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获取用户OBS桶内对象 - 医疗智能体 EIHealth
最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 状态码: 200 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 count Integer 数据(文件夹、文件)总数量 objects Array of BucketObjectDto objects 数据列表 表5 BucketObjectDto
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恢复归档 - 医疗智能体 EIHealth
最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 overwrite 否 Boolean 执行策略(true:全部覆盖,false:全部跳过,默认为true) 缺省值:true target_folder 否 String 目标文件夹 最小长度
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取消作业 - 医疗智能体 EIHealth
未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。
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删除应用 - 医疗智能体 EIHealth
未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 通过指定应用的ID或名称和版本删除应用。
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创建数据库实例 - 医疗智能体 EIHealth
实例描述 最小长度:0 最大长度:1024 import_data 否 ImportDatabaseDataReq object 导入数据请求体 表4 ImportDatabaseDataReq 参数 是否必选 参数类型 描述 files 是 Array of strings 导入文件
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获取项目审计日志 - 医疗智能体 EIHealth
最小长度:1 最大长度:128 表2 Query参数 参数 是否必选 参数类型 描述 path 是 String 指定文件夹(路径) 最小长度:0 最大长度:2000 limit 否 Integer 限制量,单次查询总量,必须由数字组成,默认为100,取值范围[1,1000] 最小值
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简介 - 医疗智能体 EIHealth
流程中的每个process可以通过配置文件快速的定制并行执行的样本数目,大大节约了生信人员搭建组学分析流程的时间。 医疗智能体(EIHealth)平台集成了Nextflow框架,支持用户直接在医疗智能体(EIHealth)平台安装Nextflow。 父主题: Nextflow
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获取任务实例 - 医疗智能体 EIHealth
未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。
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下载镜像 - 医疗智能体 EIHealth
未填写则使用配置文件中的项目名。
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查看执行结果 - 医疗智能体 EIHealth
单击具体的输出参数可跳转到具体的文件位置。 图2 获取作业结果 同时,项目支持导出作业的元数据信息,包括以下内容。 作业的基本配置信息,以yaml文件导出,包含作业名称,依赖的workflow名称/版本,基本的CPU/Memory配置,输入输出参数等信息。
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获取应用详情 - 医疗智能体 EIHealth
对于STRING类型,匹配字符串内容,比如后缀约束.fastq;对于ENUM类型,可以提示一定要在param_enum列表范围内取值;对于FILE类型,约束文件后缀类型;对于DIRECTORY类型,提示目录下需要包含哪些文件; 最小长度:0 最大长度:64 values Array
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查询数据列表 - 医疗智能体 EIHealth
100,取值范围[1,1000] 最小值:1 最大值:1000 缺省值:100 offset 否 Integer 偏移量,查询起始偏移,必须由数字组成,默认为0,取值范围[0,100000000] 最小值:0 最大值:100000000 缺省值:0 path 否 String 指定文件夹
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列举study所有作业 - 医疗智能体 EIHealth
output_file_type String 生成study作业结果的文件的类型 workflow_name String 使用的workflow名称 label String 使用的workflow标签 create_time String 作业创建时间 update_time
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创建应用 - 医疗智能体 EIHealth
对于STRING类型,匹配字符串内容,比如后缀约束.fastq;对于ENUM类型,可以提示一定要在param_enum列表范围内取值;对于FILE类型,约束文件后缀类型;对于DIRECTORY类型,提示目录下需要包含哪些文件; 最小长度:0 最大长度:64 values 否 Array
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删除流程 - 医疗智能体 EIHealth
未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 通过指定流程的ID或名称和版本删除流程。
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设置供应商配置 - 医疗智能体 EIHealth
最小长度:1 最大长度:32768 表3 FormData参数 参数 是否必选 参数类型 描述 file 是 File 文件流对象 name 是 String 供应商名称 最小长度:1 最大长度:30 响应参数 无 请求示例 设置供应商配置,设置名称,上传图片 https://eihealth.cn-north
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创建归档 - 医疗智能体 EIHealth
未填写则使用配置文件中的项目名。 --storage-type -s 否 归档的存储类型,支持STANDARD和COLD。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程。
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导入数据库模板 - 医疗智能体 EIHealth
未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。
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新建应用 - 医疗智能体 EIHealth
参数填写时,输入参数及输出参数有字符串(String),文件(File),文件夹(Directory),枚举(Enum)四种类型。 图5 参数信息 对于输入参数,打开“并发”开关,在启动作业时,每个参数可以设置多个参数值,自动生成多个作业并发执行。
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更新镜像 - 医疗智能体 EIHealth
未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 Linux .