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对于已完成HPC配置的弹性云服务器,您可以将其作为模板制作私有镜像,便于快速创建集群。该任务指导用户怎样将Linux弹性云服务器转化为私有镜像,包括管理控制台方式和基于HTTPS请求的API(Application programming interface)方式。 前提条件 已确保Linux云服务器网卡设置为DHCP的方式动态获取网络地址。
UEFI图2,否则系统无法启动。 图1 创建系统盘镜像 图2 选择启动方式 为创建的私有镜像打标签 登录到 API Explorer:https://apiexplorer.developer.huaweicloud.com/apiexplorer/doc?product=IMS&api=Up
配置节点互信 配置节点互信免密登录 STAR-CCM+集群运行时候需要跨节点运行,推荐使用互信免密登录。 # 生成ssh公钥和私钥 ssh-key-gen # 拷贝公钥到指定主机的~/.ssh/authorized_key文件中 ssh-copy-id root@目标主机IP 例如:ssh-copy-id
的弹性云服务器设施,并且这些设施是弹性的,可以根据需求伸缩。该任务指导用户如何创建支持IB网卡的弹性云服务器,包括管理控制台方式和基于HTTPS请求的API(Application programming interface)方式。 H2型、HI3型弹性云服务器使用带宽100Gb
对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装MPICH。 下载MPICH。 下载地址:https://aur.archlinux.org/packages/mpich/ 执行以下命令,解压并安装MPICH。 以mpich-3.3.2
IB驱动,执行3。 如果返回值与图1不同,表示弹性云服务器未安装IB驱动,执行2。 下载并安装对应的IB驱动。 在Mellanox官网https://network.nvidia.com/products/infiniband-drivers/linux/mlnx_ofed/,选
下载安装包“MLNX_OFED_LINUX-4.6-1.0.1.1-rhel7.6alternate-aarch64.tgz”。 下载地址:https://network.nvidia.com/products/infiniband-drivers/linux/mlnx_ofed/ 图2
安装IB驱动。 下载安装包“MLNX_OFED_LINUX-4.3-1.0.1.0-rhel7.3-x86_64.tgz”。 下载地址:https://network.nvidia.com/products/infiniband-drivers/linux/mlnx_ofed/ 图2
下,RDMA请求从用户空间发送到本地网卡并通过网络发送给远程网卡,这就减少了在处理网络传输流时内核内存空间与用户空间之间环境切换的次数。 没有CPU参与:应用程序可以访问远程内存,而不占用远程机器中的任何CPU。远程存储器将被读取,无需任何干预的远程进程(或处理器)。远程CPU中的缓存将不会被访问的内存内容填满。
系统默认关闭,如果是打开的,需要进行关闭。 判断系统是否开启超线程。 通过查询系统的物理核数和逻辑核数的关系可以判断是否开启多线程,如果:逻辑核数 = 物理核数,说明没有开超线程;逻辑核数 = 2*物理核数,说明系统开启了多线程。 Linux系统可以通过查询/proc/cpuinfo文件得到和cpu相关的信息,所需要参数解释如下:
对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装Intel MPI。 下载Intel MPI。 下载地址:https://software.intel.com/en-us/intel-mpi-library 执行以下命令,解压并安装Intel MPI。
创建应用集群 操作场景 您可以在几分钟之内,批量创建多台弹性云服务器。该任务指导用户使用制作的私有镜像创建应用集群,包括管理控制台方式和基于HTTPS请求的API(Application programming interface)方式。 管理控制台方式 登录管理控制台。 选择“计算 >
MPI应用(以版本l_mpi_2018.0.128为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装Intel MPI。 下载Intel MPI。 下载地址:https://software.intel.com/en-us/intel-mpi-library 执行以下命令,解压并安装Intel MPI。
已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装OpenMPI。 下载社区OpenMPI,版本号为“openmpi-4.0.2.tar.bz2”。 下载地址:https://download.open-mpi.org/release/open-mpi/v4.0/openmpi-4.0.2.tar.bz2
3的HPC-X版本是“hpcx-v2.2.0-gcc-MLNX_OFED_LINUX-4.3-1.0.1.0-redhat7.3-x86_64.tbz”。 下载地址:https://developer.nvidia.com/networking/hpc-x 将下载的软件包拷贝到BMS内(建议在“/home/rhel”目录下)。
通讯录安装 Udapl安装和测试 Udapl安装 cd /root wget https://linux.mellanox.com/public/repo/mlnx_ofed/4.1-1.0.2.0/SRPMS/dapl-2.1.10mlnx-OFED.3.4.2.1.0.41102
停止集群 操作场景 按需类型的集群,如暂时没有任务需要执行,可使用集群停止功能对集群进行管理操作以节省费用。 包周期资源不适用,关机后仍继续扣费,需手动退订后可停止扣费。 有集群状态为“运行中”的集群可进行停止操作。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。
依次执行以下命令,安装lammps。 yum install libjpeg-* yum install libpng12-* wget https://lammps.sandia.gov/tars/lammps-2Aug18.tar.gz tar -zxvf lammps-2Aug18
1Eval-rh7_Aug11.x86_64.rpm ibm_smpi-10.01.01.0Eval-rh7_Aug11.x86_64.rpm 下载地址:https://www-01.ibm.com/marketing/iwm/iwm/web/preLogin.do?source=swerpsysz-lsf-3
3及其之后的版本 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 获取软件包。 获取IBM Spectrum MPI软件包。 下载地址:https://www-01.ibm.com/marketing/iwm/iwm/web/preLogin.do?source=swerpsysz-lsf-3