检测到您已登录华为云国际站账号,为了您更好的体验,建议您访问国际站服务网站 https://www.huaweicloud.com/intl/zh-cn
不再显示此消息
如果当前目录为health所在目录,可以使用./health命令使用命令行工具。 如果当前目录不是health所在目录,需要使用绝对路径。如当前目录为/opt,假设health存放在/root/health-toolkit/下,需要指定/root/health-toolkit/health路径进行使用。 如果无法运行,提示Permission
log-path successfully! 清空配置请执行health config clear命令 在Notebook中使用命令行工具 在EIHealth开发环境Notebook中使用命令行工具时,请依据以下步骤配置代理。 打开Notebook,并选择Terminal,打开Notebook的命令行界面。
初始化配置”中的platform-id对应。 登录医疗智能体平台。 在右上角用户名中选择“个人设置”,获取平台ID。 图3 平台ID 父主题: 获取并使用命令行工具eihealth-toolkit
/指定当前路径。 使用数据、应用、流程、作业命令时,需先使用switch命令进入待操作的项目中。使用逻辑与EIHealth平台一致,进入项目,再对项目内的数据等内容进行操作。 命令行的参数缩写支持合并使用,例如,-r -s 可以写成-rs。 父主题: 获取并使用命令行工具eihealth-toolkit
用户管理 用户管理介绍 创建子用户 导入用户 登录平台方式 管理用户 父主题: 用户指南(基因平台)
OBS集群的IOPS达到了上限。 解决方案 更改分析存储介质,例如使用更高性能的IO加速方案(SFS Turbo、EVS),如使用SFS Turbo加速,在投递作业时可以选择“IO加速”。 降低通量运行,进而降低带宽、IO需求,使得带宽、IO满足生产需求。 优化软件算法,如使用内存做缓存等,降低软件的IO需求。
如何调用API 开通服务 构造请求 认证鉴权 返回结果
应用的参数和镜像启动命令如何设置? 创建应用时,需要设置应用的输入、输出参数和镜像的启动命令。需要您熟悉所制作的生物信息学软件的使用并具备一定的开发经验。 例如,设置FastQC应用的参数和镜像启动命令时,首先通过阅读FastQC介绍和FastQC命令说明了解软件的使用。并依照FastQC的调用命令设置参数和镜像启动命令。
后可以直接使用FastQC应用,或将其编排至流程,和其他应用一起使用。 创建FastQC应用时,需要您熟悉该软件的使用,并具备一定的开发经验。FastQC的详细介绍请参考FastQC介绍。使用EIHealth平台创建FastQC应用的详细步骤如下所示: 步骤1:搭建Docker环境
在API栏选择需要使用的服务,单击操作列的“开通服务”。 服务开通成功后,开通状态为“已开通”。 “开通服务”按钮置灰,说明您尚未认证,请先实名认证。 开通医学影像API 进入EIHealth控制台,在页面左上角切换区域“华南-广州”。 在API栏选择需要使用的服务,单击操作列的“开通服务”。
推荐扫码认证(即时完成认证) 请参见如何进行扫码认证。 银行卡认证(即时完成认证) 请参见如何进行银行卡认证。 证件认证(1-3个工作日) 请参见如何进行证件认证。 企业账号 推荐银行对公账户认证(最快30分钟) 请参见如何进行企业银行对公账户打款认证。 企业证件认证(0-3个工作日) 请参见如何进行企业证件认证。
子路径不支持同时设置允许删除状态;如果平台或者父目录设置允许删除,则之前子路径设置的禁止删除权限失效,全部子路径允许删除。 删除数据 以下操作步骤是在“数据”页面删除数据。您也可以使用命令行工具实现数据的删除。 删除数据 单击“操作”列的“更多>删除”,删除数据。 图8 删除数据
业未完成投递,Nextflow对于不存在的作业做了静默处理。 解决方案 避免启动作业后立即取消。 克隆作业即可。 process使用errorStrategy 'ignore'时整个作业不会结束 问题现象 process中使用了errorStrategy 'ignore',当该p
Access Key):与访问密钥ID结合使用的密钥,对请求进行加密签名,可标识发送方,并防止请求被修改。 使用AK/SK认证时,您可以基于签名算法使用AK/SK对请求进行签名,也可以使用专门的签名SDK对请求进行签名。详细的签名方法和SDK使用方法请参见API签名指南。 签名SDK
docker 快照方式制作镜像 如果后续镜像没有变化,可通过快照方式制作镜像。 快照方式制作镜像示例: 本示例中使用华为云弹性云服务器服务(ECS)创建一台云服务器,并使用快照方式制作bwa镜像。 购买弹性云服务器。 云服务器创建成功后,在云服务器列表页,选中待登录的弹性云服务器。
None 医学文本标注 医疗智能体 EIHealth 使用ModelArts进行数据管理和标注 07:08 医学文本管理和标注 医疗智能体 EIHealth 使用ModelArts进行团队标注 05:44 医学文本团队标注 药物虚拟筛选 医疗智能体 EIHealth 药物虚拟筛选
否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 --label -l 否 根据label标签搜索workflow 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 使用health get workflow
如何在Notebook中安装外部库? 在Jupyter Notebook中安装 例如,通过Jupyter Notebook在“TensorFlow-1.8”的环境中安装Shapely。 打开一个Notebook实例。 在Jupyter控制面板中,选择“New”(新建),然后选择“TensorFlow-1
到这里为止这个请求需要的内容就齐全了,您可以使用curl、Postman或直接编写代码等方式发送请求调用API。对于获取用户Token接口,返回的响应消息头中“x-subject-token”就是需要获取的用户Token。有了Token之后,您就可以使用Token认证调用其他API。 父主题: 如何调用API
对于获取用户Token接口,返回如图1所示。 其中“x-subject-token”就是需要获取的用户Token。有了Token之后,您就可以使用Token认证调用其他API。 图1 获取用户Token响应消息头 响应消息体 响应消息体通常以结构化格式返回,与响应消息头中Conten