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在使用Nextflow时，作业运行失败的可能原因 由于Nextflow支持的特殊字符继承了Nextflow原有特性，因此请排查参数值，或者选择的数据名称，或者路径中带的特殊字符是否符合Nextflow原有特性。 建议启动并发作业数最多为8个。 父主题： Nextflow
workflow ID [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 不涉及 否 流程ID，指定后获取流程ID对应的流程详情。不指定时，获取的是流程列表。 --param-file -p 否 参数文件保存路径，以yaml格式保存。如果没指定，则不会显示和保存参数信息。
取、删除中间文件的时间。 流程针对GATK4中的限速步骤，进行了系统的优化加速。流程从contig-file中提取contig，根据contig下发对应的任务，并依据不同任务，指定并行下发的任务数，以降低流程整体的运行时间。 流程执行信息 NGS流程由fastp、bwa-mem、
Agent，被设计为具有独立思考和行动能力的AI程序，只需提供一个研究目标和数据路径，即可自适应生成一个任务序列执行分析任务。 生信智能体AI Agent可以应对激增的多组学数据分析需求、高成本的生物信息学培训和满足不同应用场景的个性化需求，为多领域生命科学研究提供高效、定制化的数据分析支持。 使用g
获取子任务中实例的事件 功能介绍 获取子任务中实例的事件 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/jobs/{job_id}/tasks/{task_name}/instances/{instance_name}/events
优先级：运行优先级，分为0~9级，优先级高的作业会被优先执行（该特性规划中，暂未上线）。 计算节点标签：作业会调度到含有相应标签的计算节点上。 当应用也配置了标签，如果应用和作业的计算节点标签在同一计算节点上，则应用调度至该计算节点上；应用和它的作业，不管节点标签是否一致，都会被调度到应用的节点标签所对应的计算节点上。
将gatk-markduplicates的输出参数markduped-bam与gatk-bqsr、gatk-applybqsr的输入参数markduped-bam相连。将gatk-bqsr的输出参数recal-table与gatk-applybqsr的输入参数recal-table相连。
Viewer打开，会出现蛋白显示不完整的情况，如下图所示。 此时可将受体文件中的REMARK行进行删除，即可解决该问题。 父主题： 盘古辅助药物
用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头，从而通过身份认证，获得操作API的权限，获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度：1 最大长度：32768 响应参数 无 请求示例 获取指定归档的全数据清单 https://eihealth
描述 value Double 最值 row_number Long 最值所在的行数 column_name String 最值所在的列名 row_name String 最值所在的行名 请求示例 查询作业的最值信息 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud
4.1.9.0 . 详细的Dockerfile指令请参见Dockerfile参考。 上传镜像 请依据表1提供的镜像下载命令下载搭建NGS流程所需的镜像。并依据制作bwa-mem镜像和制作gatk-haplotypecaller镜像制作镜像。制作好后的镜像如图1所示，请按照以下步骤将镜像上传至EIHealth平台。
导入应用”的方法，导入至自己的项目中使用。 流程 EIHealth中的分析流程包含分析过程中所需应用的执行信息和数据的输入、输出等参数定义。 分析流程至少由一个应用组成，在多个应用构成的流程中，一个应用的输出作为另一个应用的输入，流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流。
配体格式转换为SMILES 生成相互作用2D图 计算配体间的3D结构差异 创建配体文件预览任务 查询配体文件预览任务 删除配体文件预览任务 创建配体相似性图计算任务 查询配体相似性图计算任务 删除配体相似性图计算任务 根据center、size、padding参数生成可渲染的口袋文件内容
平台通过云审计服务（CTS）提供操作记录的收集、存储和查询，审计操作可以设置导出用户的读操作和写操作（默认）和仅写操作（可选），保存周期可以设置需要保存的审计日志的保存周期，下载按钮可以下载最近7天内最新的1万条数据审计日志，查看按钮可以查看及下载保存的审计日志。 通过审计日志可用于支撑
X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头，从而通过身份认证，获得操作API的权限，获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度：1 最大长度：32768 表3 请求Body参数
获取子任务中实例的pod信息 功能介绍 获取子任务中实例的pod信息 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/jobs/{job_id}/tasks/{task_name}/instance
X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头，从而通过身份认证，获得操作API的权限，获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度：1 最大长度：32768 响应参数 状态码：
单击“确认”，创建一个新的项目。 项目的创建者默认拥有项目的完整权限，同时项目可以分享给其他用户，并限定其他用户的访问权限。项目角色为项目粒度权限控制，同一用户在不同的项目上可能拥有不同的角色。 创建的项目配额请参见配额管理进行查询。详细添加项目成员并分配角色的方法请参见添加项目成员。
生相互作用，继而通过适当的构象调整，得到一个稳定的复合物构象，通过分子对接确定复合物中的两个分子正确的相对位置和取向，研究两个分子的构象特别是底物构象在形成复合物过程中的变化，是确定药物作用机制，设计新药的基础。 分子对接计算是把配体分子放在受体活性位点的位置，然后按照几何互补、
3dsdf to pdbqt：将配体的sdf文件转换为pdbqt文件。 task-2-ligand smiles to 3dsdf：将配体的smiles文件转换为3dsdf文件。 task-3-receptor pdb to pdbqt：将受体的pdb文件转换为pdbqt文件。 task-4-qvina-w：分子对接。
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