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使用-t命令,指定运行所需的线程数量。-o命令,指定存放输出结果的文件夹。输入文件夹已在填写参数时指定。 fastqc -t ${threads} -o ${output-dir} ${input-file} 选择“X86”CPU架构,CPU需求建议0.2起。GPU类型选择“无”。
引用数据库 引用数据库 平台支持引用其他项目的数据库,用户需是其他项目中的成员,且为其他项目的“所有者”或“管理员”。 引用的数据库为只读状态。引用的数据库不支持导入数据。 图1 引用数据库 父主题: 数据库管理
FailedReasonRecord objects 部分失败原因和数量。 表14 FailedReasonRecord 参数 参数类型 描述 reason String 失败原因。 count Integer 失败数量。 请求示例 无 响应示例 状态码: 200 OK { "basic_info"
标准存储单AZ包适合数据分享、内容分享、热点对象应用场景。归档存储适合档案数据、医疗影像场景。详细可参考存储类别。 规格 套餐包支持的购买规格。 购买数量 购买套餐包的数量。取值范围:1-50。 购买时长 购买套餐包的时长。最短为一个月,最长为一年。 生效时间 选择购买套餐包后的生效时间。目前支持支付完成后立即生效和指定生效时间两种方式。
参数类型 描述 index 是 Integer 配体索引(从0起编号)。 最小值:0 最大值:99 file 是 DrugFile object 配体文件。 name 是 String 配体名称,若无名称则自动命名,格式为UNK+索引(从1起编号)。 最小长度:1 最大长度:32 smiles
资源包类型 支持标准存储单AZ包。 标准存储单AZ包适合数据分享、内容分享、热点对象应用场景。 规格 套餐包支持的购买规格。 购买数量 购买套餐包的数量。取值范围:1-50。 购买时长 购买套餐包的时长。最短为一个月,最长为一年。 生效时间 选择购买套餐包后的生效时间。目前支持支付完成后立即生效和指定生效时间两种方式。
作业执行启动、编辑、删除操作,运行中的作业可以执行停止操作。 图1 自动作业 前提条件 在“工具”中完成流程创建。 在“数据库”中完成样本集的数据库创建。数据库的每一行对应一个任务,如果满足触发条件,就会在平台自动运行,并在分析任务列表添加一条记录。 创建自动作业 在“作业”页面左侧,单击“自动作业”页签。
分子骨架表达式。 最小长度:1 最大长度:1024 top_n Integer 生成分子数量。 最小值:0 最大值:1000 databases Array of strings 可供搜索分子的公共数据库名称列表。 最小长度:1 最大长度:128 数组长度:0 - 10 custom_databases
"is_prefab" : false } ] } 状态码 状态码 描述 200 OK 错误码 请参见错误码。 父主题: 数据库管理
的事情,因为该请求被设置为拒绝访问,建议直接修改该请求,不要重试该请求。 404 Not Found 所请求的资源不存在。 建议直接修改该请求,不要重试该请求。 405 Method Not Allowed 请求中带有该资源不支持的方法。 建议直接修改该请求,不要重试该请求。 406
task展示名称 resources: cpu: 2C # 'CPU数量' memory: 4G # '内存大小' gpu_type:
配体列表可显示总条数,但最多展示1000个小分子,对接时使用全量小分子。配体来源包含:数据中心、示例数据、公共库。且公共库预置了分子数据库,包含了陶术数据库、DrugSpaceX数据库、DrugBank数据库可以进行使用,单击“公共库”,可以进行选择。 图2 选择配体文件 单击“下一步”,在对接设置页面配置相关参数。
若分子不满足其中任何一条约束则会被直接丢弃。强约束条件个数1~3个最佳,不宜过多,过多的强约束会导致输出结果数量少于预期或者没有分子生成。如果设置的官能团结构太大,建议放到弱约束,因为这样设置会使模型可探索的区间比较小,导致可能没有结果生成。 弱约束:生成的小分子不必要满足的约
num_expected Integer 期望条目数 num_strong_constraints Integer 强约束数量 num_weak_constraints Integer 弱约束数量 prop_names Array of strings 分子ADMET属性名列表 result Array
数据库管理命令 创建数据库模板 获取数据库模板 删除数据库模板 导入数据库模板 创建数据库实例 获取数据库实例 删除数据库实例 引用数据库或者导入数据到指定数据库 修改数据库实例
是否必选 参数类型 描述 file 是 FastaReceptor object 受体文件。 preview_count 否 Integer 预览数量。 最小值:0 最大值:100 缺省值:1 count_limit 否 Integer 计数上限。 最小值:0 最大值:100 缺省值:100
某一task的日志。 --task -a 否 task名称。如果是并发的task,那么默认获取索引号为0的task实例,如果要查看别的实例,格式: --task task名称;实例索引,如--task task-1;1。 --finish-from-time -x 否 查询任务完成起始时间。例如,2006-01-02
Integer 预测路径的最大深度 最小值:3 最大值:12 max_prediction_per_product Integer 每个产物的最大反应数量 最小值:2 最大值:20 表5 SynthesisResult 参数 参数类型 描述 smiles String 产物smiles序列 top_n
数据库(可选) 数据库对应的是“项目管理>数据库”功能,可按使用需要购买。 图1 购买数据库 父主题: 购买计算资源(主账号操作)
数据库管理 数据库管理 模板管理 父主题: API(医疗智能体平台)