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项目管理常用操作 对项目执行冻结、解冻、转移、分享和删除操作时,需要项目成员具备相应的权限,不同类型成员所拥有的权限请参见成员角色和权限。 冻结:冻结项目。一个项目可能由于某些原因暂时中止,此时可以将项目暂时冻结,待下次重新启动时再激活。处于“冻结”状态的项目,用户无法进入该项目
macOS系统:执行ps -p $$命令检查shell类型。 类型为bash:操作与Linux系统相同。 类型为zsh:执行history -p命令清除历史记录,重新登录命令行工具后,记录可恢复。执行rm -rf ~/.zsh_history命令,退出终端后再次执行history -p命令可删除记录文件,清空历史。
导入方式选择“项目”,选择项目名称,勾选需要导入的模板,可以在“导入模板名称”中修改模板名称,单击“确定”。 图1 从其他项目导入模板 平台也提供了yaml格式的数据库模板,您可以在本地编辑完成后上传至平台进行使用,数据库模板支持yaml或yml格式,且文件大小不能超过10M。 导入方式选择“上传”,
选择原始配体:选择靶点结构文件中已存在的原始配体用来定位口袋或作为片段优化,存在多个原始配体时可通过下拉框选择,与上传配体文件二选一。 上传配体文件:通过上传与靶点结构有良好结合构象的配体文件确定配体,若文件中包含多个配体,默认只处理第一个,与选择原始配体二选一。仅支持SDF
克隆已有的分析作业,作业的参数及流程一并克隆到流程设计器中。克隆作业后,请修改作业的输出数据路径,否则会有覆盖原有作业数据风险。 执行克隆操作有两种方式,请选择任一方式执行。 在分析作业列表中,单击“操作”列“克隆”,进入流程设计器页面。 图8 克隆作业 在分析作业列表中,单击作业名称,进入详情页。单击右上角“克隆”,进入流程设计器页面。
删除项目 使用delete命令删除项目。项目的所有者有权限执行该操作。 为了防止项目误删,执行项目删除命令后工具会提示用户进行二次确认输入要删除的项目,只有二次输入的项目名称和命令中的项目名称一致,命令行工具才会执行删除动作。 命令结构 health delete project
取消:一个数据作业中,单个数据操作执行过程为原子性操作,即要么不执行,要么需要执行过程不能中断。在执行完成后,“取消”操作才能生效。 删除:运行中的任务不支持删除,只可删除运行结束的数据。 重试:可对执行失败的任务从失败位置进行重试。 复制数据 在“数据中心”页面,使用“复制”,将本项目的某一个文件、文件夹复制到其他文件夹中。
macOS系统:执行ps -p $$命令检查shell类型。 类型为bash:操作与Linux系统相同。 类型为zsh:执行history -p命令清除历史记录,重新登录命令行工具后,记录可恢复。执行rm -rf ~/.zsh_history命令,退出终端后再次执行history -p命令可删除记录文件,清空历史。
指定待扩展的父级镜像(基础镜像)。除了注释以外,在文件的开头必须是一个FROM指令,后面的指令便在这个父级镜像的环境中运行,直到遇到下一个FROM指令。通过添加多个FROM命令,可以在同一个Dockerefile文件中创建多个镜像。 MAINTAINER 声明创建镜像的作者信息:用户名、邮箱,非必须参数。
EIHealth平台使用对象存储服务(OBS)存储原始数据、流程执行中间数据和执行结果数据。数据按项目维度进行隔离和划分,从项目角度进行数据的管理,不同项目的数据可以通过“导入数据”实现跨项目使用。您可以在“项目管理”页面,“数据”页签中,完成数据的添加、导入、归档、复制、删除等操作。 数据
盘古辅助制药平台使用对象存储服务(OBS)存储原始数据、作业执行中间数据和执行结果数据。数据按项目维度进行隔离和划分,从项目角度进行数据的管理,不同项目的数据可以通过“复制数据”实现跨项目使用。您可以在“项目管理”页面,“数据”页签中,完成数据的添加、导入、归档、复制、删除等操作。 数据
参数填写无误后,单击界面上方“启动作业”,运行作业。 步骤4:查看执行结果 在“项目管理”页面选择“作业”页签,单击创建的Docking Summary作业名称,进入详情页,查看执行结果。 图2 执行结果 作业运行完成后,单击应用进度条中的“输出参数”,可跳转至数据所在路径,获取运行结果数据。
方法,导入至自己的项目中使用。 流程 EIHealth中的分析流程包含分析过程中所需应用的执行信息和数据的输入、输出等参数定义。 分析流程至少由一个应用组成,在多个应用构成的流程中,一个应用的输出作为另一个应用的输入,流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流。 分析流程通
同时打开多个文件。 图8 多文件任意编排 当在一个Notebook中写代码时,如果需要实时同步编辑文件并查看执行结果,可以新建该文件的多个视图。 打开此文件,然后单击菜单栏“File>New View for Notebook”,即可打开多个视图。 图9 同一个文件的多个视图 父主题:
否 表示执行更新某行操作。--update、--delete 、--insert必须要传其中一个,三选一。 --delete -d 否 表示执行删除某行操作。--update、--delete 、--insert必须要传其中一个,三选一。 --insert -i 否 表示执行插入数
--log -g 否 在界面显示数据作业执行日志,需要与data-job-id一起使用。 说明: 参数--log和--file不能同时使用。 参数--log的优先级高于--file。如果命令中同时包含参数--log和--file,默认只执行--log。 --file -f 否 本
流程设计器 分析流程至少由一个应用构成,流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流,一个应用的输出作为另一个应用的输入。 流程设计器是一种用于创建、查看、修改流程的图形化工具。借助流程设计器,您可以拖拽工具到画布中,可视化链接各应用,指定应用的先后顺序。 流程设计器界面 流
单击“靶点优化”功能卡片,进入配置页面。 配置靶点文件和相关参数信息。 靶点文件:支持PDB格式文件,文件大小不能超过10M。若文件中含有多个受体,默认只处理第一个。 靶点预处理: 去配体:提交任务时系统会自动删除配体。 是否平衡电荷:是否加入离子,使体系电荷守恒,默认是平衡电荷。 蛋白力场:蛋白质力场支持amber03
的upload子文件夹下,分段任务执行成功后,对应的断点记录文件会被自动删除;分段任务执行失败或被中断后,下次执行该分段任务时会尝试通过对应的断点记录文件恢复任务。 --jobs -j 否 同步上传文件夹时批量任务的最大并发数,默认为配置文件中的defaultJobs。**说明:**工具会保证该值至少为1。
- - 查看 √ √ √ √ √ 药物虚拟筛选 创建、修改、删除 √ √ √ - - 查看 √ √ √ √ √ 项目列表中只显示您所在的项目。 一个用户可以是多个项目的成员。 父主题: 项目管理