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在“数据中心”页面,使用“复制”,将本项目的某一个文件、文件夹复制到其他文件夹中。 单击页面右上角“复制”。 图1 复制数据 选择需要复制的文件或文件夹,以及数据存储路径,单击“确认”,复制数据。 例如,将“test.zip”文件复制到“abc”文件夹中。复制数据时可单击图标创建文件夹。
发布流程 您可以将创建的流程发布到资产市场,供其他项目订阅和使用。 发布资产前,需要先设置商标。详细可参考商标设置。 在“工具”页面选择“流程”。 选择需要发布的流程,单击“操作”列“更多”>“发布”。 在发布页面,填写发布流程的相关信息。 表1 发布流程参数说明 参数 说明 名称
发布应用 您可以将创建的应用发布到资产市场,供其他项目订阅和使用。 发布资产前,需要先设置商标。详细可参考商标设置。 在“工具”页面选择“应用”。 选择需要发布的应用,单击“操作”列“更多”>“发布”。 在发布页面,填写发布应用的相关信息。 表1 发布应用参数说明 参数 说明 名称
F文件。 基于二代测序的基因突变检测 NGS流程简介 操作步骤 快速创建一个kubernetes集群 3分钟创建一个游戏类容器应用 3分钟创建一个游戏类容器应用 3分钟创建一个游戏类容器应用 3分钟创建一个游戏类容器应用 06 API EIHealth提供API用于对平台资源进行操作和二次开发。
行,不会按照优先级进行运行。 计算节点标签:作业会调度到含有相应标签的计算节点上。 当应用也配置了标签,如果应用和作业的计算节点标签在同一计算节点上,则应用调度至该计算节点上;应用和它的作业,不管节点标签是否一致,都会被调度到应用的节点标签所对应的计算节点上。 如果设置了不存在的
alth平台的镜像管理,实现高效的调用,极大方便了软件的安装和运行。 Docker镜像是一个模板,是容器应用打包的标准格式,在部署容器化应用时可以指定镜像。例如一个Docker镜像可以包含一个完整的Ubuntu操作系统环境,里面仅安装了用户需要的应用程序及其依赖文件。 EIHea
切换路径 使用cd命令在EIHealth项目中切换数据路径。 命令结构 health cd <path> 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 当前目录,不进行跳转。 health cd
复制数据 在“数据”页面,使用“复制”,将本项目的某一个文件、文件夹复制到其他文件夹中。 单击“复制”。 图2 复制数据 选择需要复制的文件或文件夹,以及数据存储路径,单击“确认”,复制数据。 例如,将“test.zip”文件复制到“abc”文件夹中。复制数据时可单击图标创建文件夹。
请将该模板保存为.yaml格式至本地,并在本地完成模板修改。例如,命名为ngs.yaml。 编写执行脚本并提交作业 运行分析作业时,流程中的每一个应用称之为一个任务(Task),通过循环读取Task的输入数据,可以实现作业的批量执行。 例如,您可以在本地创建.bat格式的批处理文件,执行该脚本即可批量运行NGS分析作业。
以用户组的方式导入时,若超出配额的部分会导入失败。 以用户组的方式导入时,用户组里已经导入到平台的用户,不算统计个数。例如,用户组A里50个用户,10个已经导入平台, 那么统计时,只会显示已选择40个用户。 IAM平台限制一个IAM用户不能加入超过10个用户组,而导入时还会再加入医疗用户组。如果I
表示执行更新某行操作。--update、--delete 、--insert必须要传其中一个,三选一。 --delete -d 否 表示执行删除某行操作。--update、--delete 、--insert必须要传其中一个,三选一。 --insert -i 否 表示执行插入数据行操作。--update、--delete
get-docker.sh 创建一个名为workdir的目录。 mkdir workdir 在该目录中创建一个Dockerfile文件。 cd ./workdir touch Dockerfile 在该目录中创建一个空白文件abc.txt,创建一个webapp目录。 touch abc
以用户组的方式导入时,若超出配额的部分会导入失败。 以用户组的方式导入时,用户组里已经导入到平台的用户,不算统计个数。例如,用户组A里50个用户,10个已经导入平台, 那么统计时,只会显示已选择40个用户。 IAM平台限制一个IAM用户不能加入超过10个用户组,而导入时还会再加入医疗用户组。如果I
通过修改--input,修改输入数据。 选择时,input和input-file二选一。 作业运行时,每个应用称之为一个task,应用可以设置多个输入参数,一个输入参数可以设置多个输入值。 task间使用;;分隔,input的参数路径间使用;;分隔。 例如task1.input
复制数据会从别的项目中复制一份数据到当前项目中,这里可选择的源项目需是当前账号为管理员的对应项目。如需设置项目成员,请参考用户指南中的项目成员和权限。 图2 复制数据 引用数据 引用数据可以引用其他项目中或对应的obs桶的数据。引用的数据不能在该项目中进行更改。只能用来运行作业,导入数据到数据库等操作。
探针文件:探针分子建议原子数不超过400,分子量过大可以通过增大探针半径降低失败率,但无法保证一定成功。支持SDF、MOL2、PDB格式文件。若文件中含有多个配体,默认只处理第一个。 时间步长: 默认值为0.002ps,输入范围:0.001<dt<=0.002,单位:ps。分子动力学模拟的步长,建议不超过0.002ps,步长越大,越难收敛。
图3 靶点配置输入PDB ID 在配置页面输入分子信息,及配置相关参数。 输入方式:支持绘制分子、选择文件、手动输入。 绘制分子:只能绘制一个分子,能够输入分子的SMILES。 选择文件:选择分子文件,最多支持100万个小分子,且分子文件大小不超过2GB。支持SDF、MOL2、P
导入流程 使用import命令从源项目导入流程到当前项目。 订阅和已导入的流程不支持再被导入到别的项目。 命令结构 health import workflow <workflow-name:version:source_project_name> [flags] 或 health
对接结合能作为一个约束条件进行分子生成,需要进行配置。最多可添加2个靶点。 如果不需要设置靶点,此步骤可以进行省略,如果设置了靶点,作业运行时间会加长。 通过“靶点设置”上传靶点,并且设置对接口袋。 此处靶点设置为可选参数,如果选择靶点设置,可以将对接活性作为一个约束条件进行分子
如何进行实名认证 实名认证入口 使用已注册的华为账号登录“华为云”。 单击账号名下拉框中的“账号中心”。 进入“账号中心”页面。 单击左侧导航中的“实名认证”,选择认证类型(个人认证/企业认证),根据页面提示进行实名认证。 实名认证类型介绍 表1 实名认证详细介绍 账号类型 认证类型(任选一种类型)