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用户指南（基因平台） 欢迎使用医疗智能体服务 关键概念 准备工作 用户管理 配额管理 系统设置 项目管理 数据管理 数据库管理 镜像管理 工具管理 作业管理 Nextflow 资产市场 开发环境（Notebook） 大规模药物虚拟筛选
当作业中部分task无加速，部分io加速时，当性能加速点设置为不可调度时，整个作业处于等待中状态。 图12 性能加速节点信息 购买数据库 使用数据库功能前，需要先购买数据库，数据库只能购买一个。 在“数据库”页面，单击“购买数据库”。 选择“数据库规格”、“性能规格”、“磁盘加密”、“计费模式”、“购买时长”、“购买数量”。
最小值：1000000000000 最大值：9999999999999 key_word 否 String 关键字，支持在display_info字段中内容的模糊搜索。 最小长度：0 最大长度：128 sort_dir 否 String 排序规则，目前默认时间降序。 缺省值：DESC sort_key
系统管理 计算资源扩缩容 计算资源管理 数据库资源管理 用户管理 作业清理配置 标签管理 消息中心管理 节点标签管理 医疗平台信息获取 性能加速资源管理 资源监控数据获取 存储资源查询 系统配置和供应商配置 系统配额及资源使用情况获取 父主题： API（医疗智能体平台）
计算资源管理 购买计算资源 查询计算资源 删除计算资源 获取节点剩余配额 查询计算资源规格 关闭计算资源 重启计算资源 启动计算资源 修改计算资源调度信息 查询计算资源调度信息 查询bms计算资源显卡id列表 获取EVS配额及使用情况 父主题： 系统管理
API（盘古辅助制药平台） CSS集群管理 药物通用接口 药物数据库管理 药物作业管理 自由能微扰作业管理 分子对接作业管理 分子合成路径规划作业管理 分子优化作业管理 靶点口袋发现作业管理 靶点口袋分子设计作业管理 分子属性预测作业管理 分子搜索作业管理 分子生成作业管理 CPI作业管理
于自由能微扰计算。平衡模拟时长=时间步长×平衡步数/1000，单位为ns。时长增加，作业运行时间延长。 λ个数：默认值20，输入范围为2-30。自由能微扰的窗口数量。 名称：可修改，修改后左上角也同步修改。长度为5~64个字符；仅可以使用字母、数字、下划线“_”、中划线“-”和空格；首位只能以数字或字母开头。
请求示例 创建靶点口袋发现作业，作业名称为demo-job， 受体文件为project:/dir/file，时间步长为0.001ps，最小化步数为20000，预平衡时间为100ps，口袋发现时长为50ns，表面原子离散点数量为30，探针半径1.4A。 https://{endpoint}
txt文件，保存为txt文件时，其内容需为yaml格式。 修改应用yaml模板。 在本地编写模板，模板中的参数与在EIHealth平台新建应用过程一致。 修改yaml模板时，详细的命令和参数请参见应用配置文件说明。 # 详情说明可参考API文档中应用管理-创建应用 app: id:
yaml或.txt文件，保存为txt文件时，其内容需为yaml格式。 修改流程yaml模板。 在本地编写模板，模板中的参数与在EIHealth平台新建流程过程一致。 修改yaml模板时，详细的命令和参数请参见流程配置文件说明。 # 详情说明可参考API文档中流程管理- 创建流程 workflow:
创建分子生成作业，输入方式为分子表达式，作业名称为demo-job，分子文件为project:/dir/file，靶点设置的受体文件为project:/test.pdb，口袋中心位置为[0,0,0]，口袋尺寸大小为[500,500,500]，设置弱约束为eye_corrosion，类型为布尔值，值
)。更新流程时，流程名称不支持修改。 最小长度：1 最大长度：56 version 是 String 流程版本，取值范围[1,24]，以小写字母或数字或大写字母开头，允许出现中划线，必须以小写字母或数字或大写字母结尾。更新流程时，流程版本不支持修改。 最小长度：1 最大长度：24
通过设置商标您可以自定义平台Logo和标语。设置商标功能只有管理员用户可进行操作。 在平台右上角用户名中选择“设置商标”，设置平台Logo和标语。首次修改时，需同时修改商标和标题。 图1 设置商标 父主题： 系统设置
设置成员角色 单击“确认”，将用户添加至项目中。 移除、修改项目成员 操作步骤 单击项目名称，进入项目“设置”页。 单击“操作”列“修改”，重新设置项目成员的角色。 详细项目成员角色和权限介绍请参见成员角色和权限。 图7 移除、修改项目成员 选中成员，单击“移除”，将成员从项目中移除
据，创建、获取、删除、恢复归档数据，也可以对数据作业执行获取、删除、重试、取消操作。 数据库管理 您可以使用该工具创建、获取、删除和导入数据库模板，创建、获取和删除数据库实例，也可以引用数据库。 镜像管理 您可以使用该工具对镜像执行标记、上传、下载、查询、导入、更新和删除标签等操作。
是配套EIHealth平台，为EIHealth平台各功能组件提供命令行管理工具。借助此工具，可以辅助您对EIHealth平台项目中数据、应用、流程和作业资源进行管理和使用。 操作步骤 下载命令行工具。 安装命令行工具。 本示例中以Windows系统为例，介绍安装命令行工具的方法。
创建靶点优化作业，作业名称为demo-job，受体文件为project:/dir/file，配体文件为project:/dir/file，时间步长为2fs，温度为300k，能量最小化步数为10000，nvt为200ps，npt为500ps，平衡步骤模拟时长为50ns。 https://{endp
选择配体分子和受体蛋白 设置数据库。 数据库功能可以将任务运行过程中产生的数据文件按照模板生成数据库。 数据库名称：数据库的名称。 输出文件格式：可以将流程生成的分子对接结果，保存为.txt、.csv或.vcf格式。使用“Docking Summary”流程时，保存格式为.txt。 相对路
--input-file -f 否 输入参数对应的文件路径（本地路径），该参数与流程中的输入文件路径对应，通过修改input-file，修改输入数据。 选择时，input和input-file二选一。 格式为：{"task0": {"input-1": "datapath"}, "task1": {"inputs":
项目成员和权限 盘古辅助制药平台以项目为粒度对数据、作业进行分组。以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。 添加项目成员 移除、修改项目成员 成员角色和权限 添加项目成员 前提条件 平台管理员首先通过“用户管理”功能添加平台用户，才能将该用户添加至项目中。 创建用户的详细方法请参见创建平台用户。
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