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创建分析应用时,您可以通过Docker Hub等镜像仓库,搜索引擎,自己制作等途径获取所需的镜像。 例如,可在Docker Hub获取bwa软件(用于将基因序列比对到参考基因组上)。 以下类型镜像,建议您通过Docker Hub获取,不建议自己制作。 基础操作系统类镜像,如Ubuntu、Suse、Centos等。
201 表5 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 数据库id。 请求示例 创建数据库,数据库名称为database_name,选择css集群,上传项目桶中file/test.csv的数据库数据,设置列名为SMILES和NAME,打开共享开关。 https://
创建数据库实例 使用create命令创建数据库实例。 命令结构 health create database instance <instance-name> [flags] 或者 health create db instance <instance-name> [flags]
修改数据库实例 使用edit命令修改数据库实例。 命令结构 health edit database instance <instance-id> [flags] 或者 health edit db instance <instance-id> [flags] 表1 参数说明 参数
在平台右上角用户名中选择“系统设置”,设置邮件配置。 服务器地址:邮箱开通SMTP功能时的服务器地址,不同邮箱开通SMTP方式不同,请使用搜索引擎查找邮箱开通SMTP方式。 邮箱地址:填写邮箱地址,用于发送EIHealth平台的消息通知。 用户名:邮箱的用户名,如果未修改过,默认为邮箱地址。
由于Nextflow支持的特殊字符继承了Nextflow原有特性,因此请排查参数值,或者选择的数据名称,或者路径中带的特殊字符是否符合Nextflow原有特性。 建议启动并发作业数最多为8个。 父主题: Nextflow
约束与限制 您能创建的EIHealth资源的数量与配额有关系,具体请参见服务配额。 更详细的限制请参见具体API的说明。 父主题: 使用前必读
查询数据库资源 功能介绍 查询数据库资源 URI GET /v1/{project_id}/system/database-resources 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1
参数说明 参数 简写 是否必选 说明 instance-id 无 否 数据库实例 id,不填写时表示获取数据库实例列表,填写时表示获取数据库实例详情。 --data -d 否 是否查询数据库数据,需要和database-id参数一起使用。 --limit -l 否 限制量,默认为10,取值范围[0
bond acceptors,氢键受体的数量,最佳在0~12之间。 nHD: Number of hydrogen bond donors,氢键供体的数量,最佳在0~7之间。 nRot: Number of rotatable bonds,旋转键的数量,最佳在0~11之间。 nRing:
默认值30min,取值范围5-60。 每个产物最大反应数量:合成路径中每一个中间产物最多有多少种可能的反应,按照反应置信度从高到低排序。最大反应数量增加,每个中间产物的可搜索反应范围数量增加,作业运行时间延长;最大反应数量减少,可能会有部分合理反应未能纳入搜索。默认20,取值范围2-20。
PocketFragment objects 配体文件列表,最多支持1个。 数组长度:0 - 1 num_trials 否 Integer 生成分子数量。 最小值:1 最大值:5000 缺省值:1000 model_ids 否 Array of strings 模型id列表。 最小长度:1
果选择的“按需”计费,无需选择购买时长。 开通自动续费后,系统将在产品到期前自动续费,续费周期为一个月,无需用户再手动操作。 购买数量:设置购买数量,最多10个。 单击“立即购买”。 在确认购买弹窗中单击“确认”。 计算资源购买后,在操作列单击“更多”,可以执行开机、关机、重启、标签管理、调度设置操作。
配额管理 为防止资源滥用,平台限定了各服务资源的配额,对用户的资源数量和容量做了限制。如果当前资源配额限制无法满足使用需要,您可以联系技术支持工程师申请扩大配额。 怎么查看我的配额 在平台右上角用户名中选择“配额管理”,查看配额。 图1 配额管理 父主题: 用户指南(基因平台)
20-200,单位:ps。时长增加,作业运行时间延长。 口袋发现时长:默认值为50ns,输入范围:20-50。 表面原子离散点数量:每个表面原子离散点数量。默认值为20,输入范围: 10-50。 探针半径:控制产生的离散点到表面原子的距离。默认值为1.4 ,输入范围: 1.4-5,单位:Å。
project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 database_id 是 String 数据库实例id 最小长度:1 最大长度:128 row_num 是 Long 数据行号,即_row_num值 最小值:0 最大值:2147483647
FailedReasonRecord objects 部分失败原因和数量。 表15 FailedReasonRecord 参数 参数类型 描述 reason String 失败原因。 count Integer 失败数量。 请求示例 无 响应示例 状态码: 200 OK { "basic_info"
获取数据库资源规格列表 功能介绍 获取数据库资源规格列表 URI GET /v1/{project_id}/system/database-resources/flavors 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。
参数 参数类型 描述 index Integer 配体索引(从0起编号)。 最小值:0 最大值:99 file DrugFile object 配体文件 name String 配体名称,若无名称则自动命名,格式为UNK+索引(从1起编号)。 最小长度:1 最大长度:32 smiles
个文件的配体数量,若该值为false则表该配体文件含有count数量个配体;若该值为true则表示该配体文件含有大于count数量个配体(即count不完全统计);例如:count=100且has_more=true,则前端可显示该配体文件含有"100+个"小分子。 表5 LigandPreviewInfoDto