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水模型：水模型支持spc, spce, tip3p, tip4p, tip5p类型，默认是tip3p。 离子种类：支持NaCl、MgCl2、None几种类型。若平衡电荷设置为True，则不支持离子种类选择None。
--storage-type -s 否 归档的存储类型，支持STANDARD和COLD。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程。
--io-acc-tasks -s 否 设定任务的I/O加速类型 例如：`taskname1:EVS`;`taskname3:SFS` 不写的task默认不带加速类型 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同
表2 参数说明 应用名称 参数 名称 类型 说明 fastqc 输入参数 in-dir directory fastq目录，包含待分析的fastq格式的文件。 fastq-extend string fastq文件后缀<extend>，适配不同的后缀。
图1 上传和下载文件 OBS存储类型的Notebook 在创建Notebook时，如果“存储配置”选择的是“OBS”。Notebook列表的所有文件读写操作是基于所选择的OBS路径下的内容操作，即Notebook中的数据和OBS中的数据是同步的。
更改输入文本为字符串类型。 400 eihealth.03011002 Input key error. 更改关键字为“text”。 400 eihealth.03011003 Text length error. 输入文本长度需在1-256之间。
表2 参数说明 应用名称 参数 名称 类型 说明 fastp 输入参数 fastq-file1 file 二代测序fastq的Read1文件。 fastq-file2 file 二代测序fastq的Read2文件。
图1 上传和下载文件 OBS存储类型的Notebook Notebook列表中所有文件的读写操作是基于所选择的OBS路径下的内容操作，即Notebook中的数据和被挂载的OBS路径中的数据是同步的。
必填，支持Long，String，Double三种类型 nullable: false # 列是否允许为空，必填 unique: false # 列是否增加唯一约束，必填 primary
表2 参数说明 应用名称 参数 名称 类型 说明 ligand-smiles-to-3dsdf 输入参数 file-in file 存放配体SMILES列表的文件，第一列为SMILES，第二列为配体名称，以Tab分隔。
覆盖关系：作业->流程->应用 gpu_type: '' # gpu架构类型，取值范围 ' '|GPU|Snt9|D310。对于流程和作业，不填默认使用前一级的配置，填值会覆盖更新。
表1 流程输入、输出和依赖 类别 类型 说明 输入 Fastq 输入基于二代测序得到的原始Fastq文件，支持来源于多个barcode和路径的输入。 依赖 Reference Genome 输入的参考基因组序列，已经通过bwa构建了index。
新增的double类型数据，double的取值范围是-2^1024 ~ +2^1024，也即-1.79E+308 ~ +1.79E+308。超出精度返回会保留小数点后16位的精度。
cpu: 2C # 'CPU数量' memory: 4G # '内存大小' gpu_type: # 'GPU类型
覆盖关系：作业->流程->应用 gpu_type: '' # gpu架构类型，取值范围 ' '|GPU|Snt9|D310。对于流程和作业，不填默认使用前一级的配置，填值会覆盖更新。
--type -t 否 查询类型。 默认detail。 取值：logs、detail 。 logs：获取task日志。 detail：获取task详情，用于获取task列表。 --jobId -j 是 作业Id。
图7 NGS流程 单击图标，可设置数据来源，可以指定File或者Directory类型参数。这里我们将NA12878目录下的两个fastq文件分别指定成fastp-file1和fastp-file2。
在数据作业页面，支持通过作业类型、状态、创建时间、完成时间来进行搜索。 数据作业支持取消、删除、重试操作，三种操作均支持批量操作。 取消：一个数据作业中，单个数据操作执行过程为原子性操作，即要么不执行，要么需要执行过程不能中断。在执行完成后，“取消”操作才能生效。
类型：选择小分子化合物。 流程：选择从资产市场中订阅的“Docking Summary”流程。 配体分子：配体分子文件，支持SMILES、SD SDF、PDBQT格式。 受体蛋白：受体蛋白文件，支持PDB、PDBQT格式。 图3 选择配体分子和受体蛋白 设置数据库。
类型：选择小分子化合物。 流程：选择从资产市场中订阅的“Docking Summary”流程。 配体分子：配体分子文件，支持SMILES、3D SDF、PDB、MOL2格式。 受体蛋白：受体蛋白文件，支持PDB格式。 图2 选择配体分子和受体蛋白 设置数据库。
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