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最大长度:10000000 表7 TargetOptLigand 参数 是否必选 参数类型 描述 file 是 ProbeDrugFile object 配体文件。 force_field 否 String 配体力场, 支持选择gaff, gaff2。 缺省值:gaff 表8 ProbeDrugFile
最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 basic_info DrugJobDto object 作业基本信息。 smiles String 分子SMILES表达式。 最小长度:1 最大长度:512 molecule_file
/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/datas/import 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。
upstream_job_info String 上游作业信息。 表5 Progress 参数 参数类型 描述 overall Float 整体进度。 estimated_finish_time Long 预计结束时间,毫秒。 表6 TargetOptReceptor 参数 参数类型 描述
可减少网络延迟,提高访问速度。 平台用户权限限制 EIHealth平台支持两种类型的用户管理,可以帮助您安全地控制平台的访问和使用权限。 表1 EIHealth平台用户管理类型 类型 说明 系统级别用户管理 系统级的角色配置,可创建平台的子用户,并为其分配权限。详细介绍请参见用户管理。
用OBS桶中数据用于本地盘加速,可能会导致作业运行失败。 图1 “OBS”标签代表数据引用来源为OBS桶 单击“确定”,保存作业信息。 配置输入和依赖数据 NGS流程中涉及的输入、输出和依赖数据如表1所示。配置数据前,请先参考上传数据,上传原始Fastq文件和依赖数据。 如果在创
入门实践 表1 常用最佳实践 实践 描述 基于二代测序的基因组突变检测 本最佳实践提供了通过命令行工具上传数据、上传镜像后,在医疗智能体平台搭建NGS流程,执行分析作业及批量执行NGS分析。 新型冠状病毒(COVID-19)虚拟药物筛选 本最佳实践介绍如何使用EIhealth平台
应用场景 靶点发现 在靶点发现阶段,提供蛋白质结构预测、靶点口袋发现功能。 苗头化合物发现 在苗头化合物发现阶段,提供分子对接、口袋分子设计,分子属性预测功能,在分子对接中,预置了大量的分子库可供选择。 先导化合物优化 在先导化合物优化阶段,提供分子优化、靶点口袋分子设计(骨架跃
单击受体结合能框,跳转到单受体对多配体的结果表页面,可以下载全量及单条CPI预测结果。 如果需要下载多个结果,可以选择结果后,单击左上角的“下载”。如果需要下载单条数据,单击数据操作列的“下载”即可。 下载操作将会产生流量费用,具体可参考计费说明。 单个受体对多个配体的结果页面有列表视图、卡片视图,支持
/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/backups/{backup_id}/restore 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 backup_id 是 String 归档ID 最小长度:1 最大长度:128 eihealth_project_id
状态码: 200 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 residues Array of ResidueDto objects 受体中的氨基酸残基列表。 ligands Array of ReceptorLigandInfoDto objects 受体中的配体列表。 数组长度:0
DrugFile object 配体文件。 residues 否 Array of strings 残基列表,当识别模式为残基时提供。 最小长度:4 最大长度:16 数组长度:1 - 32 表4 ReceptorDrugFileReq 参数 是否必选 参数类型 描述 source 是 String
状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 basic_info DrugJobDto object 作业基本信息。 smiles String 分子SMILES表达式。 最小长度:1 最大长度:1024 scaffold String 分子骨架表达式。 最小长度:1
/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/mol-docking 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128
--limit -l 否 代表当次请求获取的最大查询条数(默认为10)。 --offset -o 否 偏移量,从第几条数据开始查询,默认为0。 --event -e 否 获取作业事件或者作业某一task事件,单独使用表示获取作业事件;与--task一起使用表示获取某一个task事件,并同时输出task实例列表。
在平台镜像管理列表中,将已上传的镜像分类为“NOTEBOOK”。 步骤4:创建并使用Notebook 在医疗智能体平台选择“项目管理 > 开发”,进入Notebook管理页面。 图1 创建Notebook 单击“创建Notebook”,并参考如下的参数说明进行填写。 表1 参数说明 参数名称
/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/diff3d 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128
最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 source_project_id 是 String 源项目id 最小长度:1 最大长度:128 source_databases 是 Array of DatabaseSrcReq objects 源数据库列表 数组长度:1
天后自动清除数据,查询时间最多15天。 单击策略名称前面的箭头,可以查看策略的关联节点列表、执行规则和伸缩历史记录信息。 图6 查看节点执行规则 图7 查看节点伸缩历史 图8 查看关联节点列表 配置缩容策略 缩容策略只支持统一配置,且不会对手动购买的计算资源节点缩容。 在平台右上
ct-Token的值即为Token。 响应参数 状态码: 200 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 data_points Array of DataPointDto objects 监控数据列表 表5 DataPointDto 参数 参数类型 描述 timestamp