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更新镜像 - 医疗智能体 EIHealth
未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 Linux .
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导入流程 - 医疗智能体 EIHealth
未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 从源项目lmx-project导入流程,并重命名流程。
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列举study - 医疗智能体 EIHealth
output_file_type String 生成study作业结果的文件的类型 workflow_name String 使用的workflow名称 label String 使用的workflow标签 create_time String 作业创建时间 update_time
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修订记录 - 医疗智能体 EIHealth
发布日期 修改说明 13 2024-05-09 新增 测试CSS集群连接 CSS集群解绑 绑定CSS集群 获取CSS集群列表 获取最终租户CSS集群列表 创建分子或分子复合物批量下载任务详情 查询分子或分子复合物批量下载任务详情 创建数据库 删除数据库 更新药物数据库 数据库追加文件
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上传镜像 - 医疗智能体 EIHealth
未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 Windows health docker push demo-image:v1.0 -d "this is a desc" -t APP Linux .
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查询镜像 - 医疗智能体 EIHealth
未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 查询当前所在项目demo-project下面的类型为APP的镜像。
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获取流程详情 - 医疗智能体 EIHealth
对于STRING类型,匹配字符串内容,比如后缀约束.fastq;对于ENUM类型,可以提示一定要在param_enum列表范围内取值;对于FILE类型,约束文件后缀类型;对于DIRECTORY类型,提示目录下需要包含哪些文件; 最小长度:0 最大长度:64 values Array
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获取用户OBS桶列表 - 医疗智能体 EIHealth
OBJECT:桶列表;PFS:并行文件系统。不传返回所有 请求参数 表3 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户Token。
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重试Nextflow作业 - 医疗智能体 EIHealth
最小长度:1 最大长度:32768 表3 FormData参数 参数 是否必选 参数类型 描述 params 否 File 流程参数列表文件,取值范围[0, 10M] 响应参数 无 请求示例 重试Nextflow作业 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com
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查询分子或分子复合物批量下载任务详情 - 医疗智能体 EIHealth
最小长度:1 最大长度:16 filename String 下载文件名。 最小长度:1 最大长度:512 out_dir String 下载路径。 最小长度:1 最大长度:2000 请求示例 无 响应示例 状态码: 200 查询分子或分子复合物批量下载任务详情响应体。
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删除镜像标签 - 医疗智能体 EIHealth
未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 假设当前所在项目为lmx-project-01,命令及返回结果示例: 删除其他项目lmx-project-02的导入镜像tag。
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数据管理简介 - 医疗智能体 EIHealth
表1 上传数据方式 上传数据方式 说明 “数据中心”页面上传 通过“数据中心”页面上传数据,支持上传最大为1GB,最多20个文件。 数据上传方法请参见“数据”页面上传。 父主题: 数据管理
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基本概念 - 医疗智能体 EIHealth
例如一个Docker镜像可以包含一个完整的Ubuntu操作系统环境,里面仅安装了用户需要的应用程序及其依赖文件。 项目 项目是EIHealth平台的一个工作空间,可以在项目中存储数据,上传镜像和创建分析作业。也可以将团队成员引入到项目中,并通过划分角色实现项目权限的划分。
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导入应用 - 医疗智能体 EIHealth
未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 从源项目lmx-project-01导入应用,并重命名应用。
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上传模板 - 医疗智能体 EIHealth
最小长度:1 最大长度:32768 表3 FormData参数 参数 是否必选 参数类型 描述 file 是 File 模板文件 响应参数 状态码: 201 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 模板id 请求示例 上传模板 https://eihealth.cn-north
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创建notebook - 医疗智能体 EIHealth
未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。
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镜像管理简介 - 医疗智能体 EIHealth
例如一个Docker镜像可以包含一个完整的Ubuntu操作系统环境,里面仅安装了用户需要的应用程序及其依赖文件。 EIHealth平台使用容器镜像服务(Software Repository for Container,简称SWR)进行简单易用、安全可靠的镜像管理。
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创建分子或分子复合物批量下载任务 - 医疗智能体 EIHealth
最小长度:1 最大长度:128 job_result_url 是 String 作业结果文件url。 最小长度:1 最大长度:2000 mode 是 String 下载类型:MOL(小分子)、COMPLEX(复合物)。
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创建自动作业 - 医疗智能体 EIHealth
IO加速:IO加速使用弹性文件服务(SFS)提供高性能的数据读写,作业运行时,会将非最终结果的数据存储在SFS中用以提高任务运行效率,作业执行完成后会清理释放SFS空间。对于涉及频繁读写场景的任务建议开启IO加速,开启前需要先购买性能加速。
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查询自动作业模板 - 医疗智能体 EIHealth
对于STRING类型,匹配字符串内容,比如后缀约束.fastq;对于ENUM类型,可以提示一定要在param_enum列表范围内取值;对于FILE类型,约束文件后缀类型;对于DIRECTORY类型,提示目录下需要包含哪些文件; 最小长度:0 最大长度:64 values Array