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丢弃。强约束条件个数1~3个最佳,不宜过多,过多的强约束会导致输出结果数量少于预期或者没有分子生成。如果设置的官能团结构太大,建议放到弱约束,因为这样设置会使模型可探索的区间比较小,导致可能没有结果生成。 弱约束:生成的小分子不必要满足的约束条件。弱约束用于打分排序最终结果,输出
购买服务时,需使用华为主账号购买。如果不确定账号类型,可登录账号中心查看所属账号是主账号还是子账号(IAM账号)。 在账号中心左侧导航栏中有“我的主账号”页签,则说明是子账号;没有“我的主账号”页签,则说明是主账号。 图1 查看账号信息 联系技术支持开通白名单。 需要提供账号名,账号ID,项目ID等信息。相关信息获取方式如下:
购买服务时,需使用华为主账号购买。如果不确定账号类型,可登录账号中心查看所属账号是主账号还是子账号(IAM账号)。 在账号中心左侧导航栏中有“我的主账号”页签,则说明是子账号;没有“我的主账号”页签,则说明是主账号。 图1 查看账号信息 购买服务 医疗智能体平台提供包年包月、按需两种计费方式,您可以按需求进行选择。
图1 删除子用户 移除子用户 导入的用户,不支持删除,只支持移除。移除后不影响该用户操作其他服务。执行移除用户操作时,只有在该用户名下没有项目时,才可以被移除。在用户的操作列,单击“移除”,移除对应的用户。 图2 移除子用户 安全设置 在用户管理页面,可以重置用户的邮箱、手机
作业执行失败,有如下场景: 场景1:作业投递后处于运行中,运行过程正常,但是最后超时失败。 场景2:作业投递后处于运行中,但是无日志打印,也没有任何符合预期的输出文件生成。 场景3:作业投递后显示运行成功,但是根据日志分析作业有报错,也未能正确输出相关信息。 场景4:参数配置的不合理导致的作业执行失败。
行删除用户操作时,只有在该用户名下没有项目时,才可以被删除。在用户的操作列,单击“删除”,删除对应的用户。 图1 删除子用户 移除子用户 导入的用户,不支持删除,只支持移除。移除后不影响该用户操作其他服务。执行移除用户操作时,只有在该用户名下没有项目时,才可以被移除。在用户的操作列,单击“移除”,移除对应的用户。
已知的蛋白序列数量。 最小值:0 最大值:100 缺省值:100 has_more Boolean 文件中是否还有更多氨基酸序列没有处理。 请求示例 Fasta受体文件预览。 https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealt
流程”列表可以看到刚刚订阅的流程。 图2 查看订阅的流程 步骤2:订阅数据 若您本地有需要分析的二代基因组数据,则您可以用本地的数据。数据上传方法请参见上传数据。 若没有,可以先订阅资产市场里的示例数据进行分析,这里先用资产市场中的“人类基因组数据”和“NGS小数据集”进行分析。 图3 订阅数据 可以在“数据”列表可以看到刚刚订阅的流程。
设置Docker开机启动命令:systemctl enable docker 启动Docker命令:systemctl start docker 快照方式制作镜像 如果后续镜像没有变化,可通过快照方式制作镜像。 快照方式制作镜像示例: 本示例中使用华为云弹性云服务器服务(ECS)创建一台云服务器,并使用快照方式制作bwa镜像。
主键用于唯一地标识数据表中的信息,可通过设置复合主键将数据表中的多个数据设置为唯一,主键至多设置10个。 允许为空 主键所包含的列不允许设置为空。当数据库中某些数据允许没有值时,可设置为空。 是否可查询 依据模板中定义的列信息,给出数据库中可进行查询的数据,可查询至多设置10个。 描述 当参数设置为可查询时,可以添加描述信息。
fastqc命令进行搜索镜像。 若dockerhub上没有想要的镜像,可以利用基础的操作系统镜像进行构造,构造方式请参见用户指南。 选择和获取镜像。 搜索到的镜像列表中选择一个fastqc镜像进行pull,这里我们选择pegi3s/fastqc。 pull镜像。 若该镜像没有lastest版本则需进入dockerhub官网进行查询。
故障说明 作业运行时,每个应用称之为一个任务(Task)。部分场景下,任务输入数据异常,实际作业运行失败,但界面显示运行正常。 作业中子任务没有返回正确的值,但是容器仍正常退出return 0,此时判定为子任务已正确执行。 实际上作业的子任务对应的就是K8S中的一个Pod,其返回状
cn-north-4.myhuaweicloud.cn HTTPS 华东-上海一 cn-east-3 eihealth.cn-east-3.myhuaweicloud.com eihealth.cn-east-3.myhuaweicloud.cn HTTPS 华南-广州 cn-south-1 eihealth
ID。 图1 查看项目ID 调用API获取项目ID 项目ID通过调用查询指定条件下的项目信息API获取。 获取项目ID的接口为GET“https://{Endpoint}/v3/projects”,其中{Endpoint}为IAM的终端节点,可以从地区和终端节点获取。 响应示例如
响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 数据作业ID 请求示例 导入网上数据,数据链接为https://www.hhh.com/test.txt,目的目录为test。 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{pro
丢弃。强约束条件个数1~3个最佳,不宜过多,过多的强约束会导致输出结果数量少于预期或者没有分子生成。如果设置的官能团结构太大,建议放到弱约束,因为这样设置会使模型可探索的区间比较小,导致可能没有结果生成。如果分子较难优化,优化后的分子数过少,建议可以适当放宽强约束的条件设置,比如相似度可以放宽到0
询和下载相关信息。相关信息可参考https://www.nextflow.io/docs/latest/tracing.html 对于pod配置,暂不支持用户侧设置。若用户侧设置的情况下可能会导致对应Process执行失败。相关信息可参考https://www.nextflow.
nname为账号名,********为用户登录密码,project name为项目名称。可登录控制台“我的凭证”页面获取。 POST https://iam.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v3/auth/tokens Content-Type:application/json
新的镜像):将软件安装的流程写成DockerFile,使用Docker build构建成Docker镜像。 快照方式制作镜像 如果后续镜像没有变化,可通过快照方式制作镜像。 快照方式制作镜像示例: 本示例中使用华为云弹性云服务器服务(ECS)创建一台云服务器,并使用快照方式制作bwa镜像。
当移动对象是文件夹时,如果object以“/”结尾,object-dest没有以“/”结尾,会将object中的所有文件移动至object-dest中,文件夹名称与object-dest一致;如果object没有以“/”结尾,object-dest结尾无论加“/”或不加“/”,都会将