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依次登录集群中所有BMS,重复执行1.b~1.c,关闭所有BMS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,查看BMS的主机名。 $ hostname 图2 查看BMS的主机名 依次登录集群中所有BMS,重复执行1.b~2.b,获取所有BMS的主机名。 登录集群中任意一台BMS。
依次登录集群中所有BMS,重复执行1.b~1.c,关闭所有BMS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,查看BMS的主机名。 $ hostname 图2 查看BMS的主机名 依次登录集群中所有BMS,重复执行1.b~2.b,获取所有BMS的主机名。 登录集群中任意一台BMS。
集群中所有的BMS,均已安装IB驱动自带的OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。 # service firewalld stop # iptables -F 执行以下命令,查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld
MPI_REMSH 执行以下命令,查看MPI环境变量是否正常。 $ which mpirun 图1 检查MPI环境变量 在单个BMS上通过Spectrum MPI运行可执行文件。 假设hello.c文件在“/home/rhel/”目录下,生成的可执行文件名为hello,执行以下命令: $
$:表示在普通用户下,执行相关操作。 #:表示在管理员用户下,执行相关操作。 普通用户切换至管理员用户,请使用命令sudo su。 前提条件 已成功创建ECS集群,并绑定了弹性IP进行登录。 操作步骤 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令,防止系统超时退出。
启动集群 操作场景 停止状态的集群,如需再次开启集群执行作业,可将集群重新启动。 只有状态为“停止”的集群可进行启动操作。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。 在“集群管理”页面选择要启动的集群,单击后方操作列“更多 > 启动”。 单击“确定”。 在集群
图2 MPICH环境变量导入成功 回显结果如图2所示,表示环境变量导入成功。 执行以下命令,在单个BMS上运行MPICH。 执行以下命令,生成可执行文件。 $ mpicc hello.c -o hello 执行以下命令,在单个BMS上运行MPICH。 $ mpirun -np 2 /home/rhel/hello
MPI_IB_PKEY=步骤2.1中获取的pkey $source ~/.bashrc 如果存在多个pkey,使用英文逗号隔开。 执行以下命令,检查环境变量是否配置成功。 # which mpirun 图3 Platform MPI环境变量导入成功 执行下列命令,在单个ECS上运行Platform
source ~/.bashrc 执行下列命令,查看是否导入成功。 $ which mpirun 图2 Intel MPI环境变量导入成功 回显结果如图2所示,表示环境变量导入成功。 执行以下命令,在单个BMS上运行Intel MPI。 执行以下命令,生成可执行文件。 $ mpicc hello
$ source ~/.bashrc 执行以下命令,查看MPI环境变量是否正常。 $ which mpirun 图3 环境变量正常 回显如图3所示表示环境变量正常。 执行以下命令,在单个BMS上运行社区OpenMPI。 执行以下命令,生成可执行文件。 $ cd ~ $ vi hello
$ source ~/.bashrc 执行以下命令,查看MPI环境变量是否正常。 $ which mpirun 图3 环境变量正常 回显如图3所示表示环境变量正常。 执行以下命令,在单个BMS上运行社区OpenMPI。 执行以下命令,生成可执行文件。 $ cd ~ $ vi hello
包周期资源关机后仍继续扣费,需手动退订后可停止扣费。 只有状态为“运行中”的节点可执行停止操作。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“节点管理”。 在“节点管理”页面集群的下拉框切换到要进行节点操作的集群。 选择要进行停止操作的节点,单击后方操作中“更多 > 停止”。 单击“确定”。 提交成功
已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。 操作步骤 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。 登录用户为创建弹性云服务器时指定的用户名。 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令,验证参加测试的弹性云服务器之间是否可以免密码互相登录。
每个小指令可以执行一些较低阶的硬件操作,指令数目多而且复杂,每条指令的长度并不相同。由于指令执行较为复杂所以每条指令花费的时间较长。 鲲鹏计算:鲲鹏 CPU架构采用RISC精简指令集(RISC),RISC是一种执行较少类型计算机指令的微处理器,它能够以更快的速度执行操作,使计算机
停止集群 操作场景 按需类型的集群,如暂时没有任务需要执行,可使用集群停止功能对集群进行管理操作以节省费用。 包周期资源不适用,关机后仍继续扣费,需手动退订后可停止扣费。 有集群状态为“运行中”的集群可进行停止操作。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。
MAKE/Makefile.mpi 根据图1、图2,修改红框标识中的内容。其中,版本号需根据实际情况进行填写。 只修改图1、图2中红框标识的内容。 图1 修改Makefile文件01 图2 修改Makefile文件02 执行以下命令,编译lammps,并将当前目录生成的lmp_mpi文件拷贝至“/share”目录。
且使用同一个镜像主版本。 购买须知 第一次使用公有云服务时,系统将自动为您创建一个虚拟私有云,包括安全组、网卡。同时,用户可根据需要自行创建一个虚拟私有云,更多关于虚拟私有云的信息,请参见《虚拟私有云用户指南》。 用户可使用系统自动创建的安全组,也可以根据需要自行创建一个安全组使
节点删除(即集群缩容)时,需要保证集群中其他节点的状态均为“运行中”方可操作。 节点删除(即集群缩容)时,用户需要自行确认所选节点无作业执行,否则会导致正在运行的作业异常。 节点删除时,如果所选节点挂载了数据盘,节点删除时不会删除数据盘,需要用户手动删除清理,否则会继续扣费。 单节点删除操作步骤
Scheduler)调度器的自动化部署,使用HPC-S²控制台可以方便的对集群、节点以及共享存储进行查看以及管理操作。 如图1所示,通过HPC-S²控制台用户可以管理多个VPC网络下的多个集群。 图1 HPC-S²架构示意图 HPC-S²功能简介 HPC-S²主要面向对大规模计算有需求的企事业单位,使用HPC-S²控
规格:需与转化的私有镜像的云服务器规格保持一致。 镜像:选择“私有镜像”,然后选择制作私有镜像中制作的私有镜像。 虚拟私有云:集群中的所有弹性云服务器需在同一VPC、同一子网内。 弹性IP:选择暂不购买。 一个集群绑定一个EIP即可。因此,可以在创建应用集群后,再绑定EIP。 购买数量:待创建集群中弹性云服务器的数量。