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z轴的坐标。 最小值:-9999999 最大值:99999999 数组长度:3 - 3 size 是 Array of floats 口袋尺寸大小; x, y, z轴的大小。 最小值:2 最大值:500 数组长度:3 - 3 padding 否 Float 填充。 最小值:0 最大值:20 表9
z轴的坐标。 最小值:-9999999 最大值:99999999 数组长度:3 - 3 size Array of floats 口袋尺寸大小; x, y, z轴的大小。 最小值:2 最大值:500 数组长度:3 - 3 padding Float 填充。 最小值:0 最大值:20 表10
命令不支持下载引用项目中的数据。 数据在下载的过程中,受网络影响可能出现损坏,下载命令默认会在下载完成后,验证项目中数据的MD5值与本地数据的MD5值的一致性,以及验证项目中数据的大小与本地数据大小一致性。 命令结构 health download <srcdir> <destdir>
最大长度:256 type String 属性预测类型 枚举值: binary numerical smiles Array of strings 用于建模的smiles列表 values Array of numbers 用于建模的属性值列表 表5 CustomPropsResult 参数
可以上传48.8TB的单个文件。 数据在上传的过程中,受网络影响可能出现损坏,上传命令默认会在上传完成后,验证项目中数据的MD5值与本地数据的MD5值的一致性,以及验证项目中数据的大小与本地数据大小一致性。 命令结构 health upload <srcdir> <destdir>
z轴的坐标。 最小值:-9999999 最大值:99999999 数组长度:3 - 3 size 是 Array of floats 口袋尺寸大小; x, y, z轴的大小。 最小值:2 最大值:500 数组长度:3 - 3 padding 否 Float 填充。 最小值:0 最大值:20 表9
使用AutoGenome镜像 AutoGenome是Notebook镜像,利用AutoML等技术帮助科研工作者在基因组学数据上端到端实现深度学习网络搜索,训练,评估,预测和解释的工具包。 使用AutoGenome镜像的详细步骤如下所示: 步骤1:订阅镜像 步骤2:创建Notebook
一级的配置,填值会覆盖更新。覆盖关系:作业->流程->应用 gpu_type: '' # gpu架构类型,取值范围 ' '|GPU|Snt9|D310。对于流程和作业,不填默认使用前一级的配置,填值会覆盖更新。覆盖关系:作业->流程->应用
预平衡时长,单位ps。 最小值:20 最大值:200 缺省值:100 pocket_detection_time Integer 口袋发现时长,单位ns。 最小值:20 最大值:50 缺省值:50 num_surface_points Integer 表面原子离散点数量。 最小值:10 最大值:50 缺省值:20
可以上传48.8TB的单个文件。 数据在上传的过程中,受网络影响可能出现损坏,上传命令默认会在上传完成后,验证项目中数据的MD5值与本地数据的MD5值的一致性,以及验证项目中数据的大小与本地数据大小一致性。 命令结构 health upload <srcdir> <destdir>
流程和作业,不填默认使用前一级的配置,填值会覆盖更新。覆盖关系:作业->流程->应用 gpu_type: '' # gpu架构类型,取值范围 ' '|GPU|Snt9|D310。对于流程和作业,不填默认使用前一级的配置,填值会覆盖更新。覆盖关系:作业->流程->应用
z轴的坐标。 最小值:-9999999 最大值:99999999 数组长度:3 - 3 size Array of floats 口袋尺寸大小; x, y, z轴的大小。 最小值:2 最大值:500 数组长度:3 - 3 padding Float 填充。 最小值:0 最大值:20 表10
响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 mode 是 String 创建配体相似度图的模式:中心模式、自由模式。 枚举值: CENTER FREE ligands 是
资产市场简介 资产市场是在EIHealth平台的基础上构建的开发者生态社区,提供镜像、数据、应用和流程的内容共享。提供安全、开放的资产共享和使用,加速基因、药物、临床应用的开发与落地,保障开发生态链上各参与方高效地实现各自的商业价值。 订阅资产 资产市场提供官方发布的镜像、数据、
分子属性预测 基于盘古药物分子大模型,预测化合物ADMET相关的80多种成药属性,有些属性的预测值会给出置信区间,更好地辅助分子设计。 单击“分子属性预测”功能卡片,进入配置页面。 图1 小分子配置页面 在配置页面输入分子信息,及配置相关参数。 输入方式:支持绘制分子、选择文件、手动输入。
JupyterLab简介及常用操作 JupyterLab是一个交互式的开发环境,是Jupyter Notebook的下一代产品,可以使用它编写Notebook、操作终端、编辑MarkDown文本、打开交互模式、查看csv文件及图片等功能。 可以说,JupyterLab是开发者们下
EIHealth中的流程由应用搭建形成,应用包含了数据的输入、输出等参数定义。 应用呈现的信息在创建应用过程中定义,包含参数名称、数据类型、描述、默认值等。 单击参数名称,可查看参数的详细信息。 单击输入参数图标,可指定输入数据路径。输出数据路径在新建流程和运行分析作业时可指定。 新建流程 单击“新建流程”,进入流程设计器页面。
预平衡步数,默认为50000。 最小值:1 最大值:200000 num_equilibrium_steps Integer 平衡步数,默认为500000。 最小值:1 最大值:10000000 timestep_size Float 时间步长,单位ps,取值范围:大于0,小于等于0.005。 最小值:0.001
时间步长,单位ps,取值范围:大于0,小于等于0.005。 最小值:0.001 最大值:0.005 缺省值:0.002 num_lambda 否 Integer lambda个数。 最小值:2 最大值:30 缺省值:20 响应参数 状态码: 201 表11 响应Body参数 参数 参数类型 描述
做计数。 最小值:0 最大值:1000 缺省值:100 count_limit 否 Integer 计数上限,若分子数量大于计数上限,则终止计数并在结果中标明计数不完整(has_more=true),计数数量应不小于preview_count。 最小值:0 最大值:1000000