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它提供了基于RDMA之上的IP网络模拟层,允许应用无修改的运行在InfiniBand网络上。但是,IPoIB性能比RDMA通信方式性能要低,大多数应用都会采用RDMA方式获取高带宽低延时的收益,少数的关键应用会采用IPoIB方式通信。 无修改:指运行在IP协议上的应用不需要作任何修改,即可适配IB网络运行。
务器。Linux操作系统时为root用户的初始密码,Windows操作系统时为Administrator用户的初始密码。密码复杂度需满足表2要求。 Windows裸金属服务器不支持选择密码登录方式。 表2 密码规则 参数 规则 样例 密码 密码长度范围为8到26位。 密码至少包含以下4种字符中的3种:
在HPC集群上运行Platform MPI 操作场景 该任务指导用户在ECS集群(以CentOS7.3为例)上运行Platform MPI应用(以版本platform_mpi-09.01.04.03r-ce为例)。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。
裸金属服务器场景典型应用 2017-12-15 第三次正式发布。 修改 创建支持IB网卡的弹性云服务器 2017-09-30 第二次正式发布。 增加 IPoIB功能简介 Intel MPI 在HPC集群上运行Intel MPI 配置ECS集群互相免密登录 修改 配置单个ECS免密登录 2017-07-11
安装和使用Spectrum MPI 操作场景 本节指导用户在BMS集群上安装和使用Spectrum MPI应用(以版本10.01.01为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 背景信息 IBM Spectrum MPI v10.1版本当前支持的操作系统列表如下: IBM
执行以下命令,在ECS集群运行Intel MPI,。 以两台ECS为例: # mpirun -perhost 2 -machinefile hostfile -np 12 /root/intel_hello hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下。
前提条件 创建镜像需选择ECS系统盘镜像。 需修改镜像属性才能在ECS创建界面的C6h规格中选择到相应的镜像。 镜像获取 请联系技术支持进行操作。 创建系统盘镜像 请使用镜像文件创建系统盘镜像,需注意镜像用途选择ECS系统盘镜像如图1,选择启动方式为UEFI图2,否则系统无法启动。 图1
虚拟私有云(VPC) 同一个HPC场景的云服务器,都位于同一个VPC中,并且需要使用VPC中的子网和安全组进行相关的网络安全隔离。 创建虚拟私有云和子网 修改虚拟私有云基本信息 镜像服务(IMS) 可以使用公共镜像、私有镜像、共享镜像创建高性能计算的云服务器。 也可以将已有的HPC场景的云服务器创建私有镜像。
lammps-2Aug18/src vi MAKE/Makefile.mpi 根据图1、图2,修改红框标识中的内容。其中,版本号需根据实际情况进行填写。 只修改图1、图2中红框标识的内容。 图1 修改Makefile文件01 图2 修改Makefile文件02 执行以下命令,编译lammps,并将当前目录
/etc/hosts 添加的内容为集群中所有ECS的私网IP地址和主机名,例如: 192.168.0.1 ecs-ff-0001 192.168.0.2 ecs-ff-0002 .. 执行以下命令,ssh方式登录本节点,验证是否可以不输入密码登录ECS。其中hostname1为本主机名。 $ ssh
社区OpenMPI 操作场景 本节指导用户安装和使用社区OpenMPI(以3.1.1版本的OpenMPI为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装HPC-X工具套件。 下载需要的HPC-X工具套件以及OpenMPI。 使用社区OpenMPI时,需要同时使用Mellanox的HPC-X
依次登录集群中所有BMS,重复执行步骤1.2~步骤1.3,关闭所有BMS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台BMS, 执行以下命令,添加hosts配置文件。 # vi /etc/hosts 添加的内容为集群中所有BMS的私网IP和主机名,例如: 192.168.1.138 bms-arm-ib-0001
MPI。 以两个BMS为例: $ mpirun -np 2 --pernode -hostfile hostfile /home/rhel/hello 图3 集群上运行社区OpenMPI成功 hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下。
--hostfile hostfile hostname 图1 在集群中运行hostname命令 修改hostfile,运行MPI benchmark,运行时指定hostfile文件路径。 以两个弹性云服务器为例: # mpirun --allow-run-as-root -np 2 -pernode
/etc/hosts 添加的内容为弹性云服务器的主机名及IP地址,例如 #cat /etc/hosts 192.168.1.3 vm1 192.168.1.4 vm2 ... 执行以下命令,添加hostfile文件。 # vi hostfile 添加的内容为集群中参与测试的弹性云服务器的主机名。
依次登录集群中所有BMS,重复执行步骤1.2~步骤1.3,关闭所有BMS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台BMS, 执行以下命令,添加hosts配置文件。 # vi /etc/hosts 添加的内容为集群中所有BMS的私网IP和主机名,例如: 192.168.1.138 bms-arm-ib-0001
"enp177s0 0" "" ofa-v2-cma-roe-enp177s0为配置名称,可以修改,但是要保持所有节点一致,并且后面starccm使用platform方式启动时候需要使用该配置名称。 enp177s0为网卡名称,可以使用ip a或者ipconfig查看到。 验证Udapl(使用dtest测试RoCE网络)
安装和使用社区OpenMPI 操作场景 本节指导用户在BMS上安装和使用社区OpenMPI(以3.1.1版本为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装HPC-X工具套件。 使用社区OpenMPI时,需要同时使用Mellanox的HPC-X
4T-inletsystem-blockqian-case2.sim:算例文件。 运行参数调优下的STAR-CCM+ 端口范围修改 如果不修改,STAR-CCM+可能运行不起来。 执行以下命令修改。 sysctl -w net.ipv4.ip_local_port_range=”20000 65535”
以两台BMS为例: $ mpirun -perhost 2 -np 12 -machinefile hostfile /home/rhel/hello 图3 BMS集群上运行Intel MPI成功 hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下。