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图1 “OBS”标签代表数据引用来源为OBS桶 单击“确定”,保存作业信息。 配置输入和依赖数据 NGS流程中涉及的输入、输出和依赖数据如表1所示。配置数据前,请先参考上传数据,上传原始Fastq文件和依赖数据。 如果在创建应用时打开了“并发”开关,可以设置多个参数值,批量执行作业。
destdir 无 是 目的路径。 --rename -e 否 重命名,上传文件时可选。 --recursive -r 否 递归上传文件夹中所有的文件和子文件夹,上传文件夹时必选。 --force -f 否 强制操作,不进行询问提示,上传文件夹时可选。 --flat -l 否 上传文件夹时,
若确实存在路径需要包含多个文件或目录,可参考如下方案解决。 以下图为例,首先调整应用的输入参数为input-a和input-b,分别表示两个路径存在包含关系的目录(/test/sub和/test )。 然后修改应用的镜像启动命令如下即可。 cp -rf ${input-a} ${output};
设置名称匹配模式(include、exclude)和时间匹配模式(timeRange),对对象名以“/”结尾的对象也生效。 --o -o 否 生成结果清单文件的文件夹,命令执行完成后,会在该文件夹下生成结果清单文件(可能包含成功结果、失败结果和警告结果三个文件),默认为运行obsutil命令的用户目录的子文件夹
64],允许大小写字母、数字、空格、下划线(_)和中划线(-),只能以数字或字母开头。 最小长度:5 最大长度:64 labels 否 Array of strings 标签,取值范围[0,5],单个标签最大长度32字符,支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线,且不能以空格开头或者结尾。 最小长度:1
L文件、查看监控。如果并发执行了多个作业,则会产生多个子任务。 对于执行失败的作业,鼠标指向作业状态,在弹出的提示框中可以查看“失败信息”和“失败原因”。同时,使用不同颜色提示执行状态,特别是对于由多个应用构成的分析作业,通过颜色方便地区分应用的执行状态。 绿色:运行成功。 红色:运行失败。
面。 在创建扩容策略页面配置相关信息。 表1 参数说明 参数 说明 策略名称 设置策略名称。策略名称长度1-64,只支持字母,数字,中划线和下划线。 如果从操作列“更多>配置扩容策略”进入创建页面,策略名称会有默认值,默认名称会携带规格信息。 计费模式 按需计费。扩容的节点只支持按需计费。
ReceptorDrugFile object 靶点文件。 bounding_box BoundingBoxDto object 结合口袋,包含口袋中心位置和尺寸大小。 remove_ion Boolean 去除受体中的离子。 缺省值:true remove_water Boolean 去除受体中的水分子。