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get-docker.sh sh get-docker.sh 检查安装结果。 执行docker --version命令,如果显示如下类似信息,表示Docker安装成功。 图1 Docker安装成功 步骤2:制作镜像 方法1:直接下载官方的FastQC镜像。 执行如下命令下载FastQC镜像。
赖的运行环境的镜像封装,应用可以独立使用,也可以将多个应用编排入流程串联使用。 您可以在项目的应用列表中,查看隶属于该项目的应用,也可以通过搜索应用名称快速查找所需应用。应用列表展示了应用的名称、版本、创建者、修改时间、创建时间和可执行的操作。 详细的应用创建和使用请参见工具管理。
数据管理 创建文件夹 查询数据列表 获取桶存量信息 复制项目数据 导入项目数据 导入网上数据 引用项目数据 订阅资产市场数据 上传数据文件 批量删除项目数据 获取桶列表 查询项目级数据权限控制策略 设置项目级权限控制策略 获取数据详情 设置数据对象策略 发布数据资产 父主题: 数据管理
状态码: 200 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 data_points Array of DataPointDto objects 监控数据列表 metric_name String 监控指标名称 resource_id String 监控资源id 表5 DataPointDto
cm/s。 结果解释:大于-5.15 log cm/s代表具有较好的渗透性。 MDCK Permeability: MDCK细胞的表观渗透系数Papp用来估计药物进入人体的吸收效率。单位为cm/s。 结果解释:大于20 x 10-6cm/s代表具有较好的渗透性,2~20 x 10-6cm/s具有一般渗透性,小于2
data 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 database_id 是 String 数据库id。 最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2 请求Header参数
n。 最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 column_values 是 Array of ColumnValueDto objects 列及对应值列表 数组长度:1 - 100 表4 ColumnValueDto 参数 是否必选
最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 paths 是 Array of strings 删除的数据ID集(项目名称:/路径) 最小长度:1 最大长度:2000 数组长度:0 - 50 响应参数 状态码: 202 表4 响应Body参数 参数
Array of strings 标签列表 最小长度:1 最大长度:32 数组长度:0 - 5 paths 是 Array of strings 路径列表 最小长度:1 最大长度:2000 数组长度:1 - 1 响应参数 状态码: 202 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述
_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 database_id 是 String 数据库id。 最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2 请求Header参数
例如,gene-assets项目中的output文件夹,输出路径格式为/gene-assets/output。 图3 流程参数 将左侧应用列表中的应用,拖拽至画布中。对于由多个应用构成的流程,通过连接线指定输入、输出关系进行链接。 鼠标移动至应用中,会出现一个“空心圆”,拖动“空心圆”,将连接线移动到目标应用上。
/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/preview 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128
projects/{eihealth_project_id}/drug-common/receptor/fasta-preprocess 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128
cfs和discvrseq-variantqc应用构成。在创建应用前,请先制作并上传应用所需的镜像。搭建NGS流程所需的镜像和版本如表1所示。 表1 NGS流程镜像信息 NGS流程步骤 描述 依赖镜像及版本 镜像下载命令 Read Quality 对测序得到的fastq数据进行质控。
/v1/{project_id}/drug/databases 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述
alth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/interaction2d 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128
文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:0 最大长度:10000000 响应参数 状态码: 200 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 smiles String 分子SMILES表达式。 最小长度:1 最大长度:512 请求示例 配体格式转换为SMILES,若配体文件中存在多个分子,则只取第一个返回。
保留期与欠费 套餐包到期后,如果账号欠费,会根据“客户等级”和“订购方式”定义不同的保留期时长,保留期内您将不能进行资源访问,保留期内资源处理和费用详见“保留期”。保留期满仍未续订或充值,数据将被删除且无法恢复。 当平台处于冻结状态,且资源不再使用,您可以进入EIHealth控制
管理员,项目转移后,原用户角色由所有者转变为管理员。 分享:将项目分享给其他用户,并设置项目角色。项目分享后,项目将出现在被分享者的项目列表中。 删除:删除项目。需先冻结项目,才能执行删除操作。 恢复:删除的项目在删除后6天内都可以恢复成“可用”或者“冻结”状态。 图1 项目管理
/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/{job_id}/cluster 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128