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IO加速:IO加速使用弹性文件服务(SFS)提供高性能的数据读写,作业运行时,会将非最终结果的数据存储在SFS中用以提高任务运行效率,作业执行完成后会清理释放SFS空间。对于涉及频繁读写场景的任务建议开启IO加速,开启前需要先购买性能加速。 本地盘加速:使用计算节点的本地盘进行加速。使用
SFS空间。对于涉及频繁读写场景的任务建议开启IO加速,开启前需要先购买性能加速。 本地盘加速:使用计算节点的本地盘进行加速。使用本地盘加速时,需保证购买的计算节点带有“数据盘”。OBS桶中的数据不支持本地盘加速,使用OBS桶中数据用于本地盘加速,可能会导致作业运行失败。 图1
指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 --io-acc-tasks -s 否 设定任务的I/O加速类型 例如:`taskname1:EVS`;`taskname3:SFS` 不写的task默认不带加速类型 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Li
SFS空间。对于涉及频繁读写场景的任务建议开启IO加速,开启前需要先购买性能加速。 本地盘加速:使用计算节点的本地盘进行加速。使用本地盘加速时,需保证购买的计算节点带有“数据盘”。OBS桶中的数据不支持本地盘加速,使用OBS桶中数据用于本地盘加速,可能会导致作业运行失败。 图1
产品优势 提供开放的、易于扩展的平台架构。 提供端到端的AI赋能平台加速AI的研发和应用。 提供针对医疗行业的AI自动建模工具。 提供医疗领域专业的预置资产,提升企业的效率。 内置大量生物医疗领域标准分析流程,并结合华为特有的高性能云计算,多样性算力,大数据等技术加速计算过程。 支持
购买计算资源(主账号操作) 计算资源说明 资源看板 计算资源 存储资源 性能加速(可选) 数据库(可选)
流程统计管理 获取性能加速资源上统计信息 统计应用、流程、作业数目 统计全局流程、作业信息 父主题: 应用管理
系统管理 计算资源扩缩容 计算资源管理 数据库资源管理 用户管理 作业清理配置 标签管理 消息中心管理 节点标签管理 医疗平台信息获取 性能加速资源管理 资源监控数据获取 存储资源查询 系统配置和供应商配置 系统配额及资源使用情况获取 父主题: API(医疗智能体平台)
在“项目管理”页面“作业”页签中,以列表形式展示了项目中运行的分析作业和运行状态。您可以查看分析作业名称、标签、所使用的流程名称、版本、运行状态、创建者、创建时间、完成时间和总耗时。并可对作业执行重试、取消、删除、克隆、导出操作。对于列表中的作业,支持通过作业名称、流程名称、标签、创建者、状态、创建时间和完成时间进行快速搜索。
系统设置命令 获取系统标签 添加系统标签 删除系统标签 获取系统资源 购买计算资源 删除计算资源节点 修改计算资源 修改性能加速资源 查询消息及已完成作业保留设置 修改消息及已完成作业保留配置 获取供应商logo和名称设置 修改供应商logo和名称配置 获取系统配额信息 获取消息中心消息列表
String 作业的名称 description String 作业的描述 labels Array of strings 作业标签 priority Integer 作业的优先级 timeout Integer 作业执行超时时长 output_dir String 压扁后的效果,即job运行的实际配置
String 创建任务的用户名称 tool_info ToolInfoDto object 作业依赖的组件信息 io_acc_id String 作业使用的IO加速实例id,不填表示不使用; io_acc_expected_usage Integer 作业使用的SFS-Turbo实
盘古药物分子大模型是基于华为与中科院上海药物所共同研发、专门面向药物研发领域推出的预训练大模型,旨在帮助医药公司开启AI辅助药物研发的新模式。盘古药物分子大模型学习了17亿个药物分子的化学结构,模型参数上亿,是目前最大的小分子药物模型。华为盘古药物分子大模型在分子生成、属性预测、生物活性预
盘古药物分子大模型是基于华为与中科院上海药物所共同研发、专门面向药物研发领域推出的预训练大模型,旨在帮助医药公司开启AI辅助药物研发的新模式。盘古药物分子大模型学习了17亿个药物分子的化学结构,模型参数上亿,是目前最大的小分子药物模型。华为盘古药物分子大模型在分子生成、属性预测、生物活性预
1个靶点蛋白进行同源建模、分子动力学模拟优化,获取靶点蛋白的3D结构。对超过8500个已上市、进入临床的小分子药物进行了约18万种药物-靶点配对情况的计算评估,同时从21个蛋白的角度,综合、无偏的评估药物效果,从而为后续的药物机制研究、临床试验提供线索。 父主题: EIHealth平台
作业投递后处于运行中,但是无日志打印,也没有任何符合预期的输出文件生成。 排查思路 首先需要用户自行确认一下投递的作业是否会在控制台打印日志,如果是有重定向日志输出到具体文件的话,此处无日志为正常现象。 子任务的事件中,确认作业子任务的实例是否有正常创建。 图2 子任务的事件 查看实例的事件,查看实例是否有正常创建。
取、删除中间文件的时间。 流程针对GATK4中的限速步骤,进行了系统的优化加速。流程从contig-file中提取contig,根据contig下发对应的任务,并依据不同任务,指定并行下发的任务数,以降低流程整体的运行时间。 流程执行信息 NGS流程由fastp、bwa-mem、
用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String 自动作业的名称,取值范围:[1
基因平台提供包年包月、按需两种计费方式,您可以按需求进行选择,计费详情请参见价格计算器。 盘古辅助制药平台 盘古辅助制药平台提供包年包月、按需两种计费方式,您可以按需求进行选择,计费详情请参见价格计算器。 OBS数据下载 OBS数据下载产生的流量费用为按需计费,计费详情请参考OBS流量费用中“公网流出流量
【可选】根据网络情况,配置基础镜像中的PyPi Mirror,对下载进行加速。基础镜像中的PyPi Mirror,默认配置为华为云软件开发云的PyPi mirror。您可以在容器中执行如下命令,查看PyPi Mirror。如果您想用其他PyPi Mirror,可将命令中的index-url参数修改为您需要的PyPi