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为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 schedulable 是 Boolean 是否可调度 响应参数 无 请求示例 设置是否可调度,设置为可调度 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud
String 参数描述。取值范围:[0-255] 最小长度:0 最大长度:255 required Boolean 参数是否必须 concurrent String 参数是否开启并发。当前支持vars_iter并发类型,不填表示未开启并发。 type String 参数类型。取值:[ST
该路径有写权限。该路径的可用空间需要大于待下载对象的大小。 --dryRun -y 否 测试模式运行,不执行实际的下载操作。 --vlength -v 否 下载完成后,验证本地文件大小是否与桶中对象的大小一致。 --vmd5 -M 否 下载完成后,验证本地文件的MD5值是否与桶中对象的MD5值一致。
在使用Nextflow时,作业运行失败的可能原因 由于Nextflow支持的特殊字符继承了Nextflow原有特性,因此请排查参数值,或者选择的数据名称,或者路径中带的特殊字符是否符合Nextflow原有特性。 建议启动并发作业数最多为8个。 父主题: Nextflow
小分子。小分子下载支持SDF和PDB格式,复合物下载只支持PDB格式。 每个分子卡片上会展示相应分子序号与对应的参数Vina Score(有靶点)、Score、Similarity、QED、SaScore Vina Score:代表分子如果添加了靶点,将会计算对接结合能,并按照Vina
的生物学问题。 本示例中NGS流程基于医疗智能体(EIHealth)平台搭建,流程以fastq格式数据作为输入,对碱基的质量信息进行评估,判断可靠程度,通过质控、比对、变异检测等步骤,最终输出包含样本SNP、INDEL的VCF文件。 该案例介绍NGS的搭建步骤,涵盖镜像、应用、流
创建分析作业 创建分析作业有以下几种不同的方式,您可以任选其中一种方式。 通过“新建流程”时创建 通过“作业”页面创建 •新建作业 •克隆作业 通过“工具”页面创建 通过“上传作业”创建 如果在创建应用时打开了“并发”开关,可以设置多个参数值,批量执行作业。 可通过在“系统资源 >
用户数统计时会去重。例如,用户组A有50个用户, 用户组B里有50个用,两者之间有10个用户重复,那么同时选择用户组A和B,统计时显示已选择90个用户。 如果导入后用户状态显示异常,需联系技术支持处理。 单击“下一步”,设置角色。设置是否为“系统管理员”。 配置完成后,单击“确定”。
docker import <project-name/image-name:tag-name> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 project-name 无 是 要导入的镜像当前所在的项目名称。 image-name 无 是 要导入的镜像名称。 tag-name
虚拟药物筛选简介 虚拟药物筛选功能 医疗智能体平台支持根据靶点蛋白和小分子药物的3D结构,计算蛋白与药物之间的结合能量,进而预测小分子是否有成为候选药物的可能性。 虚拟药物筛选可实现如下功能。 整合分子对接结果,生成结合能矩阵。 整合受体与分子对接产生的配体构象,用于可视化展示。
最小长度:0 最大长度:1024 nullable 是 Boolean 列是否允许为空 primary 是 Boolean 是否作为主键 searchable 是 Boolean 是否可查询 unique 是 Boolean 是否唯一 tips 否 String 查询参数格式的提示信息 最小长度:0
nextflow的流程参数文件格式是否正确,对应的OBS路径是否有足够的操作权限。 400 eihealth.01090015 The job of the nextflow is not retryable. 检查nextflow的作业是否为取消或失败状态。 400 eihealth
创建作业 创建作业有以下几种不同的方式,您可以任选其中一种方式。 通过功能模块创建 通过作业中心页面创建 •新建作业 •克隆作业 通过“功能模块”创建 在“功能模块”页面,选择对应的模块,单击“立即使用”。 在具体的功能模块页面,配置相关参数信息。具体参考功能模块章节。 通过“作业中心”页面创建
变异检测流程为例。 图1 订阅流程 可以在“工具 > 流程”列表可以看到刚刚订阅的流程。 图2 查看订阅的流程 步骤2:订阅数据 若您本地有需要分析的二代基因组数据,则您可以用本地的数据。数据上传方法请参见上传数据。 若没有,可以先订阅资产市场里的示例数据进行分析,这里先用资产市
le为false。 --vlength -v 否 同步上传完成后,验证上传到桶中对象的大小是否与本地文件大小一致。 --vmd5 -M 否 同步上传完成后,验证上传到桶中对象的MD5值是否与本地文件的MD5值一致。 如果待上传的本地文件较大,使用该参数将会因为计算MD5而导致整体
表示请求成功。 响应消息头 对应请求消息头,响应同样也有消息头,如“Content-type”。 表1 公共响应消息头 消息头名称 说明 是否必选 Content-Type 用于指明发送给接收者的实体正文的媒体类型。 类型:字符串。 默认值:application/json; charset=UTF-8
直至购买了计算资源或者任务超时才会停止。 单击平台右上角的账号名称,会出现账号的相关操作,包括系统资源,系统配置等。注意这里只有管理员账号有系统资源,系统配置等操作,具体说明请参见用户管理。 图1 系统资源 父主题: 购买计算资源(主账号操作)
数据控制与数据审计 数据保护策略 项目内的数据支持精细化的权限控制,可对数据分享、下载、删除进行设置。您可以在项目的“设置”页面设置数据权限。数据权限仅可以有项目所有者设置。 分享:关闭分享后,项目内数据不允许分享给其他项目,包括拷贝、引用两种方式。 下载:关闭下载后,项目内数据不允许下载至本地。
LinkCircle为false。 --vlength -v 否 上传完成后,验证桶中对象的大小是否与本地文件大小一致。 --vmd5 -M 否 上传完成后,验证桶中对象的MD5值是否与本地文件的MD5值一致。 如果待上传的本地文件较大,使用该参数将会因为计算MD5而导致整体性能
led|Cancelling|Cancelled|Unknown) tool_name 否 String 作业依赖的组件名称(有可能是Workflow,有可能是app), 取值范围:长度为[1,56],以小写字母开头,允许出现中划线(-)、小写字母和数字,且必须以小写字母或数字结尾。