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8TB的单个文件。 数据在上传的过程中,受网络影响可能出现损坏,上传命令默认会在上传完成后,验证项目中数据的MD5值与本地数据的MD5值的一致性,以及验证项目中数据的大小与本地数据大小一致性。 命令结构 health upload <srcdir> <destdir> [flags]
{}扩起,以$符号进行引用。 fastqc -f fastq -o ${output-dir} ${input-file} 图4 设置CPU、内存、输入输出参数 单击“立即创建”,完成fastqc应用的创建。 创建完成后的应用,将显示在应用列表中,您可以使用该应用创建分析作业。 图5
快照方式制作镜像示例: 本示例中使用华为云弹性云服务器服务(ECS)创建一台云服务器,并使用快照方式制作bwa镜像。 购买弹性云服务器。 云服务器创建成功后,在云服务器列表页,选中待登录的弹性云服务器。单击“远程登录”,输入ECS初始账号,登录ECS。 图1 云服务器列表 安装容器引擎。 启动一个空白的基础容器,并进入容器。
越偏紫色。 可以根据结合能的大小进行排序,结合能越小代表配体和受体结合越稳定。 单击结合能数值,可查看详细对接结果。 第1部分描述了蛋白质与配体小分子的结合能大小,以及该蛋白质在所有配体小分子的对接结果的均值和标准差。 第2部分描述了配体小分子信息,注释结果如下。 分类:该小分子的在DrugBank中分类信息。
请删除所有使用该应用的流程后再删除该应用。 400 eihealth.01050014 The image {0} does not match the CPU type {1}. 请检查镜像与cpu类型是否匹配。 400 eihealth.01050015 The app's command field contains
-e 否 获取作业事件或者作业某一task事件,单独使用表示获取作业事件;与--task一起使用表示获取某一个task事件,并同时输出task实例列表。 --log -g 否 本地存放task日志的路径,必须与--task一起使用以获取作业某一task的日志。 --task -a 否
源项目:显示应用隶属的项目。 输入参数:由用户在创建应用时定义。 输出路径:输出数据的存放路径,可修改。 高级参数:CPU需求、Memory需求、GPU类型、GPU需求,请按照使用需求进行设置;CPU架构、计算节点标签,不可修改。GPU包含NAIDIA架构GPU和自研的D310+ARM。选择GPU
HTTP请求方法 方法 说明 GET 请求服务器返回指定资源. PUT 请求服务器更新指定资源。 POST 请求服务器新增资源或执行特殊操作。 DELETE 请求服务器删除指定资源,如删除对象等。 HEAD 请求服务器资源头部。 PATCH 请求服务器更新资源的部分内容。当资源不存在的时
# 子任务的资源配额 cpu: 0.1C # cpu申请使用量,取值范围[0.1-128],单位C,支持一位小数。对于应用,不填默认1C;对
-i %%a echo/ ) pause 图2 批处理文件说明 如果执行NGS批量任务时需要变更不同的原始数据、参考基因序列、测序平台、文件前缀等,请参考上述批处理文件示例,将需要变更的数据补充完整。 .bat批处理文件需要和命令行工具放在同一路径下,同时,命令行工具需为登录状态。
计算机辅助药物虚拟筛选是新药早期研发的重要环节,可根据靶点蛋白和小分子药物的3D结构,计算蛋白与药物之间的结合能量,并且依托云端大算力实现超大规模筛选和成药性分析,从成千上百万的小分子库中快速筛选出与蛋白结合最紧密的候选药物,从而为药物研究和临床试验提供方向。药物虚拟筛选以项目成员为粒度
查看执行结果 分析作业的执行时间与环境资源类型、环境资源大小、处理数据大小等相关。您可以在“作业”页面查看执行结果或进行操作。提供了作业的执行状态的查看,并可对作业执行取消、删除、重试、克隆、导出操作。勾选多个作业,可以批量取消、批量删除、批量重试、批量导出。 作业执行状态如下所示。
project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 id 是 String 云服务器ID 最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是
结果解释:预测值的范围在0~1之间。 Fu: The fraction unbound in plasms,未结合血清蛋白的比例。药物与血清蛋白的结合程度越高,渗透性越差。 结果解释:未结合比例大于等于5%效果较好。 排泄(Excretion) CL: The clearance of a drug
最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 server String 服务器地址 subject_prefix String 展示名 user_name String 用户名 email String 邮箱 language
Turbo加速,在投递作业时可以选择“IO加速”。 降低通量运行,进而降低带宽、IO需求,使得带宽、IO满足生产需求。 优化软件算法,如使用内存做缓存等,降低软件的IO需求。 针对特定的项目,对带宽或IO性能进行扩容。 提交工单或联系服务技术支持。 父主题: 流程、作业
oken。 最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 server 是 String 服务器地址 最小长度:1 最大长度:128 subject_prefix 否 String 展示名 最小长度:0 最大长度:128 user_name
该流程主要完成的功能包括:整合分子对接结果,生成结合能矩阵、整合受体与分子对接产生的配体构象,进行可视化展示、对配体分子进行注释,包括:DrugBank编号、分类、化学式、XLOGP3、TPSA、靶点、Csp3比例、分子量、可旋转键数目。 RNA-Seq Analysis Based
过事件信息分析,常见有以下问题场景和对应解决方案。 0/4 nodes are available: XXX Insufficient cpu 或者 XXX Insufficient memory。该场景表示当前集群中无充足的计算资源,可以根据实际需要提前结束掉其他作业或note
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