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在列表中查看当前集群挂载的弹性文件服务,选择待卸载的弹性文件服务,在操作列下单击“卸载”。 单击“确定”,卸载弹性文件服务 父主题: 共享存储
解决方案: 1.请检查集群中每个节点的配置文件/etc/dat.conf中"ofa-v2-cma-roe-enp177s0"是否放在首行且每个节点都一致。 2.若以上方法无法解决,请联系技术支持处理。 父主题: 常见问题
检查“/usr/local/.hpccluster/role/.ssh/”目录下的文件,确保该目录下“authorized_keys”该文件未被删除。 父主题: 常见问题
ssh/config文件中加入如下内容: StrictHostKeyChecking no 父主题: 实施步骤
购买SFS Turbo 1.在华为云控制台搜索“弹性文件服务 SFS”,并在弹性文件服务页面右上角选择“创建文件系统”。 图1 创建文件系统 2.在"创建文件系统"界面的"文件系统类型"选项中,根据业务需要,选择"HPC型"或"HPC缓存型"文件系统类型。
执行以下命令,安装需要的库文件。 # yum install glibc.i686 libgcc-4.8.5-11.el7.i686 增加执行权限,例如安装包所在路径为/root。
创建系统盘镜像 请使用镜像文件创建系统盘镜像,需注意镜像用途选择ECS系统盘镜像如图1,选择启动方式为UEFI图2,否则系统无法启动。
$ mpirun -np 2 -pernode --hostfile hostfile /home/rhel/hello 图3 集群上运行Spetrum MPI成功 hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下。
修改配置文件。 登录集群中任意一台BMS, 执行以下命令,添加hosts配置文件。
以两台BMS为例: $ mpirun -perhost 2 -np 12 -machinefile hostfile /home/rhel/hello 图3 BMS集群上运行Intel MPI成功 hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下
以两个BMS为例: $ mpirun -np 2 --pernode -hostfile hostfile /home/rhel/hello 图3 集群上运行社区OpenMPI成功 hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下
修改配置文件。 登录集群中任意一台BMS, 执行以下命令,添加hosts配置文件。
$ mpirun -np 12 -machinefile hostfile /home/rhel/hello 图3 BMS集群上Platform MPI运行成功 hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下。
hostlist host-192-168-0-27,host-192-168-0-75 /root/spe_hello 图1 在集群上通过Spectrum MPI运行可执行文件 hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下
修改配置文件。 登录集群中任意一台BMS, 执行以下命令,添加hosts配置文件。
以两台ECS为例: # mpirun -perhost 2 -np 12 -machinefile hostfile /root/platform_hello hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下。
则表示hostfile文件配置成功。
以两台ECS为例: # mpirun -perhost 2 -machinefile hostfile -np 12 /root/intel_hello hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下。
一站式HPC服务使用弹性文件服务SFS作为文件共享存储,更多关于弹性文件系统的信息,请参见《弹性文件服务用户指南》。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击管理控制台左上角的,选择区域和项目。 单击“部署HPC集群”。 系统进入部署HPC集群页面。 选择“区域”。
图1 修改Makefile文件01 图2 修改Makefile文件02 执行以下命令,编译lammps,并将当前目录生成的lmp_mpi文件拷贝至“/share”目录。 make mpi 步骤3 配置lammps 算例输入文件。 以melt为例,生成一个算例melt.in文件。