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上传大于1GB数据 当数据过大，或者数据处于服务器上时，页面传输并不是很方便，所以可以利用EIHealth平台的命令行工具进行数据文件、文件夹传输。命令行配置方法请参见配置命令行工具。 上传数据 使用命令行工具upload命令，将本地数据上传到EIHealth平台中。该命令不支持将数据上传到引用目录。
ID/Secret Access Key）即访问密钥，包含访问密钥ID（AK）和秘密访问密钥（SK）两部分，华为云通过AK识别用户的身份，通过SK对请求数据进行签名验证，用于确保请求的机密性、完整性和请求者身份的正确性。 登录华为云管理控制台，鼠标指向页面右上角的用户名，在下拉列表中单击“我的凭证”。
疫期间医疗智能体团队联合多家科研单位，从新冠病毒蛋白序列开始，针对所有21个靶点蛋白进行同源建模、分子动力学模拟优化，获取了靶点蛋白的3D结构。并对超过8500个已上市、进入临床的小分子药物进行了约18万种药物-靶点配对情况的计算评估，获取的结合能信息均公开在“神农项目”中。 图1
热图的横坐标为蛋白质名称，以及对接结合能的均值和标准差。纵坐标为配体小分子名称，数值为结合能的大小，结合能越小，颜色越偏紫色。 可以根据结合能的大小进行排序，结合能越小代表配体和受体结合越稳定。 单击结合能数值，可查看详细对接结果。 第1部分描述了蛋白质与配体小分子的结合能大小，以及该蛋白
页面左上角单击“编辑”按钮。 在需要修改的数据行的操作列单击“编辑”，修改数据。 编辑时，主键内容不能修改，编辑的值，需要对照数据库模板值进行填写。 对于空的数据库，编辑时，只允许新增行。 图1 编辑数据 修改完成后，单击“保存”。 删除 数据库创建完成后，单击数据库名称进入数据
供方向。药物虚拟筛选以项目成员为粒度进行资源的隔离和访问控制，不同成员角色对数据库的操作权限请参见成员角色和权限。 创建药物虚拟筛选任务 虚拟药物筛选支持使用资产市场中预置的“Docking Summary”流程对小分子化合物配体和蛋白受体进行对接。该流程可以实现以下功能。 整合分子对接结果，生成结合能矩阵。
创建数据库模板 创建数据库前，请先在“数据库 > 模板”页签创建数据库模板，模板中数据库表列的数目为固定，行数可按需设置，不同列之间，可通过列信息进行识别。列信息包含列名、描述、类型、允许为空、是否主键、是否可查询、是否唯一、提示和操作信息。单击添加列可新增一列，最多支持100列。单击操作列的图标可以删除列。
请参考用户指南中的项目成员和权限。 图2 复制数据 引用数据 引用数据可以引用其他项目中或对应的obs桶的数据。引用的数据不能在该项目中进行更改。只能用来运行作业，导入数据到数据库等操作。 图3 引用数据 URL导入数据 以URL导入的方式添加数据类似于linux中的wget操
蛋白的结合情况，华为云联合多家科研单位，从新冠病毒蛋白序列开始，针对所有21个靶点蛋白进行同源建模、分子动力学模拟优化，获取靶点蛋白的3D结构。对超过8500个已上市、进入临床的小分子药物进行了约18万种药物-靶点配对情况的计算评估，同时从21个蛋白的角度，综合、无偏的评估药物效
Notebook 如何使用Notebook的Terminal功能 如何将Notebook中的数据下载至本地 如何在Notebook中安装外部库
镜像 如何搭建Docker环境 如何将生物信息学软件封装为镜像并上传
单击“下一步”，进入靶点设置，此步骤为可选步骤，如果需要设置靶点，并且将对接结合能作为一个约束条件进行优化，需要进行配置。最多可添加2个靶点。在添加靶点后，会进行单分子预对接，可查看Top1的对接打分与构象。 如果不需要设置靶点，此步骤可以进行省略，如果设置了靶点，作业运行时间会加长。 图3 靶点设置 图4 Target1设置
目前分子属性预测返回的结果小分子数较多，无法进行批量分析，通过一些聚类的辅助方式能更好的选择分子。从每个类里挑选出一两个分子进行后续分析和验证，提高分析的效率和分析质量。也可以通过聚类找出一些关键的骨架，来进行下游分析或者优化等。 在输出结果页面左上角单击“聚类分析”后，系统开始进行分析，同时显示“聚类分析中”。
数据管理 如何获取AK/SK 几种不同类型的归档，区别是什么
系统级的角色配置，可创建平台的子用户，并为其分配权限。详细介绍请参见用户管理。 项目级别用户管理 资源级的角色配置，以项目为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组，以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。详细介绍请参见项目管理。 表2 盘古辅助制药平台用户管理类型 类型 说明 系统级别用户管理 系统级的角
如果上传的流程中包含镜像，单击镜像管理跳转至本项目的镜像管理列表，进行镜像上传，具体可参考导入或上传镜像。 图1 添加流程文件 添加完成后，单击“下一步”，配置流程参数。 添加参数方式支持两种，一种为单击进行添加，一种为单击进行添加。如果参数比较多，建议使用“上传参数”方式。 上传参数方
图中直接通过两个分子之间进行连线添加。可以在微扰图中单击某条待计算路径上的，删除该条待计算路径。 图2 添加或者删除待计算路径 图3 选择配体对 返回相似度后默认全勾选，您可以进行勾选或去除勾选要计算的路径，如果未勾选，则后面就不会对其进行FEP计算。在相似度返回之前，您也可以直接选择配体对进入下一步。
如果选择“更改参数”，系统会跳转至作业参数配置页面，进行修改后，单击“重试作业”。 搜索 普通搜索 在作业管理页面，右上角搜索框中输入作业名称，单击按钮进行搜索。 图3 搜索作业 高级搜索 Nextflow作业支持根据流程名称、标签、状态、创建者、创建时间、完成时间进行搜索。在作业管理右上角，选择“高
传镜像后，在医疗智能体平台搭建NGS流程，执行分析作业及批量执行NGS分析。 新型冠状病毒（COVID-19）虚拟药物筛选 本最佳实践介绍如何使用EIhealth平台虚拟药物筛选功能，通过获取示例数据，创建药物虚拟筛选任务并查看结果。
选择上传的配体小分子文件。 受体蛋白 选择上传的受体蛋白文件夹。这里会默认用文件夹里面所有的蛋白质和配体小分子文件里面的小分子进行一一对接。 超时时间 根据受体配体对个数进行调整，一个受体配体对对接大约需要25s。 图2 运行信息 单击“提交”，运行作业。 父主题： 运行大规模虚拟药筛任务
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