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约束限制 - 医疗智能体 EIHealth
com/eihealth/admet:2.0.0' } 暂不支持用户设置部分Nextflow配置项 对于dag, timeline, report,,trace配置,医疗智能体(EIHealth)平台会默认开启并且指定相关路径,会覆盖用户侧配置,可以在作业详情页面查询和下载相关信息。相关信息可参考https://www
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创建数据库实例 - 医疗智能体 EIHealth
参数 简写 是否必选 说明 instance-name 无 是 数据库实例名称。 --description -d 否 描述。 --template-id -t 是 模板id。 --skip-lines -s 否 跳过的header行数。不指定参数值时默认为0。 --delimiter
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修改扩容策略 - 医疗智能体 EIHealth
add_nodes_for_mem_rule 否 Integer 满足扩容策略中mem分配率时增加的节点数 最小值:1 最大值:50 响应参数 无 请求示例 更新扩容策略配置,更改名称为strategy_4vCPUS_8GB https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.c
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上传应用 - 医疗智能体 EIHealth
summary: 'summary' # 应用简述 取值范围[0,128] description: 'description' # 应用描述 取值范围[0,65535],后续支持markdown文本 labels:
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获取应用详情 - 医疗智能体 EIHealth
填默认使用前一级的配置,填值会覆盖更新。覆盖关系:作业->流程->应用 最小长度:0 最大长度:24 memory String 内存申请使用量,取值范围[0.1-3072],单位G,支持一位小数。对于应用,不填默认1G;对于流程和作业,不填默认使用前一级的配置,填值会覆盖更新。覆盖关系:作业->流程->应用
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上传数据 - 医疗智能体 EIHealth
NGS流程中需使用二代测序得到的原始fastq文件、参考基因组序列、参考Variants数据集。 本示例中以Windows系统命令行工具为例,介绍如何将本地数据上传到EIHealth平台。更多的命令介绍请参见命令行工具。 使用命令行工具,用switch命令进入待操作的项目。 例如,使用health
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查询自动作业模板 - 医疗智能体 EIHealth
String 触发器的列名,取值范围:[1,63] 最小长度:1 最大长度:63 judge_mode String 触发器的判断模式 枚举值: gte lte gt lt like notlike equal notequal value String 触发器的取值,取值范围:[1
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使用AutoGenome镜像 - 医疗智能体 EIHealth
环境配置:加载AutoGenome以及辅助绘图的软件包。 读取配置文件:通过json文件配置输入和输出路径。 模型训练:针对提供的数据和模型参数,AutoGenome会搜索得到最优的神经网络结构。训练过程经过模型搜索阶段和模型训练阶段,在模型搜索阶段,根据json文件中的配置参数,对于选定的模型参数会训练一定
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获取流程详情 - 医疗智能体 EIHealth
程和作业,不填默认使用前一级的配置,填值会覆盖更新。覆盖关系:作业->流程->应用 最小长度:0 最大长度:24 gpu_type String gpu架构类型,取值范围 ' '|GPU|Snt9|D310。对于流程和作业,不填默认使用前一级的配置,填值会覆盖更新。覆盖关系:作业->流程->应用
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上传镜像 - 医疗智能体 EIHealth
镜像tag名称。 --description -d 否 描述。 --type -t 否 镜像类型,可选APP、NOTEBOOK或OTHER,不填写默认为OTHER。 --chip -c 否 芯片类型,只支持X86和ARM。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。
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获取数据库模板 - 医疗智能体 EIHealth
"unique": false, "tips": "" }, { "name": "Description", "type": "String", "description": "The desciption of the drug"
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获取供应商logo和名称设置 - 医疗智能体 EIHealth
获取供应商logo和名称设置 使用get命令获取供应商logo和名称配置,默认将供应商logo图片下载到本地路径。 命令结构 health get vendor-config [flags] # 其中vendor-config可简写为vc 命令示例 本节以Windows为例介绍e
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查询流程 - 医疗智能体 EIHealth
task输出子目录,默认为空时,自动生成task-name子目录,允许在workflow中配置 inputs: # 输入参数配置,默认覆盖workflow、app中同名配置 - name: 'input_name1'
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创建应用 - 医疗智能体 EIHealth
默认使用前一级的配置,填值会覆盖更新。覆盖关系:作业->流程->应用 最小长度:0 最大长度:24 memory 否 String 内存申请使用量,取值范围[0.1-3072],单位G,支持一位小数。对于应用,不填默认1G;对于流程和作业,不填默认使用前一级的配置,填值会覆盖更新。覆盖关系:作业->流程->应用
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安装/卸载Nextflow - 医疗智能体 EIHealth
安装/卸载Nextflow 安装Nextflow Nextflow需要用户自己进行安装,安装的权限只有管理员拥有。 在平台右上角用户名中选择“系统设置”。 在“Nextflow配置”模块,单击“安装”。 图1 安装Nextflow 选择安装方式。目前支持GitHub获取和上传安装包两种方式。
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更新应用 - 医疗智能体 EIHealth
默认使用前一级的配置,填值会覆盖更新。覆盖关系:作业->流程->应用 最小长度:0 最大长度:24 memory 否 String 内存申请使用量,取值范围[0.1-3072],单位G,支持一位小数。对于应用,不填默认1G;对于流程和作业,不填默认使用前一级的配置,填值会覆盖更新。覆盖关系:作业->流程->应用
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获取作业详情 - 医疗智能体 EIHealth
description String 作业的描述 labels Array of strings 作业标签 priority Integer 作业的优先级 timeout Integer 作业执行超时时长 output_dir String 压扁后的效果,即job运行的实际配置 status
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创建自动作业模板 - 医疗智能体 EIHealth
String 触发器的列名,取值范围:[1,63] 最小长度:1 最大长度:63 judge_mode 是 String 触发器的判断模式 枚举值: gte lte gt lt like notlike equal notequal value 是 String 触发器的取值,取值范围:[1
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启动作业 - 医疗智能体 EIHealth
启动作业 通过使用create或 submit命令引用本地的配置文件,启动分析作业。 命令结构 health create job [flags] # create和submit作用相同 health submit job [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明
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获取数据库实例 - 医疗智能体 EIHealth
"unique": true, "tips": "" }, { "name": "Nsp10_6zct_pure", "type": "Double", "description": "The binding