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配置OBS访问权限 - 医疗智能体 EIHealth
配置OBS访问权限 OBS服务 OBS全称Object Stroage Service(对象存储服务),提供海量、安全、高可靠、低成本的数据存储能力,可供用户存储任意类型和大小的数据。 宫颈癌细胞病理筛查API支持直接使用华为云OBS服务进行数据的存储,以减少服务使用成本,降低服务的响应时长,提升服务使用的体验。
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与其他云服务的关系 - 医疗智能体 EIHealth
医疗智能体使用IAM实现认证功能。 对象存储服务(OBS) 对象存储服务(Object Storage Service,简称OBS)是一个基于对象的海量存储服务,为客户提供海量、安全、高可靠、低成本的数据存储能力。 医疗智能体使用OBS存储原始数据、参考组数据、计算结果等。 容器镜像服务(SWR)
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配额说明 - 医疗智能体 EIHealth
如果当前资源配额限制无法满足使用需要,您可以申请扩大配额。 EIHealth平台应用的基础设施如下: 统一身份认证(IAM) 容器镜像服务(SWR) 对象存储服务(OBS) 关于如何查看配额,如何申请扩大配额,请参见“《用户指南》 配额管理”章节。
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数据管理简介 - 医疗智能体 EIHealth
数据管理简介 EIHealth平台使用对象存储服务(OBS)存储原始数据、流程执行中间数据和执行结果数据。数据按项目维度进行隔离和划分,从项目角度进行数据的管理,不同项目的数据可以通过“导入数据”实现跨项目使用。您可以在“项目管理”页面,“数据”页签中,完成数据的添加、导入、归档、复制、删除等操作。
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数据管理简介 - 医疗智能体 EIHealth
数据管理简介 盘古辅助制药平台使用对象存储服务(OBS)存储原始数据、作业执行中间数据和执行结果数据。数据按项目维度进行隔离和划分,从项目角度进行数据的管理,不同项目的数据可以通过“复制数据”实现跨项目使用。您可以在“项目管理”页面,“数据”页签中,完成数据的添加、导入、归档、复制、删除等操作。
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如何将Notebook中的数据下载至本地? - 医疗智能体 EIHealth
图1 上传和下载文件 OBS存储类型的Notebook 在创建Notebook时,如果“存储配置”选择的是“OBS”。Notebook列表的所有文件读写操作是基于所选择的OBS路径下的内容操作,即Notebook中的数据和OBS中的数据是同步的。在OBS路径中创建文件夹、上传数
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邮箱设置 - 医疗智能体 EIHealth
同,请使用搜索引擎查找邮箱开通SMTP方式。 邮箱地址:填写邮箱地址,用于发送EIHealth平台的消息通知。 用户名:邮箱的用户名,如果未修改过,默认为邮箱地址。 密码:邮箱开通SMTP功能时生成的一段随机字符。 消息头:发送邮件时,邮件标题。 语言:选择中文或英文。 删除邮箱后,将不再发送邮件通知。
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数据的上传和下载 - 医疗智能体 EIHealth
载到Notebook中。 图1 上传和下载文件 OBS存储类型的Notebook Notebook列表中所有文件的读写操作是基于所选择的OBS路径下的内容操作,即Notebook中的数据和被挂载的OBS路径中的数据是同步的。在OBS路径中创建文件夹、上传数据,会同步到Notebo
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作业执行失败排查思路 - 医疗智能体 EIHealth
志中显示IO读写相关错误。 图8 运行出错的应用日志 排查思路 检查同一时刻投递作业的输出路径是否存在重复。若存在重复,则很有可能是并发写入同一个文件导致的异常,若不存在请联系服务技术支持解决。 解决方案 平台提供了作业级输出路径,流程级输出路径,子任务级输出路径用于做不同层级的
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上传数据 - 医疗智能体 EIHealth
期的结果。 该匹配模式作用于对象全路径(含从根路径开始的对象前缀和对象名,例如,桶内对象路径为obs://bucket/src1/src2/test.txt,则对象的全路径为src1/src2/test.txt)。该匹配模式仅适用于对象名非“/”结尾的对象。 支持指定多个include参数,如--include
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增量同步 - 医疗智能体 EIHealth
使用sync命令让本地源路径下的所有内容和OBS指定目标对象进行数据同步,使两边内容保持一致。 增量:依次比较源文件和目标对象,只上传存在变化的源文件。 同步:命令执行完成后,保证本地源路径是OBS指定目标桶的子集,即本地源路径下的所有文件均能在OBS指定目标桶中找到对应对象。 命令结构 health
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几种不同类型的归档,区别是什么? - 医疗智能体 EIHealth
几种不同类型的归档,区别是什么? 标准存储 标准存储访问时延低和吞吐量高,因而适用于有大量热点文件(平均一个月多次)或小文件(小于1MB),且需要频繁访问数据的业务场景。 适合高性能,高可靠,高可用,频繁访问场景。 归档存储 归档存储适用于很少访问(平均一年访问一次)数据的业务场
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创建Notebook - 医疗智能体 EIHealth
取值范围:2~512,默认为2。 存储路径 单击“存储路径”右侧文件夹图标,设置用于存储Notebook数据的OBS路径。如果想直接使用已有的文件或数据,可将数据提前上传至对应的OBS路径下。 包含本项目桶最多挂载6个,不包含本项目桶最多挂载5个。 用户在Notebook列表的所有文件读写操作是基于所选择的OBS路径下的内容操作。
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文件拷贝 - 医疗智能体 EIHealth
-a 否 复制对象时可指定的目标对象的预定义访问策略。 支持的值: private:私有读写 public-read:公共读 public-read-write:公共读写 bucket-owner-full-control:桶拥有者完全控制 --meta -E 否 复制对象时可指定的目标对象的自定义元数据。
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移动对象 - 医疗智能体 EIHealth
X桶不支持versionId选项。 移动对象时该参数可选。 --acl -a 否 移动对象时可指定的目标对象的预定义访问策略。支持的值: private:私有读写 public-read:公共读 public-read-write:公共读写 bucket-owner-full-control:桶拥有者完全控制
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创建分析作业 - 医疗智能体 EIHealth
使用本地盘加速时,需保证购买的计算节点带有“数据盘”。OBS桶中的数据不支持本地盘加速,使用OBS桶中数据用于本地盘加速,可能会导致作业运行失败。 使用OBS桶中的数据投递作业时,当数据大于40G时作业会投递失败。 使用OBS桶中的数据投递作业时,作业将数据copy至云硬盘后,数
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使用RNA-Seq Analysis Based on STAR流程 - 医疗智能体 EIHealth
本地盘加速:使用计算节点的本地盘进行加速。使用本地盘加速时,需保证购买的计算节点带有“数据盘”。OBS桶中的数据不支持本地盘加速,使用OBS桶中数据用于本地盘加速,可能会导致作业运行失败。 图1 “OBS”标签代表数据引用来源为OBS桶 作业信息填写完成后,单击“确定”,进入流程设计器页面。分别单击输入参数图标,设置输入数据。
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查询应用 - 医疗智能体 EIHealth
查询应用 使用get命令查询应用的详细信息,该命令同时可用于获取应用模板。 命令结构 health get app ID [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 无 否 不选此参数时,列出当前所在项目的所有应用信息。 指定app-id或app-name:
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使用Variant Calling Based On NGS流程 - 医疗智能体 EIHealth
本地盘加速:使用计算节点的本地盘进行加速。使用本地盘加速时,需保证购买的计算节点带有“数据盘”。OBS桶中的数据不支持本地盘加速,使用OBS桶中数据用于本地盘加速,可能会导致作业运行失败。 图1 “OBS”标签代表数据引用来源为OBS桶 作业信息填写完成后,单击“确定”,进入流程设计器页面。分别单击输入参数图标,设置输入数据。
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基本概念 - 医疗智能体 EIHealth
过程中,您需要用到账号、用户和密码等信息。 区域(Region) 从地理位置和网络时延维度划分,同一个Region内共享弹性计算、块存储、对象存储、VPC网络、弹性公网IP、镜像等公共服务。Region分为通用Region和专属Region,通用Region指面向公共租户提供通用