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S, GROMACS。同时HPC常用的调度软件也对断点续算有集成支持,如PBS、Slurm与LSF等。 本节以LAMMPS为例,介绍如何在HPC进行断点续算。 步骤1 安装FFTW 依次执行以下命令,安装FFTW软件。 yum install gcc-gfortran gcc-c++
方法二:使用已有节点部署HPC集群 操作场景 如果用户需要使用已有的ECS节点资源构建HPC集群,可以使用该功能进行集群的部署。下面介绍如何使用已有节点部署HPC集群。 使用已有节点部署集群,首先选择管理节点,再选择计算节点,切换计算节点与管理节点需要有相同的CPU架构,需要在相
当集群中某节点出现异常,可以使用节点重启的功能对该节点进行重启操作尝试恢复。 只有状态为“运行中”的节点可进行重启操作。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“节点管理”。 在“节点管理”页面集群的下拉框切换到要进行节点操作的集群。 选择要进行停止操作的节点,单击操作中“更多 > 重启”。
节点删除 操作场景 集群当前的节点数较多,可以选择将部分节点进行删除,对集群进行缩容操作以同时节省费用。 集群中某个节点出现异常且无法手动恢复后,可使用节点删除将该节点进行删除操作,随后根据需要再重新进行集群扩容操作。 操作须知 无论单节点删除或是批量删除,管理节点是禁止删除操作的。
Protocol over InfiniBand),指利用物理IB网络(包括服务器上的IB卡、IB连接线、IB交换机等)通过IP协议进行连接,并进行数据传输。 它提供了基于RDMA之上的IP网络模拟层,允许应用无修改的运行在InfiniBand网络上。但是,IPoIB性能比RDM
操作场景 节点关机后,如需再次重启恢复使用,可重新启动节点。 状态为“停止”的节点可进行启动操作。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“节点管理”。 在“节点管理”页面集群的下拉框切换到要进行节点操作的集群。 选择要启动的节点,单击操作中“更多 > 启动”。 单击“确定”。
STAR-CCM+部署HPC集群流程图 本文档介绍如何通过仿真软件STAR-CCM+部署HPC集群,流程如图1所示。 图1 基于STAR-CCM+部署HPC集群流程图 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
停止集群 操作场景 按需类型的集群,如暂时没有任务需要执行,可使用集群停止功能对集群进行管理操作以节省费用。 包周期资源不适用,关机后仍继续扣费,需手动退订后可停止扣费。 有集群状态为“运行中”的集群可进行停止操作。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。 在“集
HPC当前支持的MPI包括: 驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI MPICH 以下小节的内容详细介绍了MPI的安装与使用,您可以根据需要选择合适的MPI进行安装。 父主题: 安装和使用MPI(鲲鹏BMS场景)
该任务指导用户在BMS集群上进行相关设置,并使其可以相互免密登录。 背景信息 $:表示在普通用户下,执行相关操作。 #:表示在管理员用户下,执行相关操作。 普通用户切换至管理员用户,请使用命令sudo su。 前提条件 已成功创建BMS,并绑定了弹性IP进行登录。 操作步骤 使用“P
HPC解决方案服务 高性能计算(High-performance computing,简称HPC)是一个计算机集群系统,通过管理节点对计算任务进行分解,交给不同的计算节点进行计算,以此来解决大型计算问题。在科学研究、气象预报、仿真实验、生物制药、基因测序、图像处理等行业均有广泛的应用。 针对日益增
只有状态为“运行中”的节点可执行停止操作。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“节点管理”。 在“节点管理”页面集群的下拉框切换到要进行节点操作的集群。 选择要进行停止操作的节点,单击后方操作中“更多 > 停止”。 单击“确定”。 提交成功后,返回到节点管理页面,等待操作完成节点状态变为“停止”。
集群扩容 操作场景 集群使用过程中,如当前的集群规模已经不满足需要,可使用集群扩容功能对集群进行扩容操作以增加节点数。 只有状态为“运行中”的集群可进行扩容操作。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。 在“集群管理”页面选择要扩容的集群,单击后方操作中“扩容”,进入扩容的详情页面。
Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 以下小节的内容详细介绍了MPI的安装与使用,您可以根据需要选择合适的MPI进行安装。 父主题: 安装和使用MPI
Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 以下小节的内容详细介绍了MPI的安装与使用,您可以根据需要选择合适的MPI进行安装。 父主题: 安装和使用MPI(X86 BMS场景)
集群创建提交失败,提示集群配额不足怎么办? 每个用户只能创建最多3个集群,当集群数量达到上限后会提示该错误,如需创建新集群,可先将不使用或者异常状态的集群进行删除,然后再重新创建集群。 父主题: 常见问题
配置ECS集群互相免密登录 操作场景 该任务指导用户在ECS集群上进行相关设置,并使其可以相互免密登录。仅支持在使用密钥登录弹性云服务器的情况下配置ECS集群互相免密登录。 背景信息 $:表示在普通用户下,执行相关操作。 #:表示在管理员用户下,执行相关操作。 普通用户切换至管理员用户,请使用命令sudo
HPC的业务特点 科学研究、气象预报、仿真实验、生物制药、基因测序、图像处理等行业都涉及高性能计算集群来解决大型计算问题,管理节点对计算任务进行分解,交给不同的计算节点完成计算。 各种业务场景下,因数据处理量、计算任务关联关系等不同,对计算能力、存储效率、网络带宽及时延要求有各自侧重。
创建支持IB网卡的弹性云服务器 操作场景 您可以在几分钟之内快速获得基于公有云平台的弹性云服务器设施,并且这些设施是弹性的,可以根据需求伸缩。该任务指导用户如何创建支持IB网卡的弹性云服务器,包括管理控制台方式和基于HTTPS请求的API(Application programming interface)方式。
启动集群 操作场景 停止状态的集群,如需再次开启集群执行作业,可将集群重新启动。 只有状态为“停止”的集群可进行启动操作。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。 在“集群管理”页面选择要启动的集群,单击后方操作列“更多 > 启动”。 单击“确定”。 在集群