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/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/databases/{database_id}/data 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项
objects 数据库列信息列表 create_time String 创建时间 primary_key String 主键 is_prefab Boolean 是否是预置模板 表5 DatabaseColumnDto 参数 参数类型 描述 name String 列名 最小长度:1 最大长度:55
"source_database_id": "e06f784f-c561-4323-92cd-....", "destination_database_id": "0589ab48-d685-483f-92b7-....", "destination_database_name":
缺省值:false remove_ligand 否 Boolean 去除配体分子。 缺省值:false add_hydrogen 否 Boolean 增加氢原子。 缺省值:false 表4 ReceptorDrugFileReq 参数 是否必选 参数类型 描述 source 是 String
"24dfce53-0303-4b46-a2d9-4a067812b289", "database_name" : "demo-database", "database_id" : "4f7fce53-0303-4b46-a2d9-4a067812b289",
启动作业时,如果包含不存在的计算节点标签,回显类似下图,请先添加计算节点标签。 计算节点标签添加方法:在平台右上角单击用户名,选择“系统资源 > 计算资源”,在计算节点的操作列单击“更多 > 标签管理”,添加标签。上图示例中需要添加的标签名称为labelsss1。 使用本地已填写好的作业模板job.yaml运行分析作业。
创建数据库实例 使用create命令创建数据库实例。 命令结构 health create database instance <instance-name> [flags] 或者 health create db instance <instance-name> [flags]
PocketFragment objects 配体文件列表,最多支持1个。 数组长度:0 - 1 num_trials 否 Integer 生成分子数量。 最小值:1 最大值:5000 缺省值:1000 model_ids 否 Array of strings 模型id列表。 最小长度:1 最大长度:128
是 Array of DockingReceptorDto objects 受体文件列表。 数组长度:1 - 20 ligands 是 Array of LigandDto objects 配体文件列表,当前仅支持1个。 数组长度:1 - 1 engine 否 String 引擎,
平衡状态。预平衡模拟时长=预平衡步数×时间步长。时长增加,作业运行时间延长。 平衡时长:默认值:1ns,取值范围:0-10ns。平衡阶段的模拟,用于自由能微扰计算。平衡模拟时长=时间步长×平衡步数/1000,单位为ns。时长增加,作业运行时间延长。 λ个数:默认值20,输入范围为2-30。自由能微扰的窗口数量。
自动作业结束时间 database_id String 自动作业依赖的数据库ID database_column String 自动作业状态更新列 database_column_type String 自动作业状态更新列的类型,不填默认为EXISTED clean_database_column
数据作业id,不填写时未获取数据作业列表,填写时为获取数据作业详情。 --name -n 否 数据作业名称,根据名称搜索作业,获取数据作业列表时生效。 --type -t 否 数据作业类型,根据类型搜索作业,获取数据作业列表时生效。支持获取以下类型数据: CLONE_DATA DELETE_DATA
export PATH=~/anaconda3/bin:$PATH source ~/.bashrc 测试安装。 conda -V 查看当前环境列表,并创建新环境参数。 conda env list conda create -n py37 python=3.7 输入“y”,按“Enter”继续。
缺省值:false remove_ligand 否 Boolean 去除配体分子。 缺省值:false add_hydrogen 否 Boolean 增加氢原子。 缺省值:false 表5 ReceptorDrugFileReq 参数 是否必选 参数类型 描述 source 是 String
否 资源类型,根据资源类型筛选消息列表。 --operator -e 否 操作人,根据操作人筛选消息列表。 --project-name -p 否 项目名称,根据项目名称筛选消息列表。 --status -s 否 消息状态,根据消息状态筛选消息列表。 --limit -l 否 返回条数,默认20,范围0-1000。
PocketFragment objects 配体文件列表。 数组长度:1 - 1 num_trials Integer 生成分子数量。 最小值:1 最大值:5000 缺省值:1000 model_list Array of BasicDrugModel objects 模型列表。 molecular_weight
"24dfce53-0303-4b46-a2d9-4a067812b289", "database_name" : "demo-database", "database_id" : "4f7fce53-0303-4b46-a2d9-4a067812b289",
receptors Array of DockingReceptorDto objects 受体文件列表。 数组长度:1 - 20 ligands Array of LigandDto objects 配体文件列表,当前仅支持1个。 数组长度:1 - 1 engine String 引擎,支持D
取值范围:输入字符最大长度为255 最大长度:255 database_id 是 String 自动作业依赖的数据库ID 最小长度:1 最大长度:128 database_column 是 String 自动作业状态更新列 最小长度:1 最大长度:55 database_column_type 否 String
"workflow" }, "database_id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "database_name" : "demo-database" } ], "count" : 1 } 状态码