签。 最多支持设置5个标签。 短描述 为发布的数据设置的简要描述。 图片 展示在资产市场的图片。要求如下: 格式:svg,png,jpg,jpeg 尺寸:16 * 9 大小:不超过20KB 描述 针对此数据的相关描述。 单击“立即发布”。
特殊符号(多个特殊符号不能连续),以字母或数字结尾。 类型 应用。 标签 设置发布应用的标签。 最多支持设置5个标签。 短描述 为发布的应用设置的简要描述。 图片 展示在资产市场的图片。要求如下: 格式:svg,png,jpg,jpeg 尺寸:16 * 9 大小:不超过20KB 描述 针对此应用的相关描述。 单击“立即发布”。
划线,下划线和点号。 类型 镜像。 标签 设置发布镜像的标签。 最多支持设置5个标签。 短描述 为发布的镜像设置的简要描述。 图片 展示在资产市场的图片。要求如下: 格式:svg,png,jpg,jpeg 尺寸:16 * 9 大小:不超过20KB 描述 针对此镜像的相关描述。 单击“立即发布”。
测量、测量距离、角度、二角面等。 结构叠合,将不同结构叠合在一起,用于比较结构差异。 输出指定蛋白口袋的位置及大小,用于分子对接。 导出不同分辨率的图片文件。 播放与制作分子动力学轨迹动画。 父主题: 通用工具
smiles String 分子SMILES表达式 source String 分子所属的数据库来源 score Float 分子与查询分子的相似度 props Array of objects 分子ADMET属性值列表 请求示例 无 响应示例 状态码: 200 分子搜索任务查询成功响应