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在API栏选择需要使用的服务，单击操作列的“开通服务”。 服务开通成功后，开通状态为“已开通”。 “开通服务”按钮置灰，说明您尚未认证，请先实名认证。 开通医学影像API 进入EIHealth控制台，在页面左上角切换区域“华南-广州”。 在API栏选择需要使用的服务，单击操作列的“开通服务”。
gene-assent:/DataSet/ 切换到引用数据的路径，例如引用了gene-assent项目中的DataSet数据，使用health cd命令切换到该路径，并使用health ls名称查看详细数据。 当由引用数据的路径，切换到自己项目数据时，需指明具体的路径。 health cd gene-assent:/DataSet/
若您本地有需要分析的二代基因组数据，则您可以用本地的数据。数据上传方法请参见上传数据。 若没有，可以先订阅资产市场里的示例数据进行分析，这里先用资产市场中的“人类基因组数据”和“NGS小数据集”进行分析。 图3 订阅数据 可以在“数据”列表可以看到刚刚订阅的流程。 图4 查看订阅的数据 步骤3：启动作业
EIHealth平台支持两种类型的用户管理，可以帮助您安全地控制平台的访问和使用权限。 表1 用户管理类型 类型 说明 系统级别用户管理 系统级的角色配置，可创建平台的子用户，并为其分配权限。 项目级别用户管理 资源级的角色配置，以项目为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组，以便用户
单击数据中心右上角“引用”。 选择需要引用的项目以及项目中的数据，或者选择待引用的OBS桶路径，先选择OBS桶所在区域，再选择OBS桶名称，支持选择不在同一区域的OBS桶。 图3 引用数据 单击“确定”，引用其他项目中的数据至本项目。 引用的数据和项目将显示在左侧的数据列表中。 图4 引用的数据 引用OBS
选择项目 选择创建好，并带有数据的项目。 研究名称 可自定义研究名称。 流程 选择资产市场中订阅的Docking Summary流程。 配体分子 选择上传的配体小分子文件。 受体蛋白 选择上传的受体蛋白文件夹。这里会默认用文件夹里面所有的蛋白质和配体小分子文件里面的小分子进行一一对接。
项目成员和权限 盘古辅助制药平台以项目为粒度对数据、作业进行分组。以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。 添加项目成员 移除、修改项目成员 成员角色和权限 添加项目成员 前提条件 平台管理员首先通过“用户管理”功能添加平台用户，才能将该用户添加至项目中。 创建用户的详细方法请参见创建平台用户。
单击“立即发布”。 系统跳转到“我的发布”页面，可以查看发布的数据状态。当数据发布成功后，可以在“资产市场>组织共享”中查看发布的数据。 已发布的数据不能直接编辑和删除，需下线后才能编辑和删除。 发布中的数据可以取消，取消后状态为发布失败。 已发布的数据可以订阅和下线。 同一个发布者可以发
（默认json格式）。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 获取json格式实例详情 health get
上传数据是最常用的添加数据功能，但由于网页传输大文件时存在一定的限制，所以上传数据的大小不能超过1GB。 图1 上传数据 复制数据 复制数据会从别的项目中复制一份数据到当前项目中，这里可选择的源项目需是当前账号为管理员的对应项目。如需设置项目成员，请参考用户指南中的项目成员和权限。 图2
在界面显示数据作业执行日志，需要与data-job-id一起使用。 说明： 参数--log和--file不能同时使用。 参数--log的优先级高于--file。如果命令中同时包含参数--log和--file，默认只执行--log。 --file -f 否 本地文件夹路径及自定义文件
、自由能微扰、合成路径规划功能的作业。 在“作业中心”页面，以列表形式展示了项目中作业的运行状态。您可以查看作业的名称、创建时间、运行状态、总时长、运行时长、已运行时间、预计还需时间。对于列表中的作业，支持通过作业名称、状态、类型、标签、创建时间和完成时间进行快速搜索。也可以根据
执行数据管理类操作需要项目成员具备相应的权限，详细的权限介绍请参见项目成员和权限。 数据文件的名称，不可以含有特殊字符。如果文件名包含特殊字符，将不支持下载，可通过去除文件名中的特殊字符方式解决。 查看数据作业 数据复制、数据删除等操作均为系统的异步任务，您可以在“数据作业”中查看任务的执行状态。同时，平台针对该类任务支持您在“数据中心
必填。 --current-project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 引用单个数据库实例 health import
limit_concurrency Integer 限制的并发量。 请求示例 创建自由能微扰作业，作业名称为demo-job，受体文件为project:/dir/file，配体分别为GLY:A:514和UNK1，路径图的中心配体为GLY:A:514，配体对分别为GLY:A:514和DrugBank:UNK1，
执行数据管理类操作需要项目成员具备相应的权限，详细的权限介绍请参见项目成员和权限。 数据文件的名称，不可以含有特殊字符。如果文件名包含特殊字符，将不支持下载，可通过去除文件名中的特殊字符方式解决。 查看数据作业 数据拷贝、数据删除、数据下载、数据归档、恢复数据等操作均为系统的异步任务，您可以在“消
导入流程是将隶属于其他项目中流程导入至本项目中，流程所依托的应用和镜像会同步导入。 使用“导入流程”功能，用户需是其他项目中的成员，且为其他项目的“所有者”或“管理员”。 单击“导入流程”，进入导入流程页面。 图1 导入流程 选择需要引用的项目以及项目中的流程，选择流程的版本。“导入流程名称”是选填项，可以使用原有名称，或自定义。
--cpd -C 否 生成断点记录文件的文件夹，默认为运行obsutil命令的用户目录的子文件夹.obsutil_checkpoint。 每个分段移动任务会产生唯一对应的断点记录文件并保存至该文件夹的copy子文件夹下，分段任务执行成功后，对应的断点记录文件会被自动删除；分段任务执行失败或
分子搜索 可自定义数据库，以用户输入的参考化合物结构为起点，可以按照相似度或者骨架从小分子数据库中搜索到相似结构和排序，可实现百亿级小分子的秒级搜索。 单击“分子搜索”功能卡片，进入分子搜索页面。 在配置页面，进行分子搜索配置，包括输入小分子、选择搜索算法、选择输出个数。 图1 分子搜索页面
药物数据输入格式说明 药物虚拟筛选平台的输入数据，需要输入蛋白质和配体小分子数据。参考以下数据要求，将数据上传至项目中。 输入蛋白质，pdb格式，将要进行对接的所有靶标蛋白放在一个文件夹内。 输入配体小分子，配体小分子为如下格式的txt文件。 第一列为smiles字符串，第二列为smiles名称，中间用tab键分割。
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