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目中的output文件夹,输出路径可设置为/output。不填写路径时,默认以“作业名-UUID”格式生成输出路径。 优先级:运行优先级,分为0~9级,优先级高的作业会被优先执行。默认值为0。 计算节点标签:作业会调度到含有相应标签的计算节点上。 当应用和作业都配置了标签,如果应
Health)平台支持用户设置节点自动扩缩容策略。 创建扩容策略 在平台右上角用户名中选择“系统资源>计算资源>节点伸缩策略”,单击“创建扩容策略”,或者在“节点”页面选择某个节点,单击操作列“更多>配置扩容策略”进入创建扩容策略页面。 在创建扩容策略页面配置相关信息。 表1 参数说明
不影响该用户操作其他服务。执行移除用户操作时,只有在该用户名下没有项目时,才可以被移除。在用户的操作列,单击“移除”,移除对应的用户。 图2 移除子用户 安全设置 在用户管理页面,可以重置用户的邮箱、手机号以及系统管理员权限的更改。在用户操作列,单击“编辑”,重置用户的相关信息。
盘古辅助制药平台以项目为粒度对数据、作业进行分组。以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。 添加项目成员 移除、修改项目成员 成员角色和权限 添加项目成员 前提条件 平台管理员首先通过“用户管理”功能添加平台用户,才能将该用户添加至项目中。 创建用户的详细方法请参见创建平台用户。 存在一个创建好的项目。
发环境和镜像进行分组。以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。 添加项目成员 移除、修改项目成员 成员角色和权限 添加项目成员 前提条件 平台管理员首先通过“用户管理”功能添加平台用户,才能将该用户添加至项目中。 创建用户的详细方法请参见创建平台用户。 存在一个创建好的项目。
计算资源 单击计算资源页面,列表中会显示已购买的计算资源,以及是否可用等信息,若新购买的账号则列表为空。 图1 计算资源 单击“购买计算资源”按钮购买计算资源。可以根据业务需要选择不同的资源类型,其中可用区可以选择任意可用区即可。并支持包年包月购买,或者按需购买。 图2 购买计算资源
在新建作业页面,填写作业信息。 基本信息:包含作业名称、标签、描述。 输出路径:存放输出结果的路径,格式以/开头。例如项目中的output文件夹,输出路径可设置为/output。 不填写路径时,默认以“作业名-UUID”格式生成输出路径。 优先级:运行优先级,分为0~9级,优先级高
重试”,根据提示对话框,选择“立即重试”或者“更改参数”。 如果选择“更改参数”,系统会跳转至作业参数配置页面,进行修改后,单击“重试作业”。 搜索 普通搜索 在作业管理页面,右上角搜索框中输入作业名称,单击按钮进行搜索。 图3 搜索作业 高级搜索 Nextflow作业支持根据流
通过以下多种方式将文件上传到OBS中,通过OBS与Notebook进行数据同步。 表1 上传数据方法 上传方法 说明 “数据”页面上传 通过“数据”页面上传数据,支持上传最大为1GB的单个文件。 使用命令行工具上传 命令行工具(eihealth-toolkit)配套EIHealt
com/eihealth/admet:2.0.0' } 暂不支持用户设置部分Nextflow配置项 对于dag, timeline, report,,trace配置,医疗智能体(EIHealth)平台会默认开启并且指定相关路径,会覆盖用户侧配置,可以在作业详情页面查询和下载相关信息。相关信息可参考https://www
删除对应的用户。 图1 删除子用户 移除子用户 导入的用户,不支持删除,只支持移除。移除后不影响该用户操作其他服务。执行移除用户操作时,只有在该用户名下没有项目时,才可以被移除。在用户的操作列,单击“移除”,移除对应的用户。 图2 移除子用户 安全设置 在用户管理页面,可以重置用
通过OBS与Notebook进行数据同步。 表1 上传数据方法 上传方法 说明 “数据”页面上传 通过“数据”页面上传数据,支持上传最大为1GB的单个文件。 数据上传方法请参见“数据”页面上传。 使用命令行工具上传 命令行工具(eihealth-toolkit)配套EIHeal
数。 图2 配置流程参数 参数配置完成后,单击“保存”。 流程创建成功后,单击“保存并启动作业”,或者在流程管理页面,单击流程列表操作列的“启动作业”进入作业设置页面,配置作业的相关信息,具体可参考新建作业。 父主题: Nextflow
查询实例详情 功能介绍 查询实例详情 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{
保留期与欠费 套餐包到期后,如果账号欠费,会根据“客户等级”和“订购方式”定义不同的保留期时长,保留期内您将不能进行资源访问,保留期内资源处理和费用详见“保留期”。保留期满仍未续订或充值,数据将被删除且无法恢复。 当平台处于冻结状态,且资源不再使用,您可以进入EIHealth控制
构建好流程后单击右上角图标保存,然后关闭当前页面。 步骤3:新建作业 单击作业页面的“新建作业”按钮,并选择需要运行的流程。这里作业名称可以用默认的名称,也可自己更改一个名称。同时,若想比较好的方式管理输出文件,也可以自行指定输出路径。 图6 新建作业 在作业页面添加好运行参数,添加方式与方式1相同。
描述 count Integer 实例总数 databases Array of DatabaseDto objects 实例详情列表 表4 DatabaseDto 参数 参数类型 描述 id String 实例id name String 实例名称 description String
获取子任务中实例的事件 功能介绍 获取子任务中实例的事件 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/jobs/{job_id}/tasks/{task_name}/instances/{instance_name}/events
进入EIHealth控制台,在页面左上角切换区域“华东-上海一”。 图1 切换区域 在API栏选择需要使用的服务,单击操作列的“开通服务”。 服务开通成功后,开通状态为“已开通”。 “开通服务”按钮置灰,说明您尚未认证,请先实名认证。 开通医学影像API 进入EIHealth控制台,在页面左上角切换区域“华南-广州”。
消。 删除单个作业 选择需要删除的作业,单击“操作”列“删除”即可。 图1 删除单个作业 批量删除作业 一次选中多个作业,单击“作业中心”页面上方的“删除”。 图2 批量删除作业 父主题: 作业管理