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Docker安装成功 步骤2:制作镜像 方法1:直接下载官方的FastQC镜像。 执行如下命令下载FastQC镜像。 docker pull biocontainers/fastqc:v0.11.5 方法2:通过Dockerfile制作FastQC镜像。 执行vi Dockerfile命令,进入Dockerfile文件中,编写文件。
认为运行obsutil命令的用户目录的子文件夹.obsutil_output。 结果清单文件命名规则:abort_{succeed | failed}_report_时间_TaskId.txt。单个结果清单文件默认情况下最大为30MB且最大可保留的文件个数为1024,可在配置文件
"count" : 1, "reason" : "Started", "message" : "Started container task-2-zqy-test-0218-0-19df0004a000206", "first_timestamp" :
镜像下载命令 Read Quality 对测序得到的fastq数据进行质控。 fastp:0.20.1 docker pull biocontainers/fastp:v0.20.1_cv1 Mapping and Sort and index 将质控之后得到的Clean Reads比对到参考基因组上。
create_time String 作业创建时间 finish_time String 作业完成时间 failed_message String 作业运行失败描述信息,当作业执行失败时会返回 failed_reason String 作业运行失败原因,当作业执行失败时会返回 tool_info
"a", "b", "c" ], "main_file": "m1.nf", "name": "h3", "params_file": "h3-params
charge_mode String 计费模式 period_num Integer 购买周期 create_time String 购买时间,UTC时间 failure_reason String 失败原因 status String 枚举值: DEPLOYING NORMAL UPDATINTG
里面仅安装了用户需要的应用程序及其依赖文件。EIHealth平台使用容器镜像服务(Software Repository for Container,简称SWR)进行简单易用、安全可靠的镜像管理。 应用 EIHealth平台的每一个分析作业都依托于应用运行。应用是生物信息学软件和
FepGraphDto 参数 是否必选 参数类型 描述 center_id 是 String 中心配体名称。 最小长度:1 最大长度:32 pairs 是 Array of SimilarityDto objects 配体对列表。 数组长度:1 - 100 表9 SimilarityDto
若子任务未正常创建,请联系服务技术支持解决。 若子任务正常创建,但是实例未正常创建,可以通过事件信息分析,常见有以下问题场景和对应解决方案。 0/4 nodes are available: XXX Insufficient cpu 或者 XXX Insufficient memory。该场景表示当前集群中无充足的
String 资产长描述 summary String 资产短描述 license String 许可证 status String 资产状态 failed_reason String 资产发布失败原因 labels Array of strings 资产标签列表 picture String
默认为运行obsutil命令的用户目录的子文件夹.obsutil_output 结果清单文件命名规则:sync_{succeed | failed | warning}_report_时间_TaskId.txt。单个结果清单文件默认情况下最大为30MB且最大可保留的文件个数为1
String 资产长描述 summary String 资产短描述 license String 许可证 status String 资产状态 failed_reason String 资产发布失败原因 labels Array of strings 资产标签列表 picture String
import_workflow_status String 导入流程结果状态, 包括以下状态:IMPORT_SUCCESS,IMPORT_FAIL import_app_results Array of ImportAppRsp objects 导入应用详情 表5 ImportAppRsp
单击“提交”,可在作业中心查看该作业的运行情况。 查看运行结果。 输出每对配体的相对结合自由能、分子图、相似性等。也可以单击右边“查看轨迹”,下载运动轨迹。结果页面支持Pair和Ligand两种查看方式。 也可以下载输出结果文件包含小分子的基本信息和属性。 下载操作将会产生流量费用,具体可参考计费说明。 图6 查看结果(1)
finish_count Integer 数据作业完成数 total_count Integer 数据作业总数 type String 数据作业类型 failed_reason String 数据作业失败原因 additions String 附加信息 请求示例 获取数据作业列表 https://eihealth
MESSAGE_CLEAN 消息清理。消息中心的消息总和超过设置值时,进行消息清理。 表3 执行状态说明 执行状态 说明 SUCCEED 执行成功。 FAILED 执行失败。 PROCESSING 数据删除、导入等操作正在处理中。 START 项目删除操作开始执行。 RUNNING 分析作业运行中。
将本地D:\local\data\test.txt路径下的txt文件上传至src文件夹中。 上传完成后,会在EIHealthG42 Health AI平台数据管理页面的src文件中,生成test.txt文件。 health upload D:\local\data\test.txt /src/
输出路径:输出数据的存放路径,可修改。 高级参数:CPU需求、Memory需求、GPU类型、GPU需求,请按照使用需求进行设置;CPU架构、计算节点标签,不可修改。GPU包含NAIDIA架构GPU和自研的D310+ARM。选择GPU资源时,需要您在购买平台时包含了GPU资源,并且需要应用支持GPU运行。选择D310+
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