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上传者 项目数据上传者，可通过EIHealth平台或命令行工具上传数据。无法执行流程和Notebook等操作。 观看者 项目查看人员仅具备项目查看权限，无项目操作权限。
使用CUDA11.0环境前，需要执行以下命令导入环境变量。
打标签命令 依次执行以下命令为镜像打标签。
客户端上传镜像 使用命令行工具eihealth-toolkit上传镜像，详细的上传过程请参见上传镜像到SWR镜像仓库，详细的命令介绍请参见“命令行工具 > 镜像管理命令”章节。 父主题： 镜像管理
异常：数据库异常，可能是由于CSS到期、CSS密码改变、CSS资源解绑等问题导致数据库异常。 图2 删除数据库和追加数据 可以通过“追加数据”到数据库来增加数据条数。每次追加最多追加500万条数据。 图3 追加数据 CSS相关常见问题请参考常见问题文档中的CSS章节。
每一个Cell有两种模式：命令模式和编辑模式。 最左侧为蓝色条时，是命令模式，绿色条表示编辑模式（此时Cell中有光标，可以进行代码编写）。在命令模式下，按下“Enter”键或者鼠标单击代码框可以进入编辑模式。
命令行工具迭代更新。 开放镜像管理类API。 商用 用户指南 命令行工具 API参考 2021年3月 序号 功能名称 功能描述 阶段 相关文档 1 医疗智能体EIHealth平台迭代更新 支持消息、邮件、安全、商标设置。
建议启动并发作业数最多为8个。 父主题： Nextflow
修改yaml模板时，详细的命令和参数请参见作业配置文件说明。
使用命令行工具上传 命令行工具（eihealth-toolkit）配套EIHealth平台，提供数据、应用、流程和作业资源的管理和使用，支持上传最大为48.8TB的单个文件。 数据上传方法请参见命令行工具概述。 对于非挂载目录以外的目录下的文件，重启Notebook后会消失。
使用命令行工具上传 命令行工具（eihealth-toolkit）配套EIHealth平台，提供数据、应用、流程和作业资源的管理和使用，支持上传最大为48.8TB的单个文件。 数据上传方法请参见命令行工具概述。 父主题： 数据管理
使用命令行工具上传 命令行工具（eihealth-toolkit）配套EIHealth平台，提供数据、应用、流程和作业资源的管理和使用，支持上传最大为48.8TB的单个文件。 父主题： Notebook
数据管理 数据管理简介 添加数据 发布数据 数据管理常用操作 归档数据 数据控制与数据审计 命令行工具概述 父主题： 用户指南（基因平台）
基于二代测序的基因组突变检测 NGS流程简介 配置命令行工具 上传数据 制作并上传镜像 创建应用 搭建NGS流程 执行分析作业 批量执行NGS分析
最小长度：0 最大长度：1024 css_id 是 String css集群id。 最小长度：1 最大长度：128 file 是 DatabaseFile object 数据库文件。 columns 是 Array of strings 数据文件列名。
执行如下命令。
入门实践 表1 常用最佳实践 实践 描述 基于二代测序的基因组突变检测 本最佳实践提供了通过命令行工具上传数据、上传镜像后，在医疗智能体平台搭建NGS流程，执行分析作业及批量执行NGS分析。
read-cmd string 读取输入文件时使用的命令，如读取.gz文件使用zcat，文本文件使用cat。 para-str string 对扩展参数的支持，可以不填。 genome-dir directory 输入的参考基因组序列，已经使用STAR构建了index。
最小长度：1 最大长度：32768 响应参数 状态码： 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String task id command String task执行命令 status String task状态 error_action String task
最小长度：1 最大长度：32 数组长度：0 - 5 image 是 String docker镜像地址 取值范围[5-255]，不能包含中文字符 最小长度：5 最大长度：255 commands 是 Array of strings docker启动时执行命令 取值范围[1-300
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