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NGS流程中需使用二代测序得到的原始fastq文件、参考基因组序列、参考Variants数据集。 本示例中以Windows系统命令行工具为例,介绍如何将本地数据上传到EIHealth平台。更多的命令介绍请参见命令行工具。 使用命令行工具,用switch命令进入待操作的项目。 例如,使用health
EIHealth平台支持把华为云的IAM子用户导入至平台子用户。通过导入已有子用户,增加用户使用的便捷度,方便用户维护账号。 IAM用户导入只支持使用Domain用户导入。 使用管理员账户登录医疗智能体平台。 在右上角用户名中选择“用户管理”。 图1 用户管理 在用户管理页面,单击“导入用户”,进入“导入用户”页面。
Notebook 如何使用Notebook的Terminal功能? 如何将Notebook中的数据下载至本地? 如何在Notebook中安装外部库?
提供了友好、便捷的操作体验,但是当面临大批量的测序数据时,需要重复设置输入、输出、执行等步骤。为进一步提高NGS流程的执行效率,本章节介绍如何通过循环读取输入数据,批量运行NGS。同时,您也可以参考本示例,将批量运行的方法复制到其他的分析任务中。 配置命令行工具 批量执行分析需要
镜像 如何搭建Docker环境? 如何将生物信息学软件封装为镜像并上传?
流程、作业 应用的参数和镜像启动命令如何设置? 直接挂载OBS目录进行大规模计算,如何解决偶现报错
ject的全部job的基本信息。 --type -t 否 查询类型,默认detail。此参数用于获取作业列表。 取值:logs、detail、reports 。 logs:获取job日志。 detail:获取job详情。 reports:获取job报告 。 --sortDir -d
az String 可用区 cpu_detail String CPU物理规格描述信息 disk_detail String 磁盘物理规格描述信息 memory_detail String 内存物理规格描述信息 netcard_detail String 网卡物理规格描述信息 cpu_arch
账号 如何进行实名认证
start_time String 实例创建时间 container_statuses Array of TaskInstanceContainerStatusRsp objects 实例状态信息 表7 TaskInstanceContainerStatusRsp 参数 参数类型 描述 restart_count
进入JupyterLab主页后,可在“Notebook”区域下,选择适用的AI引擎,单击后将新建一个对应框架的Notebook文件。 由于每个Notebook实例选择的工作环境不同,其支持的AI框架也不同,下图仅为示例,请根据实际显示界面选择AI框架。 图3 选择AI引擎并新建一个Notebook 新建的Notebook文件将呈现在左侧菜单栏中。
不涉及 否 任务id,如果不传,那么获取的是任务列表。 --type -t 否 查询类型。 默认detail。 取值:logs、detail 。 logs:获取task日志。 detail:获取task详情,用于获取task列表。 --jobId -j 是 作业Id。 命令示例 获取task列表
图解医疗智能体 AI药物研究 AI基因组研究
数据管理 AK/SK是什么?如何获取AK/SK? 几种不同类型的归档,区别是什么?
状态 email String 用户邮箱,需符合邮箱格式 phone String 用户手机号,纯数字,长度小于等于32位。必须与国家码同时存在。 areacode String 国家码。中国大陆为“0086” is_domain_owner Boolean 是否domain用户 create_time
name String 角色名 表6 UserDto 参数 参数类型 描述 domain DomainDto object 账号 id String 用户id name String 用户名 表7 DomainDto 参数 参数类型 描述 id String 账号id name String
engine String 引擎。 job_result JobResult object 作业结果信息。 part_failed_reason Array of FailedReasonRecord objects 部分失败原因和数量。 cluster_result ClusterJobRsp
状态 email String 用户邮箱,需符合邮箱格式 phone String 用户手机号,纯数字,长度小于等于32位。必须与国家码同时存在。 areacode String 国家码。中国大陆为“0086” is_domain_owner Boolean 是否domain用户 create_time
参数类型 描述 pairs Array of LigandSimilarityGraphTaskResultPairDto objects 配体相似度图任务结果对列表。 数组长度:1 - 100 表5 LigandSimilarityGraphTaskResultPairDto 参数
retention # 执行成功返回结果如下 Name Retain Number message 500000 Name Retain Number completed-jobs 6000000