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获取示例数据 本示例中使用小分子化合物SMILES结构式文件和蛋白3D结构PDB文件作为输入数据,可通过如下方式获取。 登录医疗智能体平台,在“资产市场”中订阅“docking summary测试数据”至所需的项目中。
数据作业管理 获取数据作业列表 获取数据作业详细信息 删除数据作业 取消数据作业 重试数据作业 获取数据作业执行日志 下载数据作业执行日志 父主题: 数据管理
--storage-type -s 否 归档的存储类型,支持STANDARD和COLD。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程。
父主题: 数据管理
参数 参数 参数类型 描述 id String 数据作业ID 请求示例 批量删除项目数据,删除的数据为test1和test2。
资源监控数据获取 获取资源监控数据 批量获取资源统计数据 父主题: 系统管理
数据管理命令 列举对象 显示当前目录 切换路径 文件拷贝 创建子目录 上传数据 清理本地记录的上传文件 下载数据 删除数据 数据导入 创建归档 获取归档数据 删除归档 恢复归档 获取数据归档列表 修改归档区域 获取数据作业 删除数据作业 重试数据作业 取消数据作业 移动对象 增量同步
数据库管理 数据库管理 模板管理 父主题: API(医疗智能体平台)
数据库管理 数据库简介 创建数据库模板 导入数据库模板 创建数据库 引用数据库 管理数据库 父主题: 用户指南(基因平台)
数据库追加文件 功能介绍 数据库追加文件。
创建数据库模板 创建数据库模板 创建数据库前,请先在“数据库 > 模板”页签创建数据库模板,模板中数据库表列的数目为固定,行数可按需设置,不同列之间,可通过列信息进行识别。列信息包含列名、描述、类型、允许为空、是否主键、是否可查询、是否唯一、提示和操作信息。
父主题: 药物数据库管理
创建数据库模板 使用create命令创建数据库模板。
导入数据库模板 使用import命令导入别的项目的数据库模板到当前项目,暂只支持导入单个模板。
父主题: 数据库资源管理
图1 从其他项目导入模板 平台也提供了yaml格式的数据库模板,您可以在本地编辑完成后上传至平台进行使用,数据库模板支持yaml或yml格式,且文件大小不能超过10M。 导入方式选择“上传”,单击“下载示例文件”下载数据库模板示例,编辑后上传模板文件至平台,单击“确定”。
creator String 数据作业创建者 end_time String 数据作业结束时间 id String 数据作业ID name String 数据作业名称 create_time String 数据作业创建时间 status String 数据作业状态 finish_count
父主题: 数据库管理
药物数据输入格式说明 药物虚拟筛选平台的输入数据,需要输入蛋白质和配体小分子数据。参考以下数据要求,将数据上传至项目中。 输入蛋白质,pdb格式,将要进行对接的所有靶标蛋白放在一个文件夹内。 输入配体小分子,配体小分子为如下格式的txt文件。
获取数据库实例 使用get命令获取数据库实例列表、详情或者查询数据库数据。