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应用配置文件说明 EIHealth中的每一个分析作业都依托于应用运行。应用是生物信息学软件和运行该软件所依赖的运行环境的镜像封装。 在EIHealth平台，创建应用的过程通过图形化的界面操作完成。在命令行工具中，该过程以配置文件的形式给出。您可以基于获取到的模板使用命令行工具创建
在账号中心左侧导航栏中有“我的主账号”页签，则说明是子账号；没有“我的主账号”页签，则说明是主账号。 图1 查看账号信息 联系技术支持开通白名单。 需要提供账号名，账号ID，项目ID等信息。相关信息获取方式如下： 使用华为云账号登录后，在右上角账号下选择“我的凭证”。 在API凭证中可以查看相关信息。
以“pbmc_res_vae.ipynb”为例，用户可以打开相应的代码集，直接运行该Notebook，也可以调整代码集中的代码，进行二次开发。 图2 基于Res-VAE和表达谱对单细胞数据降维 使用该Notebook时需要运行相应的代码模块，运行步骤如下所示。 环境配置：加载AutoGenome以及辅助绘图的软件包。
时中止，此时可以将项目暂时冻结，待下次重新启动时再激活。处于“冻结”状态的项目，用户无法进入该项目查看项目的开发环境、流程等历史运行情况，当前正在运行的分析作业会继续执行直到完成。冻结的项目可以通过“解冻”操作重新激活。 解冻：解冻项目。 转移：将项目转移给其他用户。“转移”只能
的操作列，单击“配额设置”。 图2 配额设置 在“配额设置”页面，开启“用户资源配额”开关，填写“最大作业运行数”、“最大CPU占用核数”、“最大内存占用”、“最大作业运行时间”、“最大创建项目数”。 图3 设置参数 填写完成后，单击“确定”。 父主题： 系统设置
设置数据库 设置完成后，单击“提交”，执行药物虚拟筛选任务。 对于“运行中”的任务，单击图标，允许取消、强制停止或删除。 对于“已取消”、“运行失败”的任务，单击图标，允许修改任务参数，再次提交任务。 图5 运行状态 查看执行结果 药物和蛋白结合能通过热点图呈现，并统计出结合能的
OBS终端节点名称，请在地区与终端节点中获取。 --obs-install-path -q 否 设置obsutil安装路径，默认安装在当前运行目录。 设置时，该路径必须为obsutil运行文件名，如/home/path/obsutil、/home/path/obsutil-1.1.1 --obs_down_load_url
靶点口袋发现 靶点口袋发现实现全新元动力学算法，高效遍历柔性蛋白表面，找到潜在口袋位置。 单击“靶点口袋发现”功能卡片，进入配置页面。 在配置页面，选择靶点文件、探针文件，配置相关参数信息。 靶点文件：支持PDB格式文件。 探针文件：探针分子建议原子数不超过400，分子量过大可以
开放API 优化 优化流程的搭建和运行过程。 商用 用户指南 命令行工具 API参考 2020年11月 序号 功能名称 功能描述 阶段 相关文档 1 平台界面风格更新，新增项目管理，预置流程，项目间资产共享，开发环境升级，应用、流程支持X86、ARM运行，新增消息中心 项目管理：以项
母、数字、下划线“_”、中划线“-”和空格，首位只能以数字或字母开头。 标签：设置任务标签。 单击“提交”。可在作业中心查看该作业的运行情况。 运行完成后，可在作业中心单击该作业查看输出结果。 单击按钮，可以收藏分子搜索结果，收藏后的结果可直接在收藏夹页查看。 图2 作业中心 图3
force 是 Boolean 是否强制终止,默认为false 缺省值：false 响应参数 无 请求示例 终止作业，启用强制终止模式，即运行中的步骤也会被终止。 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_
如何使用Notebook的Terminal功能 对于习惯编码的开发者可以使用Terminal功能进行开发、调试和运行分析任务。 在“Files”页签下，单击右上角“Open JupyterLab”，然后选择“Terminal”，进入Terminal界面。 图1 Terminal
取消：一个数据作业中，单个数据操作执行过程为原子性操作，即要么不执行，要么需要执行过程不能中断。在执行完成后，“取消”操作才能生效。 删除：运行中的任务不支持删除，只可删除运行结束的数据。 重试：可对执行失败的任务从失败位置进行重试。 图1 数据作业 复制数据 在“数据”页面，使用“复制”，将本项
靶点优化 靶点优化基于分子动力学模拟和结构聚类，实现靶点结构优化 单击“靶点优化”功能卡片，进入配置页面。 配置靶点文件和相关参数信息。 靶点文件：支持PDB格式文件，文件大小不能超过10M。若文件中含有多个受体，默认只处理第一个。 靶点预处理： 去配体：提交任务时系统会自动删除配体。
直接挂载OBS目录进行大规模计算，如何解决偶现报错 问题现象 运行作业时，作业直接挂载OBS目录进行大规模计算。偶现“异常应用”，并日志报错input/output error或file xxx not exists。 问题原因 OBS集群到计算集群之间的带宽达到了上限。 OBS集群的IOPS达到了上限。
项目简介 项目是EIHealth平台的一个工作空间，可以在项目中存储数据，上传镜像和创建分析作业。也可以将团队成员引入到项目中，并通过设置成员角色实现项目权限的划分。 项目管理是以项目为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组。以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。您可以创建项
下载数据操作会产生流量费用，计费方式为按需计费，计费详情请参考OBS数据下载费用。 以下操作步骤是在“数据”页面下载数据至本地。您也可以使用命令行工具实现数据的下载。 在EIHealth平台“项目 > 数据”页面，展开数据文件夹，选择待下载的数据。 单击“操作”列“下载”。 单击鼠标右键，选择“链接另存为”，下载数据。
新建作业 Nextflow作业依托于流程运行，需要您先新建流程，再基于流程创建作业。 选择“作业>分析作业>Nextflow”，单击“新建作业”。 设置作业参数。 作业名称：设置作业名称。名称长度为1-63，只允许出现中划线、字母和数字。 标签：设置作业标签。最多可以设置5个。 描述：作业描述。
基因组分析平台为您提供了多种分析流程，帮助您快速完成分析任务。 Notebook Notebook是一个交互式应用程序，提供开发调试、代码运行、文档编写和结果展示等功能。Notebook使您无需关心分析软件包的安装、升级和维护等工作，只需聚焦于科研工作，从而加快科研进展。 镜像
等待中：作业创建成功，等待处理中。等待中的作业支持取消。 运行中：作业创建成功，执行中。可单击作业名称，进入详情页查看运行详情。“运行中”的作业不允许取消。 成功：作业运行成功。可单击作业名称，进入详情页查看运行详情。 失败：作业运行失败。可单击作业名称，进入详情页查看运行失败原因。 取消中：对“等待中”的作业，执行“取消”操作，取消运行。
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