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/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/datas/clone 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。
/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/datas/policy 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。
获取模型列表 功能介绍 获取模型列表。 URI GET /v1/{project_id}/drug-models 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 表2 Query参数
Array of strings 标签列表 最小长度:1 最大长度:32 数组长度:0 - 5 paths 是 Array of strings 路径列表 最小长度:1 最大长度:2000 数组长度:1 - 1 响应参数 状态码: 202 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述
数据归档 删除归档 获取指定归档的全数据清单 恢复归档 查询归档列表 归档数据 父主题: 数据管理
序、转录组测序表观遗传学等领域。 该流程以NGS得到的fastq作为输入,通过质控,比对等步骤,输出针对fastq的qc报告,输出STAR比对得到的bam文件。 RNA-Seq流程由fastqc、trimmomatic、star应用构成,各应用说明如表1所示。 表1 应用说明 应用名称
创建应用 登录医疗智能体平台,进入项目并选择“工具 > 应用”页签,单击“新建应用”。 图1 新建应用 依据“应用参数说明表”依次创建搭建NGS流程所需的应用。 图2 填充应用内容 对于测序得到的大量数据,如果需要批量执行NGS分析,可以选取以下任意一种方式进行批量执行: 方式一
/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/datas/{path}/policy 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。
如果msm=1则代表上传的URL是一组文件/文件夹列表(以英文逗号分隔)。如果文件/文件夹名本身包含英文逗号,请不要使用msm=1的模式。 如果msm=2则代表上传的URL是一个包含文件/文件夹列表的文件。 多文件/文件夹上传时必选,如果没有设置--recursive参数,则列表中的文件夹不会被上传。
最大长度:32768 表3 FormData参数 参数 是否必选 参数类型 描述 file 是 File 文件流对象 target_folder 否 String 目标文件夹 最小长度:0 最大长度:2000 part_number 否 String 分段序号,表示第几个文件片段 缺省值:1
/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/datas/import 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。
录组测序表观遗传学等领域。 该流程以NGS得到的fastq作为输入,通过质控,比对,得到比对后的bam文件,及对fastq和bam文件的质控报告。 NGS流程由fastp、bwa-mem、picard-insertsize、bamqc应用构成,各应用说明如表1所示。 表1 应用说明
在“项目管理”页面,您可以查看项目的数量和总存储量。 图1 项目管理 在“项目列表”中,展示了当前用户有权限访问的项目,以及项目大小、项目成员角色、所有者、状态、是否核心项目、创建时间、更新时间和可执行的操作。 图2 项目列表 查看项目详情 项目详情提供了项目中数据大小、成员、创建时间等信息,您可以通过以下两种方式查看项目信息。
/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/data-jobs/{data_job_id}/logs 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。
/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/datas/policy 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。
/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/data-jobs/{data_job_id}/cancel 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 data_job_id 是 String 数据作业id 最小长度:1 最大长度:128 eihealth_project_id
/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/data-jobs/{data_job_id}/retry 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 data_job_id 是 String 数据作业id 最小长度:1 最大长度:128 eihealth_project_id
/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/datas/quote 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。
不包含源对象的匹配模式,如:*.txt。 支持“*”匹配多个任意字符和“?”匹配单个任意字符,例如abc*.txt代表匹配以abc开头以.txt结尾的任意文件。 您可以使用“\*”代表匹配“*”字符本身,使用“\?”代表匹配“?”字符本身。如果待下载的对象名匹配该参数,则跳过该对象的复制。 建议使用引号传递
/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/data-jobs/{data_job_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 data_job_id 是 String 数据作业id 最小长度:1 最大长度:128 eihealth_project_id