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快速创建一个kubernetes集群 04 使用 EIHealth提供了个性化分析流程的搭建和管理操作。您可以将生物信息学软件封装为应用,并将其编排调度,形成自定义分析流程。 准备工作 1. 购买服务 2. 获取认证信息 3. 下载命令行工具 4. 命令行工具初始化 用户管理 1. 创建子用户 2. 添加项目成员和权限
登录盘古辅助制药平台,选择“AI模型”。 图1 AI模型 单击“创建模型”,设置相关参数信息。 表1 参数说明 参数 说明 名称 模型名称。 长度为5-32个字符,首位需以英文字母开头,仅可以使用字母、数字、下划线“_”和中划线“-”和空格。 描述 设置模型的描述信息。 基模型 设置基模型,基模型与分子描述符有关。选择不同的基模型,分子描述符不一样。
镜像 如何搭建Docker环境 如何将生物信息学软件封装为镜像并上传
5],单个标签最大长度32字符,支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线,且不能以空格开头或者结尾。 最小长度:1 最大长度:32 数组长度:0 - 5 upstream_job_info 否 String 上游作业信息。 最小长度:1 最大长度:10240 表5 TargetOptReceptor
单个文件夹名称不能包含以下字符: \ / : ; * ? < " > |。 文件夹的绝对路径总长度不能超过1023字符。 文件夹名称不能以英文句号(.)或斜杠(/)开头或结尾。 不能包含两个以上相邻的斜杠(/)。 文件夹名称不能以中划线(-)开头。 多层文件夹不能超过45层。 数
Nextflow作业管理命令 启动作业 查询作业 删除指定作业 重试作业 停止作业 获取任务信息
第1部分描述了蛋白质与配体小分子的结合能大小,以及该蛋白质在所有配体小分子的对接结果的均值和标准差。 第2部分描述了配体小分子信息,注释结果如下。 分类:该小分子的在DrugBank中分类信息。 化学式:小分子的化学式。 XLOGP3:小分子的脂溶性logP。 TPSA:小分子的拓扑极性表面积。 靶点:小分子的靶点。
准备工作 购买服务 购买存储套餐包 购买系统资源 获取认证信息 父主题: 用户指南(基因平台)
配置命令行工具 步骤1:获取认证信息 步骤2:获取命令行工具 步骤3:初始化配置
配额说明 为防止资源滥用,平台限定了各服务资源的配额,对用户的资源数量和容量做了限制。 如果当前资源配额限制无法满足使用需要,您可以申请扩大配额。 EIHealth平台应用的基础设施如下: 统一身份认证(IAM) 容器镜像服务(SWR) 对象存储服务(OBS) 关于如何查看配额,如何申请扩大配额,请参见“《用户指南》
docker images [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --name -n 否 查询指定镜像名下的所有tag信息,支持模糊查找。 --type -t 否 查询某个类型的镜像,可选APP、NOTEBOOK、OTHER。 --project 无 否 指定
模板描述 最小长度:0 最大长度:1024 columns 是 Array of DatabaseColumnDto objects 数据库列信息 数组长度:1 - 100 表4 DatabaseColumnDto 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String 列名 最小长度:1
而为后续的药物机制研究、临床试验提供线索。同时,该研究成果以封面杂志发表在化学信息学领域国际顶级期刊《Journal of Chemical Information and Modeling》(化学信息与建模)2020年12月新冠特刊中。 论文链接:https://doi.org/10
创建notebook 获取notebook详情 更新notebook 删除notebook 启停notebook 获取notebook鉴权信息 获取notebook工作环境 父主题: notebook开发环境
资产管理 获取资产列表 获取属性值列表 查询资产详情 查询资产版本详情 更新资产指定版本的信息 删除资产指定版本 操作资产发布状态 父主题: 资产市场
传学修饰等重要的生物学问题。 本示例中NGS流程基于医疗智能体(EIHealth)平台搭建,流程以fastq格式数据作为输入,对碱基的质量信息进行评估,判断可靠程度,通过质控、比对、变异检测等步骤,最终输出包含样本SNP、INDEL的VCF文件。 该案例介绍NGS的搭建步骤,涵盖
来源模板id creator String 创建者 columns Array of DatabaseColumnDto objects 数据库列信息列表 create_time String 创建时间 primary_key String 主键 is_prefab Boolean 是否是预置模板
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数据作业管理 获取数据作业列表 获取数据作业详细信息 删除数据作业 取消数据作业 重试数据作业 获取数据作业执行日志 下载数据作业执行日志 父主题: 数据管理
自定义属性的ID(API侧) 最小长度:1 最大长度:64 prop_definition 否 PropDefinition object 属性定义的元信息 表5 PropDefinition 参数 是否必选 参数类型 描述 id 否 String 属性业务侧ID 最小长度:1 最大长度:128